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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C1_13210C_B
Promoter Sequence

Consensus
TARSCKA: -34 -33 -32
>C1_13210C_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATGGATATAAAAATCATCATTTCCATTTCAATGTTTTCATGTGGGATTTATTTCAATGT
GTATGGGTTTCATTTTTATGTATTGTTCAAACATTTCAAATTCTTAAAGGATTAACAACA
TGGGAATTTAGTTCATTAAATAAACAATTACAAACTAATCGATTCAATCATTCTACTGTT
CCTAGAGATTTTGAAGCTGGTGAAGGGATTTCATTAGATCAAACCCAACCTTCAGATGGT
CAACATAGACATAATCATAATGAATTTCAAACGTGTATGAATTTATTAGGTATTGATCAA
TTCATATTGACTTTGAAAATGAGTTTAAAATCACTTTTTTCTAATACTCGTCATGGCAAT
AACAATACTAATTATGATCCATTAACTTCATTACATATCCCCACTGATCATGGAATTAAA
CAAAATTGGTTAGATTTTTGGATTATTGGTGAAGAGAAATGGAGAAATGTATTTTATTTA
CCTATTGATGGCGAAAATAATTTAAATGGGAAAGTGGTAGATTATTATACATTATATAGT
TACCATTGATTGTATGTACATATATACATATACATATGACATATACCAAAGCTATTATTC
TAAAACCTTTGTATTCATTGTAAAATACTTGTAGTAGATTGTTTCTTATTTTTCAAAATA
TGCTATCAAAATTTGTTTATCTGGAATTGACAAAATCAAACCTTGACAACAGTAATTTAA
AAAAAAAAATTATAAATTAACTGTATCTTTGTATTATTTGGTCGACCCACAACAATAGGT
AATGAATCTATAAGTCACAAAACAATAAACCAAGAAGTTAGACATCCATACTTTTGGCAT
TTGTTTGTAACTTGTCAGACAGCCACTTATACCCACCCAATTCAAAATCCTCCTAGAAGG
CACAATGAAAAGGGTAAAGATCATCGCTCCTTTAKAAATATTACATTACCTTCAAAAAAG
AAAGGCTNNNNNN</span>N</span>AGTTAAAGGCAAAACATTATAAGTAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TARSCKA: -25 -26 -27
>C1_13210C_B	Upstream Sequence Complementary Strand
ATACCTATATTTTTAGTAGTAAAGGTAAAGTTACAAAAGTACACCCTAAATAAAGTTACA
CATACCCAAAGTAAAAATACATAACAAGTTTGTAAAGTTTAAGAATTTCCTAATTGTTGT
ACCCTTAAATCAAGTAATTTATTTGTTAATGTTTGATTAGCTAAGTTAGTAAGATGACAA
GGATCTCTAAAACTTCGACCACTTCCCTAAAGTAATCTAGTTTGGGTTGGAAGTCTACCA
GTTGTATCTGTATTAGTATTACTTAAAGTTTGCACATACTTAAATAATCCATAACTAGTT
AAGTATAACTGAAACTTTTACTCAAATTTTAGTGAAAAAAGATTATGAGCAGTACCGTTA
TTGTTATGATTAATACTAGGTAATTGAAGTAATGTATAGGGGTGACTAGTACCTTAATTT
GTTTTAACCAATCTAAAAACCTAATAACCACTTCTCTTTACCTCTTTACATAAAATAAAT
GGATAACTACCGCTTTTATTAAATTTACCCTTTCACCATCTAATAATATGTAATATATCA
ATGGTAACTAACATACATGTATATATGTATATGTATACTGTATATGGTTTCGATAATAAG
ATTTTGGAAACATAAGTAACATTTTATGAACATCATCTAACAAAGAATAAAAAGTTTTAT
ACGATAGTTTTAAACAAATAGACCTTAACTGTTTTAGTTTGGAACTGTTGTCATTAAATT
TTTTTTTTTAATATTTAATTGACATAGAAACATAATAAACCAGCTGGGTGTTGTTATCCA
TTACTTAGATATTCAGTGTTTTGTTATTTGGTTCTTCAATCTGTAGGTATGAAAACCGTA
AACAAACATTGAACAGTCTGTCGGTGAATATGGGTGGGTTAAGTTTTAGGAGGATCTTCC
GTGTTACTTTTCCCATTTCTAGTAGCGAGGAAATMTTTATAATGTAATGGAAGTTTTTTC
TTTCCGANNNNNN</span>N</span>TCAATTTCCGTTTTGTAATATTCATC
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