C.albicans - PathoYeastract

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Standard Name

ORC1

Promoter Sequence

Consensus
TACATRCAYRWM: -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267 -266 -265 -264 -263 -262 -261 -260 -259 -258 -257 -256 -253

>ORC1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCATTATTTCTTGTACTAACTCATTTATTAGAGTCGCCTTAAAAATTGGTTTAATTGGGG
ATTCCCAGATTGGCAAGACATCACTAATGGTGAAGTATGTGGAAGGTTCATTTGACGAAG
ACTATATTCAAACATTAGGGGTTAACTTTATGGATAAAAAGATACAAATTAGAAACACAA
CTATAACGTTCTCGATATGGGATTTAGGAGGACAAAAGGAGTTTATCAATATGCTACCAT
TGGTCTCAAATGATGCAGTGGCAATATTATTCATGTTTGATCTAACAAGAAAGTCTACGC
TAAATTCAATAAAGGAATGGTACAGACAGGTGAGAGGATTCAATAAGACGGCAATTCCCT
TTTTAGTGGGGACGAAGTATGATCAGTTTATTGATTTATCATTTCAAGATCAAATAGAGA
TTACACAACAAGCAAAGAAATTCGGAAGTGCGATGAAAGCTCCAGTCATATTTTGTTCAA
CTAGCCATTCTATTAACGTGCAAAAAATCTTCAAAATTATATTATCTAAAGCGTTTGACT
TAAAGTTAAACCTTGATGAAATTGTTAACGTGGGGGAACCCATATTGATATATAAGTAGT
TGGTGTAAAAAGCCACGTTCAAATTAAGTTCCATTCTTTAAACAATTCAATAGCTATTTA
TTACATAACTAGACATAATACGCTTATCATTGTTTATTATTATTACTATTATTATTATTA
TTATTATNNNNNNNNNNNan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>N>NGTATTATTATTATTATTATTATTA
TTATTATTTTTACTATGTAGTTTTATTAATGTTATTATGAAGTTTTAATCTTACAAATAA
TTCAATTCTGTGCGAAGTATAATTAACAGTGGTAGAATGCCAAAAACAGAACCAAAAAAA
AACAACGCAGACAACTTGGTTTGATTCAGATTAACAAACAAAACCGTGCCAGTTTTTTCT
GATCGGTACAATCTCAACACAACCTTAGTTACATCCAAAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TACATRCAYRWM: -241 -244 -245 -246 -247 -248 -249 -250 -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -264

>ORC1	Upstream Sequence Complementary Strand
AGTAATAAAGAACATGATTGAGTAAATAATCTCAGCGGAATTTTTAACCAAATTAACCCC
TAAGGGTCTAACCGTTCTGTAGTGATTACCACTTCATACACCTTCCAAGTAAACTGCTTC
TGATATAAGTTTGTAATCCCCAATTGAAATACCTATTTTTCTATGTTTAATCTTTGTGTT
GATATTGCAAGAGCTATACCCTAAATCCTCCTGTTTTCCTCAAATAGTTATACGATGGTA
ACCAGAGTTTACTACGTCACCGTTATAATAAGTACAAACTAGATTGTTCTTTCAGATGCG
ATTTAAGTTATTTCCTTACCATGTCTGTCCACTCTCCTAAGTTATTCTGCCGTTAAGGGA
AAAATCACCCCTGCTTCATACTAGTCAAATAACTAAATAGTAAAGTTCTAGTTTATCTCT
AATGTGTTGTTCGTTTCTTTAAGCCTTCACGCTACTTTCGAGGTCAGTATAAAACAAGTT
GATCGGTAAGATAATTGCACGTTTTTTAGAAGTTTTAATATAATAGATTTCGCAAACTGA
ATTTCAATTTGGAACTACTTTAACAATTGCACCCCCTTGGGTATAACTATATATTCATCA
ACCACATTTTTCGGTGCAAGTTTAATTCAAGGTAAGAAATTTGTTAAGTTATCGATAAAT
AATGTATTGATCTGTATTATGCGAATAGTAACAAATAATAATAATGATAATAATAATAAT
AATAATANNNNNNNNNn>NNan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>N>NCATAATAATAATAATAATAATAAT
AATAATAAAAATGATACATCAAAATAATTACAATAATACTTCAAAATTAGAATGTTTATT
AAGTTAAGACACGCTTCATATTAATTGTCACCATCTTACGGTTTTTGTCTTGGTTTTTTT
TTGTTGCGTCTGTTGAACCAAACTAAGTCTAATTGTTTGTTTTGGCACGGTCAAAAAAGA
CTAGCCATGTTAGAGTTGTGTTGGAATCAATGTAGGTTTA