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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SRR1
Promoter Sequence

No match found!
>SRR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCGCGAAAGTTCACAGTTATTGTGATTTGGTTACTGTGTAAAGTCAAAATAACTTGAACT
GGATTGCTTAGAATGAGTATTTTCTTACAATAACCATAGAGTAACAGAATATGATTGCCA
TGAAATGGTATTGGCGGTTATTATTCTGTTTGTAGATGGTAGCAAATTTGAATAAAAGAA
AAATTAATTAGTGAACTTAGATGGAAGTAACTCGGGTAAATTCTTTCCTTTTCTTTCTTT
TTCCTCCCCCTCCCGCCTGGCTGCCTTGATTCCCCCTCTCTCGTTCTTCCGTTTGAGTAA
TGAGAGAAAAAAAATAAAATAAAAAAATTTTCTTAATTTAATTTGTTATTGTTGTTTTGT
TTTTGTTCTACTCAAATTTAACAATAGCAAATTAAACAAAATGTATCACAAAGTTGATTT
TACCAATCCTGCATTGTTGTAAGTTTGTTTTGTGTACTGTTTGAATTTTTTTTTTGTAAA
GGCGGACAATTGAAACAACCTGCCTGCCTCAAACTAATATTCCTACATTCAATTAATTAA
TAATATATATTCAACAACATTCCTCCTTGTTTTTTGCAAATTGCAAGGGTCTTTGAATTA
TATATAACTATATTCTTTTCTTGAAGTTTCAATTTTTAATTGTTATTATTATTGTTTCCT
TTATATTTATTAGGAAAGGAATAACAAATAATCAAATCATTGGGTTCAGAATCGTTTTTT
TTTTTTGATTTTCATACCCCTATAGTTTTATTCAAACGCAATCTCAGAACTTCACCCTAT
TATCAATTGATCAGATTACTTTTCCATCAATCGGTATATAATTTGGAAGATCAAGGAATA
CATCAATCAATTCATTACCTCAAATAATACCATTCCTTTTTTAGTTTCCTCACAAAAGAA
AAATTGCCTCCCCCTGTTGCAAGTAATTTTTCCTCCTTTTTTTTTTATTTGTATATTTTT
ACAACCAATAAGTTATTATTGAATTCATTGTACACACTAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
MGGTAM: -140
>SRR1	Upstream Sequence Complementary Strand
AGCGCTTTCAAGTGTCAATAACACTAAACCAATGACACATTTCAGTTTTATTGAACTTGA
CCTAACGAATCTTACTCATAAAAGAATGTTATTGGTATCTCATTGTCTTATACTAACGGT
ACTTTACCATAACCGCCAATAATAAGACAAACATCTACCATCGTTTAAACTTATTTTCTT
TTTAATTAATCACTTGAATCTACCTTCATTGAGCCCATTTAAGAAAGGAAAAGAAAGAAA
AAGGAGGGGGAGGGCGGACCGACGGAACTAAGGGGGAGAGAGCAAGAAGGCAAACTCATT
ACTCTCTTTTTTTTATTTTATTTTTTTAAAAGAATTAAATTAAACAATAACAACAAAACA
AAAACAAGATGAGTTTAAATTGTTATCGTTTAATTTGTTTTACATAGTGTTTCAACTAAA
ATGGTTAGGACGTAACAACATTCAAACAAAACACATGACAAACTTAAAAAAAAAACATTT
CCGCCTGTTAACTTTGTTGGACGGACGGAGTTTGATTATAAGGATGTAAGTTAATTAATT
ATTATATATAAGTTGTTGTAAGGAGGAACAAAAAACGTTTAACGTTCCCAGAAACTTAAT
ATATATTGATATAAGAAAAGAACTTCAAAGTTAAAAATTAACAATAATAATAACAAAGGA
AATATAAATAATCCTTTCCTTATTGTTTATTAGTTTAGTAACCCAAGTCTTAGCAAAAAA
AAAAAACTAAAAGTATGGGGATATCAAAATAAGTTTGCGTTAGAGTCTTGAAGTGGGATA
ATAGTTAACTAGTCTAATGAAAAGGTAGTTAGCCATATATTAAACCTTCTAGTTCCTTAT
GTAGTTAGTTAAGTAATGGAGTTTATTATGGTAAGGAAAAAATCAAAGGAGTGTTTTCTT
TTTAACGGAGGGGGACAACGTTCATTAAAAAGGAGGAAAAAAAAAATAAACATATAAAAA
TGTTGGTTATTCAATAATAACTTAAGTAACATGTGTGATT
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