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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SAM51
Promoter Sequence

Consensus
TARSCKA: -425
>SAM51    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CACAATTAACAACTGTCCCATTAGACTACATTTTACCAAAAGTTAAAAATGGTGAATTGA
TTACGCCGCAAGATAAAATCGTTTCACAACAACCACCAAATAATATTGGTCAATATGTTG
AATATAAATGGAATAAAAAAATTAAATGTCTTACGATAATCCCTAATTTTGAATTATCAA
CTGATCTTTCTCGTTCAGTATTACCGAAAAATTATCAATTACCAGATATTGTTTATAATT
TACAAAGAATTGCCATTTTAACTACCGCATTAACTCAAGATCCTCCAAATCATAAAGTTA
TTTACCAATCAATGAAAGATAAATTACATCAACCTTATAGATTTGGGTTAATTCCAGGAT
TAAATACAGTGTTACAGAAAATAACTCCCGAAAGTTATCCAGGATTATGTGGGATTTGTT
TATCTGGTGCTGGACCCACAATTTTGTGTCTTGCTACTGATGGTTTTGAAAAAATTGCTA
ATGATGTGATTGAAATATTTAAACAAGAAGGTATTGAATGTGATTCTAAATTATTAGATT
TAGCTTATGATGGTGCAACTGTTGAATATGGAAGTTAGGCTAGTTTAACGCATATTAAAA
AAAAGAAATAAGCTTATAGATTATGTTTATGAAAACTGCATTATTTAGACAATATAATAG
TAAATATAGAGGTTTTTTTACAAAATGATAAGGAGTATTACGATTAAAGTAATGGCTGAT
GTCAATGTTTAGTGTTTTTTTTTTCTTTTGCAGTAATTATTAGTATGGGCCAGCAACAAC
AACCCTTTCGGTATTGTTGAAAGTTGAAAAAAATTGTGTCGTGGACAATGAACCAATAAA
AATGCAGCAACTCAAAACCAAACCACACTAAAAAAAATACACCGAATTTCAACTTCAACT
TCAACTTCAACACCACCATCAACACTTAGCACCAAGTACTTCAGTTGTTTTTCATTCAAT
ATACCTATTCATTGTTAAGAAGAACAGCCTGTCTTGCACC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TARSCKA: -418 -453
>SAM51	Upstream Sequence Complementary Strand
GTGTTAATTGTTGACAGGGTAATCTGATGTAAAATGGTTTTCAATTTTTACCACTTAACT
AATGCGGCGTTCTATTTTAGCAAAGTGTTGTTGGTGGTTTATTATAACCAGTTATACAAC
TTATATTTACCTTATTTTTTTAATTTACAGAATGCTATTAGGGATTAAAACTTAATAGTT
GACTAGAAAGAGCAAGTCATAATGGCTTTTTAATAGTTAATGGTCTATAACAAATATTAA
ATGTTTCTTAACGGTAAAATTGATGGCGTAATTGAGTTCTAGGAGGTTTAGTATTTCAAT
AAATGGTTAGTTACTTTCTATTTAATGTAGTTGGAATATCTAAACCCAATTAAGGTCCTA
ATTTATGTCACAATGTCTTTTATTGAGGGCTTTCAATAGGTCCTAATACACCCTAAACAA
ATAGACCACGACCTGGGTGTTAAAACACAGAACGATGACTACCAAAACTTTTTTAACGAT
TACTACACTAACTTTATAAATTTGTTCTTCCATAACTTACACTAAGATTTAATAATCTAA
ATCGAATACTACCACGTTGACAACTTATACCTTCAATCCGATCAAATTGCGTATAATTTT
TTTTCTTTATTCGAATATCTAATACAAATACTTTTGACGTAATAAATCTGTTATATTATC
ATTTATATCTCCAAAAAAATGTTTTACTATTCCTCATAATGCTAATTTCATTACCGACTA
CAGTTACAAATCACAAAAAAAAAAGAAAACGTCATTAATAATCATACCCGGTCGTTGTTG
TTGGGAAAGCCATAACAACTTTCAACTTTTTTTAACACAGCACCTGTTACTTGGTTATTT
TTACGTCGTTGAGTTTTGGTTTGGTGTGATTTTTTTTATGTGGCTTAAAGTTGAAGTTGA
AGTTGAAGTTGTGGTGGTAGTTGTGAATCGTGGTTCATGAAGTCAACAAAAAGTAAGTTA
TATGGATAAGTAACAATTCTTCTTGTCGGACAGAACGTGG
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