C.albicans - PathoYeastract

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Standard Name

PEP1

Promoter Sequence

Consensus
TARSCKA: -457 -456 -455 -454 -453 -452 -451 -450 -449 -448 -447

>PEP1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATCTTATAGAAATTATTCAACTTTGATAAGGCTTACTATATTTGAAAGAATTGTTGGTG
TTCCTTATTAAATTTGCCATATCTGTCGACCCTGTTGGAATTACTACGCCATAGATAAAT
TGATAAATTGATACATATTTATTCACTTGAACAAACTGATTAGATCAAATCATATTGAAT
ATTAGGTTCCCCTTGTCAATTGGTATTCTTTTTTTCACTCCCGATAACACTAATTAGACA
AACTCAAACACTTCAAAATGAGGAATAATAATTGGAATTGGCTAATATTCTTGGTGCCAT
TTATTTTATCCTTAACAACTGCTTATACTCCAGATATATCAGTTGTTAAAAACAAATCAC
CAGCAAGAGAAATTAAATATTTTGATGATTCTTCCAATTTATTAGTTTTAAGAGATGAAC
ATCTTTTAATCTCGAAAAATGATGGTAAATCATTTGAAGAAATTCCTGATATTAAAGATC
CAATTATTTATTTTGAAATGGATCCAACTAACAAGAATCGTGCCTTTGCCATGACACTTT
CTCNNNNNNN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>ACAGAAGATCAGGGTAATAAATGGCGGACATTTGAAATTGA
TATTTTCAATGGTGAAATGGCATCAATTCCTAAAATTACTTTTAATTTTGAAAATCCAAA
TTATTTGATGATTTCAAATTATGAATGTCCTGAAGGTCAAAGATTAAATCGTAATTGTAA
ACATAGATATTTTTTCACGAAAGATGGGTTTAAATCAAAACCAAATAAATTACCTGTCGA
TGCTCATGTTTGTCGATTTGCTAAATCAACTAAAACCTCCAAAATTGGTAAAAGTGAAAC
GATTTTTTGTACTGTTAATCAATTGAATTCTTATGGTCATATTGTTGAATCTCATTTATA
TAATTCAAATGATTTTTTCCAAAATAAAAATGAAATTAAAATTAAACCTTTGGATTCTTC
AAGTGGTGAAATCATTGATGTTAAAATAGAAGAAGATTTT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TARSCKA: -440 -441 -442 -443 -444 -445 -446 -447 -448 -449 -450 -452

>PEP1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTAGAATATCTTTAATAAGTTGAAACTATTCCGAATGATATAAACTTTCTTAACAACCAC
AAGGAATAATTTAAACGGTATAGACAGCTGGGACAACCTTAATGATGCGGTATCTATTTA
ACTATTTAACTATGTATAAATAAGTGAACTTGTTTGACTAATCTAGTTTAGTATAACTTA
TAATCCAAGGGGAACAGTTAACCATAAGAAAAAAAGTGAGGGCTATTGTGATTAATCTGT
TTGAGTTTGTGAAGTTTTACTCCTTATTATTAACCTTAACCGATTATAAGAACCACGGTA
AATAAAATAGGAATTGTTGACGAATATGAGGTCTATATAGTCAACAATTTTTGTTTAGTG
GTCGTTCTCTTTAATTTATAAAACTACTAAGAAGGTTAAATAATCAAAATTCTCTACTTG
TAGAAAATTAGAGCTTTTTACTACCATTTAGTAAACTTCTTTAAGGACTATAATTTCTAG
GTTAATAAATAAAACTTTACCTAGGTTGATTGTTCTTAGCACGGAAACGGTACTGTGAAA
GAGNNNNNspan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>TGTCTTCTAGTCCCATTATTTACCGCCTGTAAACTTTAACT
ATAAAAGTTACCACTTTACCGTAGTTAAGGATTTTAATGAAAATTAAAACTTTTAGGTTT
AATAAACTACTAAAGTTTAATACTTACAGGACTTCCAGTTTCTAATTTAGCATTAACATT
TGTATCTATAAAAAAGTGCTTTCTACCCAAATTTAGTTTTGGTTTATTTAATGGACAGCT
ACGAGTACAAACAGCTAAACGATTTAGTTGATTTTGGAGGTTTTAACCATTTTCACTTTG
CTAAAAAACATGACAATTAGTTAACTTAAGAATACCAGTATAACAACTTAGAGTAAATAT
ATTAAGTTTACTAAAAAAGGTTTTATTTTTACTTTAATTTTAATTTGGAAACCTAAGAAG
TTCACCACTTTAGTAACTACAATTTTATCTTCTTCTAAAA