PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C1_13380W_B
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -285 -284 -283 -282 -281 -280 -279 -278 -277 -276 -275 -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267 -266 -265 -264 -263 -262 -261 -260 -259 -258 -257 -136 -135 -134 -133 
>C1_13380W_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACAATTAGATGATAATAATAATCCGGAATCTTATTCATTATTATCATCAATTAGAATTTC
TCAACAAAGAACTCAAGAAGCAATTGAAGCATTATTAAAATCTTGGGAATTATTTAAATT
GAAAAAATCTAAATTAGAAGAAATGGCTAACAATGCTAAAACTGATCAACAACAAGAAGC
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTAGTGGTAATTCTGGTGATTCATTTGAAATTGG
TATGGAATATGTTGATTTGATTCAACCATTAATTACATTATCAAGATATGCTATTGAATT
AGAACAATATGATATAGCTATACAAATCAGTAATAATGTTCAAGATATTAATGAAAATAT
ATTGGATAGTTATTATATTGAAAGTTTGGCCAATATTTTAAAATTGAAAAAAATTTTATA
TCCAAATGACCAAAATTATAAAGATATTGAATTATCAGAAATTTTGAATCAAGTCAATGG
TGATAATGATGAAATTAATTCAATTTTACAAGATGTTAAACTTAGTTTAACTATGGCTTA
TAAAATCATTAATAGTGATATTGGTGAAGAATTCGATCATGGATTAATTGAACAAATTAA
TCAATTATTACAAGAATTTGGTGGTCCTATAATGAGTGAATTAATGCCTCAAAGAAGACG
TGGTAATGATGATGATGATGATGATGAAATAGAAGGTTGGGAAGATGAAATTGTTCNNNN/>Nn>Nn>Nn>NNspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NTTCTTGTTATTTATATATATATATATATATA
TTTCATTAATATCCTTATTATAGACATATGGAAAATTTTAATTTAAATCTAATTGATTTA
GCAACATCTCGTAGGAGTAGAATGCNNNNNspan>Nspan>Nspan>NGCATTGAAAAAGTTGATCAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAGAAATTGGAAGTATTTGGAATACTTTATTTAACAACAACTACAACAAT
TAATCAAACTCATACTTTCCACATTACACCATAACATACA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
MGGTAM: -126 -127 -128 -129 -250 -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -263 -264 -265 -266 -267 -268 -269 -270 -271 -272 -273 -274 -275 -276 -277 -278 
>C1_13380W_B	Upstream Sequence Complementary Strand
TGTTAATCTACTATTATTATTAGGCCTTAGAATAAGTAATAATAGTAGTTAATCTTAAAG
AGTTGTTTCTTGAGTTCTTCGTTAACTTCGTAATAATTTTAGAACCCTTAATAAATTTAA
CTTTTTTAGATTTAATCTTCTTTACCGATTGTTACGATTTTGACTAGTTGTTGTTCTTCG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACAATCACCATTAAGACCACTAAGTAAACTTTAACC
ATACCTTATACAACTAAACTAAGTTGGTAATTAATGTAATAGTTCTATACGATAACTTAA
TCTTGTTATACTATATCGATATGTTTAGTCATTATTACAAGTTCTATAATTACTTTTATA
TAACCTATCAATAATATAACTTTCAAACCGGTTATAAAATTTTAACTTTTTTTAAAATAT
AGGTTTACTGGTTTTAATATTTCTATAACTTAATAGTCTTTAAAACTTAGTTCAGTTACC
ACTATTACTACTTTAATTAAGTTAAAATGTTCTACAATTTGAATCAAATTGATACCGAAT
ATTTTAGTAATTATCACTATAACCACTTCTTAAGCTAGTACCTAATTAACTTGTTTAATT
AGTTAATAATGTTCTTAAACCACCAGGATATTACTCACTTAATTACGGAGTTTCTTCTGC
ACCATTACTACTACTACTACTACTACTTTATCTTCCAACCCTTCTACTTTAACAAGNNNN
>NNn>Nn>NNspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>AAGAACAATAAATATATATATATATATATAT
AAAGTAATTATAGGAATAATATCTGTATACCTTTTAAAATTAAATTTAGATTAACTAAAT
CGTTGTAGAGCATCCTCATCTTACGNNNNNNspan>Nspan>Nspan>CGTAACTTTTTCAACTAGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTCTTTAACCTTCATAAACCTTATGAAATAAATTGTTGTTGATGTTGTTA
ATTAGTTTGAGTATGAAAGGTGTAATGTGGTATTGTATGT
w3c xhtml validator w3c css validator