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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C1_13210C_A
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -224
>C1_13210C_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TGGATATAAAAATCATCATTTTCATTTCAATGTTTTCATGTGGGATTTATTTCAATGTGT
ATGGGTTTCATTTTTATGTATTGTTCAAACATTTCAAATTCTTAAAGGATTAACAACATG
GGAATTTAGTTCATTAAATAAACAATTACAAACTAATCGATTCAATCATTCTACTGTTCC
TAGAGATTTTGAAGCTGGTGAAGGGATTTCATTAGATCAAACCCAACCTTCAGATGGTCA
ACATAGACATAATCATAATGAATTTCAAACGTGTATGAATTTATTAGGTATTGATCAATT
CATATTGACTTTGAAAATGAGTTTAAAATCACTTTTTTCTAATACTCGTCATGGCAATAA
CAATACTAATTATGATCCATTAACTTCATTACATATCCCCACTGATCATGGAATTAAACA
AAATTGGTTAGATTTTTGGATTATTGGTGAAGAGAAATGGAGAAATGTATTTTATTTACC
TATTGATGGCGAAAATAATTTAAATGGGAAAGTGGTAGATTATTATACATTATATAGTTA
CCATTGATTGTATGTACATATATACATATACATATGACATATACCAAAGCTATTATTCTA
AAACCTTTGTATTCATTGTAAAATACTTGTAGTAGATTGTTTCTTATTTTTCAAAATATG
CTATCAAAATTTGTTTATCTGGAATTGACAAAATCAAACCTTGACAACAGTAATTTAAAA
AAAAAAAAATTATAAATTAACTGTATCTTTGTATTATTTGGTCGACCCACAACAATAGGT
AA
TGAATCTATAAGTCACAAAACAATAAACCAAGAAGTTAGACATCCATACTTTTGGCAA
TTGTTTGTAACTTGTCAGACAGCCGCTTATACCCACCCAATTCAAAATCCTCCTAGAAGG
CACAATGAAAAGGGTAAAGATCATCGCTCCTTTAKAAATATTGCATTACCTTCAAAAAAG
AAAGGCTAGCAAAAAGTTAAAGGCAAAACATTATAAGTAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
MGGTAM: -49 -519
>C1_13210C_A	Upstream Sequence Complementary Strand
ACCTATATTTTTAGTAGTAAAAGTAAAGTTACAAAAGTACACCCTAAATAAAGTTACACA
TACCCAAAGTAAAAATACATAACAAGTTTGTAAAGTTTAAGAATTTCCTAATTGTTGTAC
CCTTAAATCAAGTAATTTATTTGTTAATGTTTGATTAGCTAAGTTAGTAAGATGACAAGG
ATCTCTAAAACTTCGACCACTTCCCTAAAGTAATCTAGTTTGGGTTGGAAGTCTACCAGT
TGTATCTGTATTAGTATTACTTAAAGTTTGCACATACTTAAATAATCCATAACTAGTTAA
GTATAACTGAAACTTTTACTCAAATTTTAGTGAAAAAAGATTATGAGCAGTACCGTTATT
GTTATGATTAATACTAGGTAATTGAAGTAATGTATAGGGGTGACTAGTACCTTAATTTGT
TTTAACCAATCTAAAAACCTAATAACCACTTCTCTTTACCTCTTTACATAAAATAAATGG
A
TAACTACCGCTTTTATTAAATTTACCCTTTCACCATCTAATAATATGTAATATATCAAT
GGTAACTAACATACATGTATATATGTATATGTATACTGTATATGGTTTCGATAATAAGAT
TTTGGAAACATAAGTAACATTTTATGAACATCATCTAACAAAGAATAAAAAGTTTTATAC
GATAGTTTTAAACAAATAGACCTTAACTGTTTTAGTTTGGAACTGTTGTCATTAAATTTT
TTTTTTTTTAATATTTAATTGACATAGAAACATAATAAACCAGCTGGGTGTTGTTATCCA
TTACTTAGATATTCAGTGTTTTGTTATTTGGTTCTTCAATCTGTAGGTATGAAAACCGTT
AACAAACATTGAACAGTCTGTCGGCGAATATGGGTGGGTTAAGTTTTAGGAGGATCTTCC
GTGTTACTTTTCCCATTTCTAGTAGCGAGGAAATMTTTATAACGTAATGGAAGTTTTTTC
TTTCCGATCGTTTTTCAATTTCCGTTTTGTAATATTCATC
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