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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name PDS5
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -544
>PDS5    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TGTTCTTTGATATGTTGCCTTGTATACGTCATCAGCTTTGAAATGAACTGGTGGCACACC
TCCTGTAATAATAACTTCACTAATGGATTCTGGGAACAAAGACAAATAAGTGAAACAGCA
AAATCCACCATATGATTGACCCATTATTGACCATTTGTGATGATTCCCAATTAAATCTTT
TCTAATTTGTTCCAAATCACGAATAATCGAGTCAGCACGGAAGTTTAAAATAAACTTCAA
CTGCGAATCCACTTCAAAATTCCCGTACTCTTTCAAAACCAAATTTTTAAATGTTTTGAC
TTCCAAAGGAGTACTTAAACCAGTGCCTCGTTGATCTAGATAAACAATTTGGTATCCTTT
CTCCAATAGAACTTTGGTTTTCCCCAGATTAGAAGTAGGAACTGGACATGGAAACCCAGG
CCCTCCCTGTAAATATACAATTATCTTTGGTTTTTCAGGTAATAACACTTTTTCAAATCC
CTCTTTGTCATTATGCAAATTCTTATCATATTTAGAAGTAATGGTAATAGCTACCTTAAT
AGTGGAGGAAGATTGAGAATCAGTGTAATTTAAAGGCAAATCATACACAATTCTTTGATT
TACAATATCTTTCAATCTAAAATAGTCAATAATTTTACTTGTAGCCATGATAGTCAATTG
ACAAGTTTGGTGGTGTAAGTTTAACAATAGTGTGAGCGTATGTCTGTGGCTTGTTTGACG
ACAACTGATTTTAGTGTTAATTTTTTTTTTCGGTTGAATTACATTCGGGTGTGAAAAAAA
AAAAKTCCCCTCGAACGATATAAATTCGTCTTTGACACGACCACACGCAACGCGTAAAAA
AAAAAATTCAGAATGATTTTATTTGTTTATAATAACTCTCTTTTATTTTTGGTTATTTTT
CTTATTTTTTTGTTGTTTTAATTATTGTTGTTCCTTTCTGAATCTTACTCAACTCCGTTA
GTTCATTTTGTATCTTGATTAACAAAGGGTGATAAATTTA
Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!
>PDS5	Upstream Sequence Complementary Strand
ACAAGAAACTATACAACGGAACATATGCAGTAGTCGAAACTTTACTTGACCACCGTGTGG
AGGACATTATTATTGAAGTGATTACCTAAGACCCTTGTTTCTGTTTATTCACTTTGTCGT
TTTAGGTGGTATACTAACTGGGTAATAACTGGTAAACACTACTAAGGGTTAATTTAGAAA
AGATTAAACAAGGTTTAGTGCTTATTAGCTCAGTCGTGCCTTCAAATTTTATTTGAAGTT
GACGCTTAGGTGAAGTTTTAAGGGCATGAGAAAGTTTTGGTTTAAAAATTTACAAAACTG
AAGGTTTCCTCATGAATTTGGTCACGGAGCAACTAGATCTATTTGTTAAACCATAGGAAA
GAGGTTATCTTGAAACCAAAAGGGGTCTAATCTTCATCCTTGACCTGTACCTTTGGGTCC
GGGAGGGACATTTATATGTTAATAGAAACCAAAAAGTCCATTATTGTGAAAAAGTTTAGG
GAGAAACAGTAATACGTTTAAGAATAGTATAAATCTTCATTACCATTATCGATGGAATTA
TCACCTCCTTCTAACTCTTAGTCACATTAAATTTCCGTTTAGTATGTGTTAAGAAACTAA
ATGTTATAGAAAGTTAGATTTTATCAGTTATTAAAATGAACATCGGTACTATCAGTTAAC
TGTTCAAACCACCACATTCAAATTGTTATCACACTCGCATACAGACACCGAACAAACTGC
TGTTGACTAAAATCACAATTAAAAAAAAAAGCCAACTTAATGTAAGCCCACACTTTTTTT
TTTTMAGGGGAGCTTGCTATATTTAAGCAGAAACTGTGCTGGTGTGCGTTGCGCATTTTT
TTTTTTAAGTCTTACTAAAATAAACAAATATTATTGAGAGAAAATAAAAACCAATAAAAA
GAATAAAAAAACAACAAAATTAATAACAACAAGGAAAGACTTAGAATGAGTTGAGGCAAT
CAAGTAAAACATAGAACTAATTGTTTCCCACTATTTAAAT
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