C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C3_01440C_A

Promoter Sequence

Consensus
RTCAYSYYWW: -33 -32 -31 -30 -29 -28 -27 -26 -25 -24 -23 -22 -21 -20

>C3_01440C_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GAAATTTTAGATCAATTGAATCAAACATTTATTATCAATAATAATGATGATGATGATGAT
GATGAAGAAACAAATCATCAAGGACCATTCAAATATCCACTGAATTTATTAATTGAACCA
AATAATTATATCAATGTTTATAATAAGATTTTAAGTTCCATTGATAAAACTTGTGTTTTC
AAACAAGATGTTGATCAACAAGTGATTGAATCAATAATAAATTTGATTTATAAAATTGGT
AATGATGATGAATATTTACGATTACAATATTTACAAACATTATGTTTGTTGATTAATAAA
TTCACTAATAATGCCGACTTCATTGAATCTAAATTGAAATTTTTAGAAAAAGTTGAAGAA
CAAGACTTCCCAATAACTAAAAAAGATTTTATATCATTTGAAATTTTTATATGGATATTA
AAGGGATTAATTGTTAAACTTGATAAATTAGGGATCAATTATTTAAATCAATTACTTGAA
TTATTTGTAATCACTGAAAACTATAAATTGAAACAATTAATTGGTAAATCATTACAAATT
TTATTTATTGATTTGAAAATTTTCACTAATGAGAGAATTACTACTACTGACAACACCAAT
AGTACTAATGGTGGTATTAAATCTTCTAGTCAATTGATTTCAAAAGTTAAAAATTTACAA
GTCAAATCATTATATAAACAACATATATTTGTCATTATTCTACCATATTTAATTAATGAT
TCTAATGAAAATTTCACTAATGATGCTGATTTCAATTTAAAATTCAATTCATTATCATTG
ATTATTGAAAATTTATCAATTAATGGTAATAATAATATTTTAATTAATCAATTATCAGAA
ATTCTACCAATTACATTATATTCATTAATTAAAATTCCAATAGATGCTAATTCAAATTCA
AATTTATTGGCATCATTAATAATATTGAATATTATTTTAAAAGAAGAAGAAAAAGAAAAA
GAAAAAGANNNNNNNNN>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>NNGAAAAAGAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RTCAYSYYWW: -10 -11 -12 -13 -14 -15 -16 -17 -18 -19 -20 -21 -22 -23 -26 -28

>C3_01440C_A	Upstream Sequence Complementary Strand
CTTTAAAATCTAGTTAACTTAGTTTGTAAATAATAGTTATTATTACTACTACTACTACTA
CTACTTCTTTGTTTAGTAGTTCCTGGTAAGTTTATAGGTGACTTAAATAATTAACTTGGT
TTATTAATATAGTTACAAATATTATTCTAAAATTCAAGGTAACTATTTTGAACACAAAAG
TTTGTTCTACAACTAGTTGTTCACTAACTTAGTTATTATTTAAACTAAATATTTTAACCA
TTACTACTACTTATAAATGCTAATGTTATAAATGTTTGTAATACAAACAACTAATTATTT
AAGTGATTATTACGGCTGAAGTAACTTAGATTTAACTTTAAAAATCTTTTTCAACTTCTT
GTTCTGAAGGGTTATTGATTTTTTCTAAAATATAGTAAACTTTAAAAATATACCTATAAT
TTCCCTAATTAACAATTTGAACTATTTAATCCCTAGTTAATAAATTTAGTTAATGAACTT
AATAAACATTAGTGACTTTTGATATTTAACTTTGTTAATTAACCATTTAGTAATGTTTAA
AATAAATAACTAAACTTTTAAAAGTGATTACTCTCTTAATGATGATGACTGTTGTGGTTA
TCATGATTACCACCATAATTTAGAAGATCAGTTAACTAAAGTTTTCAATTTTTAAATGTT
CAGTTTAGTAATATATTTGTTGTATATAAACAGTAATAAGATGGTATAAATTAATTACTA
AGATTACTTTTAAAGTGATTACTACGACTAAAGTTAAATTTTAAGTTAAGTAATAGTAAC
TAATAACTTTTAAATAGTTAATTACCATTATTATTATAAAATTAATTAGTTAATAGTCTT
TAAGATGGTTAATGTAATATAAGTAATTAATTTTAAGGTTATCTACGATTAAGTTTAAGT
TTAAATAACCGTAGTAATTATTATAACTTATAATAAAATTTTCTTCTTCTTTTTCTTTTT
CTTTTTCTNNNNNNNNN>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>NNCTTTTTCTTT