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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name PGA38
Promoter Sequence

Consensus
RTCAYSYYWW: -361
>PGA38    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTTCGAGATAATAACTCTACGAGAGTAAGTTAAAAGTTTAACAATTAAACACTCAAGCA
AAGAATAATAATGTAATAATGTAATAATAATGTTGATTGTCCTGCAAAGATGGCTGGTGT
ATAATGGGCTTATAATAATATAAGCTTTTTGTCTTGGTTATTTGTTTTGTTTGTGTTATT
CTATTCAAGATTCAATCATAAAATAGAACGATGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGATATAA
GCCGATGCCTCTTGTTGGTAACGAAATAATAAATTATTTTGGGGACCGGGTGCACGCCAC
CATCCCATTCATTTATTCATTGTTTTCCACGCATATAAAAGCCGCACGCATTTTCCTAAT
TTGGGTTTAATTGCCAGTAAAAAAAAATTTCCTTGCTTCCCTTTCGCAACTATCAAGAGA
TTTTTCGATTTTTCGATTTTTCTGGATTATGTTCCAATTTCAGTATTTGCCAGCATTTTC
TAAATTTTGTGATGAAAGGGCTTCATTGCAAGAAGTATTATTTTATAACAAACTGTACTT
ATTGTCATTAACTACTGTCAAACAATGCAATAAACAATAACCAACAACCAACAACATTAT
AATATTTTATTATACTCTGAAATTGCTGGATTGTTTTAAATCATGTTTTTTGCCAATTGG
AGATTTTAAGACCAGCGTTTCAGATCAATTGAAAAAGATATTTGTTGATGGTTCCAGAAT
ATATAAATGTGGTCCAATATTTCTTTCCTGTATTTTTCTTAATTTCATTTTTATTTCTAT
TATTTATAATCATATAATTTCTTTTCTATTATATTTACTACTAGTACTACTACTACTACT
ATAATAAATAACTTATTCTTGGGTTTTTTTTTAATTTATTCTCAAGTAACTCAACAACAA
CAACCAAATACTTACAACAGGTTTCATATAAATAATAATTGACAAGAGAAATATATATAT
ATATATATTATAATACCAGGATAATAGAAGCATCATAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!
>PGA38	Upstream Sequence Complementary Strand
AAAAGCTCTATTATTGAGATGCTCTCATTCAATTTTCAAATTGTTAATTTGTGAGTTCGT
TTCTTATTATTACATTATTACATTATTATTACAACTAACAGGACGTTTCTACCGACCACA
TATTACCCGAATATTATTATATTCGAAAAACAGAACCAATAAACAAAACAAACACAATAA
GATAAGTTCTAAGTTAGTATTTTATCTTGCTACCAACCAACCAACCAACCAACCTATATT
CGGCTACGGAGAACAACCATTGCTTTATTATTTAATAAAACCCCTGGCCCACGTGCGGTG
GTAGGGTAAGTAAATAAGTAACAAAAGGTGCGTATATTTTCGGCGTGCGTAAAAGGATTA
AACCCAAATTAACGGTCATTTTTTTTTAAAGGAACGAAGGGAAAGCGTTGATAGTTCTCT
AAAAAGCTAAAAAGCTAAAAAGACCTAATACAAGGTTAAAGTCATAAACGGTCGTAAAAG
ATTTAAAACACTACTTTCCCGAAGTAACGTTCTTCATAATAAAATATTGTTTGACATGAA
TAACAGTAATTGATGACAGTTTGTTACGTTATTTGTTATTGGTTGTTGGTTGTTGTAATA
TTATAAAATAATATGAGACTTTAACGACCTAACAAAATTTAGTACAAAAAACGGTTAACC
TCTAAAATTCTGGTCGCAAAGTCTAGTTAACTTTTTCTATAAACAACTACCAAGGTCTTA
TATATTTACACCAGGTTATAAAGAAAGGACATAAAAAGAATTAAAGTAAAAATAAAGATA
ATAAATATTAGTATATTAAAGAAAAGATAATATAAATGATGATCATGATGATGATGATGA
TATTATTTATTGAATAAGAACCCAAAAAAAAATTAAATAAGAGTTCATTGAGTTGTTGTT
GTTGGTTTATGAATGTTGTCCAAAGTATATTTATTATTAACTGTTCTCTTTATATATATA
TATATATAATATTATGGTCCTATTATCTTCGTAGTATTAT
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