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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CTR1
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -410
>CTR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CAAAGCGATGTGTAATCACAAAACACAAAATTTCAATCGACCTTATGACTACAAAAAGCA
TTTATTACATCTGCATTTCGTATTTGATGACCCAAAGGGGAAAGCTGCAAATACATTGAC
TGACAAATTACCTATTATGGGATCATGTGAAGCATGTGGTGCTCGTATGATTGCCAATGA
TTGGTTGGAATCACATATTTTAACAAAAAACCCAAAACTCAAATGTCCCTACAGTAAACA
AGGCTAATTAATACTTTTCCTGTTCCTTTTTTTTTCACCATAAGTTGCATTTCGTTTAGG
AATAATACTTATTAATACTTATTGTTAGTATTATTGTTAAACACTAGAGTTGCTATATAG
ATTTGTTTTGTTATAGATAACGTTATTTACACATTTAATGAATTAGTTTTTAGATATCAA
TTGAGAAACATGCTCTGGTCTCTTTGTAGGGTGTTGTAAATTAAACAACAGTCATATTTT
TTAGGAAATTAAAAACATTCTCACCTAAGATGCAAATGTTTTTTTTTTCGGGCTCGGCAT
TCTCACCTCATCTTTACTTTTCAATTATTTTGGTGCGTTTTGATCTATTTAGGTAATTGA
AAATTTGCTCATTCTCATCAATCTCTTACCAATCCAACCAAGAAACCACAAACACAATTA
AAATAAAAAATGAACACTATAGATCTATTAATTATGACTAAGTCCTAATAATTAAATCTC
AAGTATGAGCAAATATTCTTTGACCCTTTAAATACCTTTTTATTTTGCTCATATTTTTCT
TTCTTTCTTTCCTTTTTTCTTGAATTCAAACCCCATATTCATTCATTTAACATTCGTTTC
TTTGGCCTTGCCTAATCAGCTCATTCATAAACTATTTAAACTCGAGTTTATTTCTTGTTC
TTGGAAATTCCTTATTTTAATTTAAGTTACATATTATCAACACCACTAATTAGATATATT
TTCTTCATTTATCAGTCAACACCACATTTAACCTTACATT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
MGGTAM: -867
>CTR1	Upstream Sequence Complementary Strand
GTTTCGCTACACATTAGTGTTTTGTGTTTTAAAGTTAGCTGGAATACTGATGTTTTTCGT
AAATAATGTAGACGTAAAGCATAAACTACTGGGTTTCCCCTTTCGACGTTTATGTAACTG
ACTGTTTAATGGATAATACCCTAGTACACTTCGTACACCACGAGCATACTAACGGTTACT
AACCAACCTTAGTGTATAAAATTGTTTTTTGGGTTTTGAGTTTACAGGGATGTCATTTGT
TCCGATTAATTATGAAAAGGACAAGGAAAAAAAAAGTGGTATTCAACGTAAAGCAAATCC
TTATTATGAATAATTATGAATAACAATCATAATAACAATTTGTGATCTCAACGATATATC
TAAACAAAACAATATCTATTGCAATAAATGTGTAAATTACTTAATCAAAAATCTATAGTT
AACTCTTTGTACGAGACCAGAGAAACATCCCACAACATTTAATTTGTTGTCAGTATAAAA
AATCCTTTAATTTTTGTAAGAGTGGATTCTACGTTTACAAAAAAAAAAGCCCGAGCCGTA
AGAGTGGAGTAGAAATGAAAAGTTAATAAAACCACGCAAAACTAGATAAATCCATTAACT
TTTAAACGAGTAAGAGTAGTTAGAGAATGGTTAGGTTGGTTCTTTGGTGTTTGTGTTAAT
TTTATTTTTTACTTGTGATATCTAGATAATTAATACTGATTCAGGATTATTAATTTAGAG
TTCATACTCGTTTATAAGAAACTGGGAAATTTATGGAAAAATAAAACGAGTATAAAAAGA
AAGAAAGAAAGGAAAAAAGAACTTAAGTTTGGGGTATAAGTAAGTAAATTGTAAGCAAAG
AAACCGGAACGGATTAGTCGAGTAAGTATTTGATAAATTTGAGCTCAAATAAAGAACAAG
AACCTTTAAGGAATAAAATTAAATTCAATGTATAATAGTTGTGGTGATTAATCTATATAA
AAGAAGTAAATAGTCAGTTGTGGTGTAAATTGGAATGTAA
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