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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C3_01590W_A
Promoter Sequence

Consensus
RTCAYSYYWW: -159 -158 -157 -156 -155 -154 -153 
>C3_01590W_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAGCTCTAGAATCTATTAATAATCTAACTGAAGTTATTGAAATAAATGCTAATGGGAAA
AGAAAGAATTTATCCAGAACTGGTTCAAACAATTCTGCTGTTACCCAATGTTCGTCTAAT
GAACTAACTCACGATCGTACAGAAACAGAAAATTCTAACCAACCTTTATCTTCCAGAAAT
TCTGCATCGCCACCAATATCAACCGGAAGCTCGATTAAGCAGTGCGATACATTAAAACAA
ATTGTTGGGGATAATGGCAATGGAGACGGCAATGGCACAACGGATAACAATAGCGTCCAC
CAACAAAACTTAGAACAACTACAAGGAAAATTGTCTCTAAATGATACCAGCACTTCAAAA
ACTAAAGAATTTGCAACTTCTCCTATGGCAGTACCTTCGGCCACAACTATTGAAGATTAT
ATTGTTACTCCTTTTCATCTTATGGAAAACATAAATTTAATTGGTGAAGAACCATCAATT
CTCGAACTAGTGAGACCTTTGACAGTTGATTCTGTTATTTTGAATTATGTTCGATTAGTT
GAATTTTTAGTTTCCAATTATCCAGATTCAAGAGACGGAAATTATCAAAACAATCCACGT
TATCAAGAATTAAACCTCATTGATCATCATGATAATTCGTTATATCTATCTACATTATTA
ATAATTCTAACTTTAAATCAAATTATTGCTGAAGTTCTTATTAAATTGAAGAAACAAAAA
TTCAAGAAATTTGTTCGATATCCTAAAAAATATTTGTTGTCACGACCATTTAAGAACTTT
AAAAATTTGTGTCATTTTAAAGTATTAGAAATATTCACATTGATTGAGAAAAACTTCATT
CNNNNNNNNNN>N>N>N>T>AATTCCCCAAAACAGGGCCCATAGATCTAGTTTTACCAGTAGCAG
TACTGAAGTGCATACCTCATCCAGCATAGCAAGTACCAATAATCACCACCACAACAACAA
CAATAACAATAACAATAATAACGGTCAAATACAATCTTTT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RTCAYSYYWW: -145 -146 -147 -148 -149 
>C3_01590W_A	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTCGAGATCTTAGATAATTATTAGATTGACTTCAATAACTTTATTTACGATTACCCTTT
TCTTTCTTAAATAGGTCTTGACCAAGTTTGTTAAGACGACAATGGGTTACAAGCAGATTA
CTTGATTGAGTGCTAGCATGTCTTTGTCTTTTAAGATTGGTTGGAAATAGAAGGTCTTTA
AGACGTAGCGGTGGTTATAGTTGGCCTTCGAGCTAATTCGTCACGCTATGTAATTTTGTT
TAACAACCCCTATTACCGTTACCTCTGCCGTTACCGTGTTGCCTATTGTTATCGCAGGTG
GTTGTTTTGAATCTTGTTGATGTTCCTTTTAACAGAGATTTACTATGGTCGTGAAGTTTT
TGATTTCTTAAACGTTGAAGAGGATACCGTCATGGAAGCCGGTGTTGATAACTTCTAATA
TAACAATGAGGAAAAGTAGAATACCTTTTGTATTTAAATTAACCACTTCTTGGTAGTTAA
GAGCTTGATCACTCTGGAAACTGTCAACTAAGACAATAAAACTTAATACAAGCTAATCAA
CTTAAAAATCAAAGGTTAATAGGTCTAAGTTCTCTGCCTTTAATAGTTTTGTTAGGTGCA
ATAGTTCTTAATTTGGAGTAACTAGTAGTACTATTAAGCAATATAGATAGATGTAATAAT
TATTAAGATTGAAATTTAGTTTAATAACGACTTCAAGAATAATTTAACTTCTTTGTTTTT
AAGTTCTTTAAACAAGCTATAGGATTTTTTATAAACAACAGTGCTGGTAAATTCTTGAAA
TTTTTAAACACAGTAAAATTTCATAATCTTTATAAGTGTAACTAACTCTTTTTGAAGTAA
GNNNNNNNNNN>N>N>NATTAAGGGGTTTTGTCCCGGGTATCTAGATCAAAATGGTCATCGTC
ATGACTTCACGTATGGAGTAGGTCGTATCGTTCATGGTTATTAGTGGTGGTGTTGTTGTT
GTTATTGTTATTGTTATTATTGCCAGTTTATGTTAGAAAA