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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C1_03920C_A
Promoter Sequence

Consensus
TARSCKA: -146 -144 -143 -142 -141 -140
>C1_03920C_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CAACATATCAATTGATCTTTGTAATATAGATATTTTTTTAGTAATATCAGGAGTAATTTT
AGCCAATACTCGACTACTACTAGATAATTTTTCAGCATCACCTAATTTGAAAAATATAAA
ATCATCATCAACAACAATTCTTGTCAACATTTTAATAGCAATATCTAATTCCCCCTTTGA
TAATAAACATTTACTATATCTTAAAATCATATCAATATAAAAATTTATAAATTTGATAGA
TTTATTATGAATTAAAAAATCCGTAGATAATATCGGTACATCATATCGATTATCAAATTT
ACTTTCATCAATAGTGGTGGTGTCGCCCAACTCTTGTTTAGCTAAATCAATCAATAATCT
TCGATAATGTTTTGTTGCATGACGTGGTGATTCACATACATCATCCTTATTAATGGCCAT
AACAGCATTAATATGATCATCTAATGATAATTCAAATGGAATATTTTGTCGTTGATTGGC
ATCACTATATAATAAATAACACAGACCAAAACTAACAATAAGTAAACCACAATAAACACC
AGTTAATATTTGTAATGTGAATTTAAATGGGCCTAAATTAGTTGTTTTCGTCGACATTAA
AGTTCGTGATTGAATTAATGTGTGTGATATAATTTTTGGTGTGGTTCTAAGCGTTGTCAG
TGTTGTAGGTTTTGTAATAAATGATAGTGGTCTGAATATGATTCCAGATTTCAATGTCTG
TAAAGCATTACTCTGCTTAGATAAGATGGGATGTATTCGACGAAACATGAGATTGATAGG
AGATGTAAGTGGTTGGATTGGTGAATGGGATATATCAAGTATTATGAGTATTGATGAATT
GAAATATATATATATANNNNNspan>NN</span>N</span>N</span>N</span>NTCCATACCCACTTCACTTTACTCTTATTGAATT
GCACAAAAGATAGGAAAATATTTACTACTAATCATTTACCTTTCAATACAACTAGTCTTA
CTATCATACCTTACCTGCTCCCTGTCGACTTTATATCCAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TARSCKA: -133 -134 -135 -136 -137 -139
>C1_03920C_A	Upstream Sequence Complementary Strand
GTTGTATAGTTAACTAGAAACATTATATCTATAAAAAAATCATTATAGTCCTCATTAAAA
TCGGTTATGAGCTGATGATGATCTATTAAAAAGTCGTAGTGGATTAAACTTTTTATATTT
TAGTAGTAGTTGTTGTTAAGAACAGTTGTAAAATTATCGTTATAGATTAAGGGGGAAACT
ATTATTTGTAAATGATATAGAATTTTAGTATAGTTATATTTTTAAATATTTAAACTATCT
AAATAATACTTAATTTTTTAGGCATCTATTATAGCCATGTAGTATAGCTAATAGTTTAAA
TGAAAGTAGTTATCACCACCACAGCGGGTTGAGAACAAATCGATTTAGTTAGTTATTAGA
AGCTATTACAAAACAACGTACTGCACCACTAAGTGTATGTAGTAGGAATAATTACCGGTA
TTGTCGTAATTATACTAGTAGATTACTATTAAGTTTACCTTATAAAACAGCAACTAACCG
TAGTGATATATTATTTATTGTGTCTGGTTTTGATTGTTATTCATTTGGTGTTATTTGTGG
TCAATTATAAACATTACACTTAAATTTACCCGGATTTAATCAACAAAAGCAGCTGTAATT
TCAAGCACTAACTTAATTACACACACTATATTAAAAACCACACCAAGATTCGCAACAGTC
ACAACATCCAAAACATTATTTACTATCACCAGACTTATACTAAGGTCTAAAGTTACAGAC
ATTTCGTAATGAGACGAATCTATTCTACCCTACATAAGCTGCTTTGTACTCTAACTATCC
TCTACATTCACCAACCTAACCACTTACCCTATATAGTTCATAATACTCATAACTACTTAA
CTTTATATATATATATNNNNNspan>NN</span>N</span>N</span>N</span>NAGGTATGGGTGAAGTGAAATGAGAATAACTTAA
CGTGTTTTCTATCCTTTTATAAATGATGATTAGTAAATGGAAAGTTATGTTGATCAGAAT
GATAGTATGGAATGGACGAGGGACAGCTGAAATATAGGTA
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