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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name VAN1
Promoter Sequence

Consensus
MGGTAM: -648
>VAN1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TGCATGATAAAGATGGTATTTCGGCTGCTACAATATTTTTGCAATTGTATCAGAAATGGT
TTAGTGGTGGCAAAATAGATGTTACAGATAAATTAGAAGCTGGGTATGCTAAGTATGGTT
GGTTTAAAGATTACAATGGTTATTACAGACTAGCAGACATGTCAACATTAGATAAAATAT
TTACCAACATCAGAGGCTCCTTTGATAGTAAATCCCCAGAAAATATTGGCGAATTCAAAG
TAACTAGTTGGCGTGATTTAACAATTGGATACGACTCGTCTACTGTCGATCACACTCCCG
TTTTACCTGTTGATTCAAGTTCACAAATGATAACAGCCCTGTTGAAGTTACCAGGTAATG
ACAATGCAGTTGTAAGATTTACTTGCAGAGGGTCTGGTACCGAGCCAAAGTTAAAATTGT
ATATTGAAGGGAAATCTACTATCAATGAACAGAGTGCTAAAGAAATTGCTGTTAAATGTT
GGGAGACCTTAAAACAAGAATGGTTTCAACCGGAGAAATATAATTTGACAGAAGTTAAAC
CGTAAATAGTGTCGATCGCGTTTCTATAGATAAAAAATAGTTTTTAAAGTCGGAATTATA
AAACATTGGAGAAGAGTAAAACGAGGGAATTGTCGATCCCACGAATATGGCGAGCAAGGC
GGCCACAGAAACCCAAAAGAAAATGCTATTTTCGGTGTGGAGGGTGCGACGAAAGAATGA
AAAAAAAGACAAAAAAAAAATTTCTCTGTCAGTCTGTCAGAGTTATTTTTATTACTTTAA
AAGAAAGGGAACAATACAAAAAAAGGAAAAAAGAAAATTTTAAATAATCACAGCAAACAG
AGACAAAAACAAGAAGAAGGGAAAAAAAAATTACTTTTCTCGATACCACTTTCAACTATC
AAATTGTTTTTACAGCATTTTCAAAAAAAATAACTACCTCTAAAAGGGAATACACCAAAA
GTTTTTGCATTAAATATCAACTATTCAGGCATTATTTAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
MGGTAM: -598 -692
>VAN1	Upstream Sequence Complementary Strand
ACGTACTATTTCTACCATAAAGCCGACGATGTTATAAAAACGTTAACATAGTCTTTACCA
AATCACCACCGTTTTATCTACAATGTCTATTTAATCTTCGACCCATACGATTCATACCAA
CCAAATTTCTAATGTTACCAATAATGTCTGATCGTCTGTACAGTTGTAATCTATTTTATA
AATGGTTGTAGTCTCCGAGGAAACTATCATTTAGGGGTCTTTTATAACCGCTTAAGTTTC
ATTGATCAACCGCACTAAATTGTTAACCTATGCTGAGCAGATGACAGCTAGTGTGAGGGC
AAAATGGACAACTAAGTTCAAGTGTTTACTATTGTCGGGACAACTTCAATGGTCCATTAC
TGTTACGTCAACATTCTAAATGAACGTCTCCCAGACCATGGCTCGGTTTCAATTTTAACA
TATAACTTCCCTTTAGATGATAGTTACTTGTCTCACGATTTCTTTAACGACAATTTACAA
CCCTCTGGAATTTTGTTCTTACCAAAGTTGGCCTCTTTATATTAAACTGTCTTCAATTTG
GCATTTATCACAGCTAGCGCAAAGATATCTATTTTTTATCAAAAATTTCAGCCTTAATAT
TTTGTAACCTCTTCTCATTTTGCTCCCTTAACAGCTAGGGTGCTTATACCGCTCGTTCCG
CCGGTGTCTTTGGGTTTTCTTTTACGATAAAAGCCACACCTCCCACGCTGCTTTCTTACT
TTTTTTTCTGTTTTTTTTTTAAAGAGACAGTCAGACAGTCTCAATAAAAATAATGAAATT
TTCTTTCCCTTGTTATGTTTTTTTCCTTTTTTCTTTTAAAATTTATTAGTGTCGTTTGTC
TCTGTTTTTGTTCTTCTTCCCTTTTTTTTTAATGAAAAGAGCTATGGTGAAAGTTGATAG
TTTAACAAAAATGTCGTAAAAGTTTTTTTTATTGATGGAGATTTTCCCTTATGTGGTTTT
CAAAAACGTAATTTATAGTTGATAAGTCCGTAATAAATTC
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