C.albicans - PathoYeastract

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Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

CHR1

Promoter Sequence

Consensus
RTCAYSYYWW: -478

>CHR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATAACCACGCTGATGATTCTACAACCATTTCTTTTACTTTCAAACGTCTCTATGTACAA
ATATATTTGAAAAAAAGTTATGTAAAAAAATAAACACAATCAAATGAACTTTAAATAAAA
AACAATTCTACTGTTTCCATTTATCATTATCTTCGTAGGGTGGCAGTAACGCCCTCCTCT
TTGTAATTATTAATCTTTTATCTTACTCATTCAGTTAATTCAATTTCTGATATTTTGAGC
ACTGATTTTTTCAAATTGATCAACTAATTTCTCAGTAATAAATTGTTCAGCTTTATTTTT
ACCATGATAAAAATTGACAGCACCAACTAAACTGAATAATAATTCACCACTTACTTTCAA
TTCTCCACTACTTTCAAATCCTAATGTTGAATTTCTAGTATGCCAAAACATTATTTCATT
AATATTGTTTGATTTAGCAAATATAGCCGCTGTTTTCAAACTTGGTAATTCTCTTGACAT
TGGTGATCCTAAAACATCCAAGTTTTTCCCCTCCACACCATTATCATGTTTACAAGGTTG
ATTAGTTACATATTTGGCAAAATATAATGATAATAATTTACTCCCCATGGCAGCTAATTT
TTCATTATATGGTTTAATACCATTACCAAATGATTTATGGGTTATTACTTGTAAAGCTAT
TTCATCAGGTATATTATATTTATCACCTAAAAATGATTTGATATGACTGATATTGGTTTC
ATTTAAACCATATTTAATTCCCTTGGGATTAATGAATGCTGCTTCGGGATCTCTCTTAAG
ACCTTCAACTCTGGGTCCTTTGTGTAGATAAATCGATCTAGTGAATATTGTGAATTGTTG
GCCAGTTATTCTACTGGATAGTTGTCGTATGTTACCAATCATCACTTGTTTAAATTAAAA
GTGATAATGTTATATGTTGTCGGTTTTATTTGATGGTTTAAACTGTCCCCAAAAAAAAAA
TTTTTTTTCTTACTATGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAACAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!

>CHR1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTATTGGTGCGACTACTAAGATGTTGGTAAAGAAAATGAAAGTTTGCAGAGATACATGTT
TATATAAACTTTTTTTCAATACATTTTTTTATTTGTGTTAGTTTACTTGAAATTTATTTT
TTGTTAAGATGACAAAGGTAAATAGTAATAGAAGCATCCCACCGTCATTGCGGGAGGAGA
AACATTAATAATTAGAAAATAGAATGAGTAAGTCAATTAAGTTAAAGACTATAAAACTCG
TGACTAAAAAAGTTTAACTAGTTGATTAAAGAGTCATTATTTAACAAGTCGAAATAAAAA
TGGTACTATTTTTAACTGTCGTGGTTGATTTGACTTATTATTAAGTGGTGAATGAAAGTT
AAGAGGTGATGAAAGTTTAGGATTACAACTTAAAGATCATACGGTTTTGTAATAAAGTAA
TTATAACAAACTAAATCGTTTATATCGGCGACAAAAGTTTGAACCATTAAGAGAACTGTA
ACCACTAGGATTTTGTAGGTTCAAAAAGGGGAGGTGTGGTAATAGTACAAATGTTCCAAC
TAATCAATGTATAAACCGTTTTATATTACTATTATTAAATGAGGGGTACCGTCGATTAAA
AAGTAATATACCAAATTATGGTAATGGTTTACTAAATACCCAATAATGAACATTTCGATA
AAGTAGTCCATATAATATAAATAGTGGATTTTTACTAAACTATACTGACTATAACCAAAG
TAAATTTGGTATAAATTAAGGGAACCCTAATTACTTACGACGAAGCCCTAGAGAGAATTC
TGGAAGTTGAGACCCAGGAAACACATCTATTTAGCTAGATCACTTATAACACTTAACAAC
CGGTCAATAAGATGACCTATCAACAGCATACAATGGTTAGTAGTGAACAAATTTAATTTT
CACTATTACAATATACAACAGCCAAAATAAACTACCAAATTTGACAGGGGTTTTTTTTTT
AAAAAAAAGAATGATACTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTGTT