PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C4_01670C_A
Promoter Sequence

Consensus
RTCAYSYYWW: -626 -191 
>TAP42    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATGAAAAATTGATTAAAGAATATGAAAATATGGGTAATGAAAATGGTCAACTTTGGAGTA
GTTCCGGTAAATGGGCAGTTATTTCATTCAACAAATAGATATACATACATAGAAATATAT
TATATAAACTTATGTATAGATAGATCAAAATAGATATTACCTTTTTTAGTTATTACTTTT
CTGTGTTACATCTCACCAGCCTTTCTAGAATTACAAGCAACAATTTTAAATTTATCAACA
TTCAATTCCAAATCACCACTATCTTTATCTTTATCACCACCACCACTATCTTTTGAGGAT
ACATCATTTAATTTAATAATGACATTTTTAATTATAAATGTCCAAACATCATCACAAAAT
CGATAAGTATCTAAATCACCTTTAAATATTAATTTTGATTTCCCCACGATATTTTCATTT
TTCAAATTTTCAGCAATTATTCTATCAAAATTAATTAATATTCTATTAGCTAATTGAGGT
TGAATTTTTTCATCAGATATTAATGTATCTAATGCATCCATTAATGTTACTCCAATGGTT
GATCTTCTATATAATTCATAATATGCTGGTGCTGACATGATGAGTGAAAAGGATGATACT
ATATTAAGAAAAAACAGGGATATAATTGTTTTGGAGAAATTCAAATAAAGGGTAACGAGG
GGGAGGAGAGGGGGATAGGAGAATTAGTGATATGAATAGTCAAATGAATAAAGTTAAAAC
TATTGTAAAGTAATTGAAAGAAACTGTCCTTTTTGATATTACTAATTCATTGATTGACTT
TTTTTTTGCTTTGCCTTGATTTTAACATTATCACCTTAACAATATTTTCCAATATTGTCA
CTCACACGACTACACACTTTCATTTCTTTTAAATTGAAGATTTTCACATCCATCATTTCC
ATCAACTTTTTGCCTCCATCTGTTTACACCAAGAGTATATATATCCATCAATTTTGGTTG
CATTAATTATATCTTCCCCCTCCTCTCCCCTTCATTAATT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RTCAYSYYWW: -403 
>TAP42	Upstream Sequence Complementary Strand
TACTTTTTAACTAATTTCTTATACTTTTATACCCATTACTTTTACCAGTTGAAACCTCAT
CAAGGCCATTTACCCGTCAATAAAGTAAGTTGTTTATCTATATGTATGTATCTTTATATA
ATATATTTGAATACATATCTATCTAGTTTTATCTATAATGGAAAAAATCAATAATGAAAA
GACACAATGTAGAGTGGTCGGAAAGATCTTAATGTTCGTTGTTAAAATTTAAATAGTTGT
AAGTTAAGGTTTAGTGGTGATAGAAATAGAAATAGTGGTGGTGGTGATAGAAAACTCCTA
TGTAGTAAATTAAATTATTACTGTAAAAATTAATATTTACAGGTTTGTAGTAGTGTTTTA
GCTATTCATAGATTTAGTGGAAATTTATAATTAAAACTAAAGGGGTGCTATAAAAGTAAA
AAGTTTAAAAGTCGTTAATAAGATAGTTTTAATTAATTATAAGATAATCGATTAACTCCA
ACTTAAAAAAGTAGTCTATAATTACATAGATTACGTAGGTAATTACAATGAGGTTACCAA
CTAGAAGATATATTAAGTATTATACGACCACGACTGTACTACTCACTTTTCCTACTATGA
TATAATTCTTTTTTGTCCCTATATTAACAAAACCTCTTTAAGTTTATTTCCCATTGCTCC
CCCTCCTCTCCCCCTATCCTCTTAATCACTATACTTATCAGTTTACTTATTTCAATTTTG
ATAACATTTCATTAACTTTCTTTGACAGGAAAAACTATAATGATTAAGTAACTAACTGAA
AAAAAAACGAAACGGAACTAAAATTGTAATAGTGGAATTGTTATAAAAGGTTATAACAGT
GAGTGTGCTGATGTGTGAAAGTAAAGAAAATTTAACTTCTAAAAGTGTAGGTAGTAAAGG
TAGTTGAAAAACGGAGGTAGACAAATGTGGTTCTCATATATATAGGTAGTTAAAACCAAC
GTAATTAATATAGAAGGGGGAGGAGAGGGGAAGTAATTAA