C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C1_13380W_B

Promoter Sequence

Consensus
TARSCKA: -284 -283 -282 -281 -280 -279 -278 -277 -276 -275 -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267 -266 -265 -264 -263 -262 -261 -260 -259 -258 -135 -134

>C1_13380W_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACAATTAGATGATAATAATAATCCGGAATCTTATTCATTATTATCATCAATTAGAATTTC
TCAACAAAGAACTCAAGAAGCAATTGAAGCATTATTAAAATCTTGGGAATTATTTAAATT
GAAAAAATCTAAATTAGAAGAAATGGCTAACAATGCTAAAACTGATCAACAACAAGAAGC
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTAGTGGTAATTCTGGTGATTCATTTGAAATTGG
TATGGAATATGTTGATTTGATTCAACCATTAATTACATTATCAAGATATGCTATTGAATT
AGAACAATATGATATAGCTATACAAATCAGTAATAATGTTCAAGATATTAATGAAAATAT
ATTGGATAGTTATTATATTGAAAGTTTGGCCAATATTTTAAAATTGAAAAAAATTTTATA
TCCAAATGACCAAAATTATAAAGATATTGAATTATCAGAAATTTTGAATCAAGTCAATGG
TGATAATGATGAAATTAATTCAATTTTACAAGATGTTAAACTTAGTTTAACTATGGCTTA
TAAAATCATTAATAGTGATATTGGTGAAGAATTCGATCATGGATTAATTGAACAAATTAA
TCAATTATTACAAGAATTTGGTGGTCCTATAATGAGTGAATTAATGCCTCAAAGAAGACG
TGGTAATGATGATGATGATGATGATGAAATAGAAGGTTGGGAAGATGAAATTGTTCNNNN
>NNNan>Nan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NTTCTTGTTATTTATATATATATATATATATA
TTTCATTAATATCCTTATTATAGACATATGGAAAATTTTAATTTAAATCTAATTGATTTA
GCAACATCTCGTAGGAGTAGAATGCNNNNNNN</span>NGCATTGAAAAAGTTGATCAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAGAAATTGGAAGTATTTGGAATACTTTATTTAACAACAACTACAACAAT
TAATCAAACTCATACTTTCCACATTACACCATAACATACA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TARSCKA: -127 -128 -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -263 -264 -265 -266 -267 -268 -269 -270 -271 -272 -273 -274 -275 -276 -277 -279

>C1_13380W_B	Upstream Sequence Complementary Strand
TGTTAATCTACTATTATTATTAGGCCTTAGAATAAGTAATAATAGTAGTTAATCTTAAAG
AGTTGTTTCTTGAGTTCTTCGTTAACTTCGTAATAATTTTAGAACCCTTAATAAATTTAA
CTTTTTTAGATTTAATCTTCTTTACCGATTGTTACGATTTTGACTAGTTGTTGTTCTTCG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACAATCACCATTAAGACCACTAAGTAAACTTTAACC
ATACCTTATACAACTAAACTAAGTTGGTAATTAATGTAATAGTTCTATACGATAACTTAA
TCTTGTTATACTATATCGATATGTTTAGTCATTATTACAAGTTCTATAATTACTTTTATA
TAACCTATCAATAATATAACTTTCAAACCGGTTATAAAATTTTAACTTTTTTTAAAATAT
AGGTTTACTGGTTTTAATATTTCTATAACTTAATAGTCTTTAAAACTTAGTTCAGTTACC
ACTATTACTACTTTAATTAAGTTAAAATGTTCTACAATTTGAATCAAATTGATACCGAAT
ATTTTAGTAATTATCACTATAACCACTTCTTAAGCTAGTACCTAATTAACTTGTTTAATT
AGTTAATAATGTTCTTAAACCACCAGGATATTACTCACTTAATTACGGAGTTTCTTCTGC
ACCATTACTACTACTACTACTACTACTTTATCTTCCAACCCTTCTACTTTAACAAGNNNN/>Nn>NNan>Nan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NAAGAACAATAAATATATATATATATATATAT
AAAGTAATTATAGGAATAATATCTGTATACCTTTTAAAATTAAATTTAGATTAACTAAAT
CGTTGTAGAGCATCCTCATCTTACGNNNNNNN</span>NCGTAACTTTTTCAACTAGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTCTTTAACCTTCATAAACCTTATGAAATAAATTGTTGTTGATGTTGTTA
ATTAGTTTGAGTATGAAAGGTGTAATGTGGTATTGTATGT