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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CHS5
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -200
>CHS5    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CTCAGATTAGCTAATGCTAACTTGATGTATAAATTAAAATGTGTCGATAAAGAGACCATT
GCTACTAGAACTTCAATACACCAGAACTTCTTAAGGAATTTGATGGATACAAAGAATGGA
ATGATAACTGATACGACATCATTATGGTATAAAATCAATAAAGAAAGGAACCAATTAGAT
CAGTTAGTTCCCGATTTCACATTTGCAGCTATTCCTTCGATACCTAATGGTTCTATACTG
ATAGAAGAATCCATAGTGAATGGAAACATTGATGGTTTGGCAGAACTGTCAGTCTCCAAG
AAATTGCAGAAACAAAATACGCTAATAGAGTTGGTAAAACAACGTAACAATATCAACGAA
CAATTGGGAATATTGAATGGTCTAGTAGAATTTCATGGATTTCCTAGTGCCATTTCTTCT
TCTTTAAGTGAGGAAATCCTGGATGATCAATCAAATGAGTTATTATTAAAGAAAGCCACT
GATGAAGAAATCAATAGCGATTTGCGTGCCATGGGTATTTCCATATAGAATATGTTTTTA
TGTCATTTCCACTCATCGAACTTTGCATACATTAAATTCTTTTGTATAGTATTTGTCACC
AATGTAACTTTTACACTATAGTATACAATTACTGTAAGCGTTCCATTCTATTACGAATCA
GATTTATTAAAGATGAGATAACTATTTTCCCACCAATAAATAACAATTGAATACCCTCAA
CTCTATTTGTTTTGTGAATATTTTACTCGCCATTAAACATGGTAAACGTGTTGTATGGCA
AGAGATACCCCATGATGATACGGTAAGTCTTTATCCAAACGATTATGGTTTTTTGATTAT
TATCGCACGACTTTGTTTGCTGTTCGTTAAGTGTTCAAAAACAAACAAGACAACCAAAAA
AAGAGAGAGAGATTTTCTGATTTAATCAACAAAAAGTGAAATACCTGGAGTCAAATCAAC
CTTATAAGTCTACTTAATTTTCATATTTAATAACAATTCA
Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!
>CHS5	Upstream Sequence Complementary Strand
GAGTCTAATCGATTACGATTGAACTACATATTTAATTTTACACAGCTATTTCTCTGGTAA
CGATGATCTTGAAGTTATGTGGTCTTGAAGAATTCCTTAAACTACCTATGTTTCTTACCT
TACTATTGACTATGCTGTAGTAATACCATATTTTAGTTATTTCTTTCCTTGGTTAATCTA
GTCAATCAAGGGCTAAAGTGTAAACGTCGATAAGGAAGCTATGGATTACCAAGATATGAC
TATCTTCTTAGGTATCACTTACCTTTGTAACTACCAAACCGTCTTGACAGTCAGAGGTTC
TTTAACGTCTTTGTTTTATGCGATTATCTCAACCATTTTGTTGCATTGTTATAGTTGCTT
GTTAACCCTTATAACTTACCAGATCATCTTAAAGTACCTAAAGGATCACGGTAAAGAAGA
AGAAATTCACTCCTTTAGGACCTACTAGTTAGTTTACTCAATAATAATTTCTTTCGGTGA
CTACTTCTTTAGTTATCGCTAAACGCACGGTACCCATAAAGGTATATCTTATACAAAAAT
ACAGTAAAGGTGAGTAGCTTGAAACGTATGTAATTTAAGAAAACATATCATAAACAGTGG
TTACATTGAAAATGTGATATCATATGTTAATGACATTCGCAAGGTAAGATAATGCTTAGT
CTAAATAATTTCTACTCTATTGATAAAAGGGTGGTTATTTATTGTTAACTTATGGGAGTT
GAGATAAACAAAACACTTATAAAATGAGCGGTAATTTGTACCATTTGCACAACATACCGT
TCTCTATGGGGTACTACTATGCCATTCAGAAATAGGTTTGCTAATACCAAAAAACTAATA
ATAGCGTGCTGAAACAAACGACAAGCAATTCACAAGTTTTTGTTTGTTCTGTTGGTTTTT
TTCTCTCTCTCTAAAAGACTAAATTAGTTGTTTTTCACTTTATGGACCTCAGTTTAGTTG
GAATATTCAGATGAATTAAAAGTATAAATTATTGTTAAGT
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