C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C3_01440C_B

Promoter Sequence

Consensus
RTCAYSYYWW: -33 -32 -31 -30 -29 -28 -27 -26 -25 -24 -23 -22 -21 -20

>C3_01440C_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GAAATTTTAGATCAATTGAATCAAACATTTATTACCAATAATAATGATGATGATGATGAT
GATGAAGAAACAAATCATCAAGGACCATTCAAATATCCACTGAATTTATTAATTGAACCA
AATAATTATATCAATGTTTATAATAAGATTTTAAGTTCCATTGATAAAACTTGTGTTTTC
AAACAAGATGTTGATCAACAAGTGATTGAATCAATAATAAATTTGATTTATAAAATTGGT
AGTGATGATGAATATTTACGATTACAATATTTACAAACATTATGTTTGTTGATTAATAAA
TTCACTAATAATGCCGACTTCATTGAATCTAAATTGAAATTTTTAGAAAAAGTTGAAGAA
CAAGACTTCCCAATAACTAAAGAAGATTTTATATCATTTGAAATTTTTATATGGATATTA
AAGGGATTAATTGTTAAACTTGATAAATTAGGGATTAATTATTTAAATCAATTACTTGAA
TTATTTGTAATTACTGAAAACTATAAATTGAAACAATTAATTGGTAAATCATTACAAATT
TTATTTATTGATTTGAAAATTTTCACTAATGAGAGAATTACTACTACTGACAACACCAAT
AGTACTAATGGTGGTATTAAATCTTCTAGTCAATTGATTTCAAAAGTTAAAAATTTACAA
GTCAAATCATTATATAAACAACATATATTTGTCATTATTTTACCATATTTAATTAATGAT
TCTAATGAAAATTTCACTAATGATGCTGATTTCAATTTAAAATTCAATTCATTATCATTG
ATTATTGAAAATTTATCAATTAATGGTAATAATAATATTTTAATTAATCAATTATCAGAA
ATTCTACCAATTACATTATATTCATTAATTAAAATTCCAATAGATGCTAATTCAAATTCA
AATTTATTGGCATCATTGATAATATTGAATATTATTTTAAAAGAAGAAGAAAAAGAAAAA
GAAAAAGANNNNNNNNN>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>NNGAAAAAGAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RTCAYSYYWW: -10 -11 -12 -13 -14 -15 -16 -17 -18 -19 -20 -21 -22 -23 -26 -28

>C3_01440C_B	Upstream Sequence Complementary Strand
CTTTAAAATCTAGTTAACTTAGTTTGTAAATAATGGTTATTATTACTACTACTACTACTA
CTACTTCTTTGTTTAGTAGTTCCTGGTAAGTTTATAGGTGACTTAAATAATTAACTTGGT
TTATTAATATAGTTACAAATATTATTCTAAAATTCAAGGTAACTATTTTGAACACAAAAG
TTTGTTCTACAACTAGTTGTTCACTAACTTAGTTATTATTTAAACTAAATATTTTAACCA
TCACTACTACTTATAAATGCTAATGTTATAAATGTTTGTAATACAAACAACTAATTATTT
AAGTGATTATTACGGCTGAAGTAACTTAGATTTAACTTTAAAAATCTTTTTCAACTTCTT
GTTCTGAAGGGTTATTGATTTCTTCTAAAATATAGTAAACTTTAAAAATATACCTATAAT
TTCCCTAATTAACAATTTGAACTATTTAATCCCTAATTAATAAATTTAGTTAATGAACTT
AATAAACATTAATGACTTTTGATATTTAACTTTGTTAATTAACCATTTAGTAATGTTTAA
AATAAATAACTAAACTTTTAAAAGTGATTACTCTCTTAATGATGATGACTGTTGTGGTTA
TCATGATTACCACCATAATTTAGAAGATCAGTTAACTAAAGTTTTCAATTTTTAAATGTT
CAGTTTAGTAATATATTTGTTGTATATAAACAGTAATAAAATGGTATAAATTAATTACTA
AGATTACTTTTAAAGTGATTACTACGACTAAAGTTAAATTTTAAGTTAAGTAATAGTAAC
TAATAACTTTTAAATAGTTAATTACCATTATTATTATAAAATTAATTAGTTAATAGTCTT
TAAGATGGTTAATGTAATATAAGTAATTAATTTTAAGGTTATCTACGATTAAGTTTAAGT
TTAAATAACCGTAGTAACTATTATAACTTATAATAAAATTTTCTTCTTCTTTTTCTTTTT
CTTTTTCTNNNNNNNNN>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>N>NNCTTTTTCTTT