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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name HCR1
Promoter Sequence

No match found!
>HCR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AGTTTCAGTGGTTGGCTCCATGCAATTCAAGAAATTAATAATTAATTCCGATTCTTTAAT
TGGTGGAACATTAATATTATCAATGGTTATTAATTTATCACGAATCTTTAGTTCCTCTAA
TAATCTAACCAATGTATGGATAGTGAATGTTGACCTTCTAGGAATACGTAACAATTCGAC
ATCAGCCACGGACTGAAAACTCTGTTTGACATTACTGTTCACAATTGTACCTTGAGGAGT
CTGGGTGGATTCATTTCCACCACCCTCACCAGGGTTAAAGAACAATCCGATCCCACCCAA
CAAACTACGGTCTATGGTTAGATTAGGATGAAATGTTATACCATTATCGCCGATATAATA
GAGTAAATCACCATTGCGTTTAACACCAGGGATATGAAGTGTACGTGGAACTAATGGTTT
TGGGGGCATGATTCAGTTTTGACAACAAACAAGTAGAAAAACAAAAGCCACAAATATAAT
AAGTCCTACTGTCCGATGATAATGGATTAGGAATAGGGTAGATTCAGTGGTTGCAACACT
ATTTGTGGTAATAATAAGTATAGGTTTGAATGTAGGATAAATTAAAGGACAATGAAATGA
ACAGAGTGTCAGGAAAGAAAAAAAAAAATAAGGGATTCTTTATATACAATAAGGCTTGTA
GAACAAAATTGTGATCTCATGATTCACACCAAATTAATTAATTATAATATTAAAGTTTGA
AACAGAAGTGCACGCAGTTTTATTTTTGGGCACAAGTACACGAAAAGTCTAATCCCTTTA
TTCTGTTGTGACAATTAGACTGATTGACTGACAACTTGCAAAATTGAATGCGTATAGCGC
AGAAGTTAACCCAAAAAAAAAAAGAACGAGAAAGAGAACGGAAAAAAAATTTTCTTGATT
GAAGTATTGTCACATAGATAAATAGATAGATCTAAGAAACTACTACTTGTTACTACAATT
TAGTACCACCACCTTCATAACATATAACTGGCATTTCATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
GGTGGTGG: -27 -736
>HCR1	Upstream Sequence Complementary Strand
TCAAAGTCACCAACCGAGGTACGTTAAGTTCTTTAATTATTAATTAAGGCTAAGAAATTA
ACCACCTTGTAATTATAATAGTTACCAATAATTAAATAGTGCTTAGAAATCAAGGAGATT
ATTAGATTGGTTACATACCTATCACTTACAACTGGAAGATCCTTATGCATTGTTAAGCTG
TAGTCGGTGCCTGACTTTTGAGACAAACTGTAATGACAAGTGTTAACATGGAACTCCTCA
GACCCACCTAAGTAAAGGTGGTGGGAGTGGTCCCAATTTCTTGTTAGGCTAGGGTGGGTT
GTTTGATGCCAGATACCAATCTAATCCTACTTTACAATATGGTAATAGCGGCTATATTAT
CTCATTTAGTGGTAACGCAAATTGTGGTCCCTATACTTCACATGCACCTTGATTACCAAA
ACCCCCGTACTAAGTCAAAACTGTTGTTTGTTCATCTTTTTGTTTTCGGTGTTTATATTA
TTCAGGATGACAGGCTACTATTACCTAATCCTTATCCCATCTAAGTCACCAACGTTGTGA
TAAACACCATTATTATTCATATCCAAACTTACATCCTATTTAATTTCCTGTTACTTTACT
TGTCTCACAGTCCTTTCTTTTTTTTTTTATTCCCTAAGAAATATATGTTATTCCGAACAT
CTTGTTTTAACACTAGAGTACTAAGTGTGGTTTAATTAATTAATATTATAATTTCAAACT
TTGTCTTCACGTGCGTCAAAATAAAAACCCGTGTTCATGTGCTTTTCAGATTAGGGAAAT
AAGACAACACTGTTAATCTGACTAACTGACTGTTGAACGTTTTAACTTACGCATATCGCG
TCTTCAATTGGGTTTTTTTTTTTCTTGCTCTTTCTCTTGCCTTTTTTTTAAAAGAACTAA
CTTCATAACAGTGTATCTATTTATCTATCTAGATTCTTTGATGATGAACAATGATGTTAA
ATCATGGTGGTGGAAGTATTGTATATTGACCGTAAAGTAT
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