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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name RRP42
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -329
>RRP42    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATTTTTATTCTTAGAATTGAGTTTATTATTATGATTGTTGTTATTAGTGGTGCCTAGT
TGGAAACTTTGTTTCTTTTTAGGAACTAAATGATTAGGTATTGTTCTCTTTTTCTGATTT
TGTAACCAAAGAGGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATAGTATTGTTGTGTATTAAAT
AGCTGTGGTTGTTGTTGCTGAATTTGTTGGGTTTGCTGTTGCTGTGGTTGTTGCGGTTGT
TGCGGTTGTTGATTTTGTTGATTCTGTTGTTGTTGCTGTTGTTGCTGTTGTATAGATGCT
GAATTGAATGAGGTATTAAACAAACTAGGTTGAGTCAGTTGCTGACCTCCAAATAATGTA
GACATTTTCTAGTAGTTAAAGAGTTGAACTGAATGAATTGAATGAATTCTATTGAGGTGA
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TAGTTTAGTTTAGGTAACTTTTTTGGGTGTATTTTGAAATTGATGTAAAAATAAACAGAA
GAATTACAAAGATATCAATACTGGTATGTAACCATCTTATTAAAGAGTTGATAGTATAAA
AAAAGTATAGGACTGTTAATTCATTCAATGGGTCTTAAATTGTCTAACTTCTTAGTGTAT
CTAATCTTCTTCATCATCAGTCTTTGATGGTGATGATAGAATTAATCAATCAAAGTCTTC
TTGCGGAAAAATGAGTTGAAAAAAAAAAGCGATGGGATTCAATTACATCAAACTTACTTA
TAGACATCTCCTCCTACCCCCCACCGTATACACCTATACT
Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!
>RRP42	Upstream Sequence Complementary Strand
AATAAAAATAAGAATCTTAACTCAAATAATAATACTAACAACAATAATCACCACGGATCA
ACCTTTGAAACAAAGAAAAATCCTTGATTTACTAATCCATAACAAGAGAAAAAGACTAAA
ACATTGGTTTCTCCAACAACAACAACAACAACAACAACTATCATAACAACACATAATTTA
TCGACACCAACAACAACGACTTAAACAACCCAAACGACAACGACACCAACAACGCCAACA
ACGCCAACAACTAAAACAACTAAGACAACAACAACGACAACAACGACAACATATCTACGA
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CTGTAAAAGATCATCAATTTCTCAACTTGACTTACTTAACTTACTTAAGATAACTCCACT
ACTTATTTCTAACTAACTAGTTCGGTTAAAAACAACAAAACTGAAAAAGGAACTTAACTT
TAAGAAACGTTACTCTTCTTTTTAAATACTGACCTGTTTAATGGGCCGGTATTATTCAAT
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ATCAAATCAAATCCATTGAAAAAACCCACATAAAACTTTAACTACATTTTTATTTGTCTT
CTTAATGTTTCTATAGTTATGACCATACATTGGTAGAATAATTTCTCAACTATCATATTT
TTTTCATATCCTGACAATTAAGTAAGTTACCCAGAATTTAACAGATTGAAGAATCACATA
GATTAGAAGAAGTAGTAGTCAGAAACTACCACTACTATCTTAATTAGTTAGTTTCAGAAG
AACGCCTTTTTACTCAACTTTTTTTTTTCGCTACCCTAAGTTAATGTAGTTTGAATGAAT
ATCTGTAGAGGAGGATGGGGGGTGGCATATGTGGATATGA
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