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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SSH1
Promoter Sequence

No match found!
>SSH1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAGAATTATTTATTAGATAAGACAAACAAGAATAATAATTCTTTATTGGATCAATTACTT
TATAAAGTATTATTATTCAAAGAGAAAAAGCACAATGATACAACTTTCCATCGACAATAT
AATATTGGTACTACTGATTATATCAATTATTTAACAAAAGATGTTCCCTCCTATAGTCCA
GCATTTGTTGCACCATCAACAATATCAGATACAACAACTGGAGGGTCATCTTTAATCATG
TGTGGTGGTGTTGGTTTTGGTGGGTCTGCTTCTTGGAATGACATATGACCAACATGAAAT
CAGGAATTCATTTTTGCATTAATGGTTTCTTTTAAGGAAAGCAATTTGGTTATAAGGTAT
AGGTTAAATGGGGGAGGATTAGGTTATTTTTTTTGGAACGGTTGAGGATAATTACGGTTA
CGATGGACTTGATGTATTAAACATGTATAATAGTCTCTCTTTTTTTTTTTAATTCAATAG
AATATTGAACAAGCAATAACGTCTAAAAGATTATCACTTTATACGATTTTTCTTTGATTG
AAACTTTTTAATTTATTATACATTTGATCTTTGAATACGAATATAATTTAGTGTGGATAC
AGATACACCCAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTACTTTGGCCGTACCATCATCGCGGTGGTA
ATAGTAATAGTAGCAGTAGCAGTGGCACCAGCACCAGCGTACAAAAAAAGTGTTTATCTA
ATTTTTTTTTCCGTTATCAATTAAACCCAGCAATCCTCAAAAAGGGCAGGCGAGCGAGCG
AACGAATAATTTCTTTTTTGTCTTTTTGCTTCATTTAATTACTCGCCTCAATTGGAATTA
ATGAACGAACGAACGAACAAACAAACAAACGAACCTACCACTTTGGAAAGAAAACGAAAA
AAAAAAAATTGAATAATCAACATTTCAAAAAATTTTTCAAGTCCTTTCAAGCTCCACACA
CACCTTTAATCACCCAACACACAATTAATTAATTAATATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TARSCKA: -614 -634
>SSH1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTCTTAATAAATAATCTATTCTGTTTGTTCTTATTATTAAGAAATAACCTAGTTAATGAA
ATATTTCATAATAATAAGTTTCTCTTTTTCGTGTTACTATGTTGAAAGGTAGCTGTTATA
TTATAACCATGATGACTAATATAGTTAATAAATTGTTTTCTACAAGGGAGGATATCAGGT
CGTAAACAACGTGGTAGTTGTTATAGTCTATGTTGTTGACCTCCCAGTAGAAATTAGTAC
ACACCACCACAACCAAAACCACCCAGACGAAGAACCTTACTGTATACTGGTTGTACTTTA
GTCCTTAAGTAAAAACGTAATTACCAAAGAAAATTCCTTTCGTTAAACCAATATTCCATA
TCCAAT
TTACCCCCTCCTAATCCAATAAAAAAAACCTTGCCAACTCCTATTAATGCCAAT
GCTACCTGAACTACATAATTTGTACATATTATCAGAGAGAAAAAAAAAAATTAAGTTATC
TTATAACTTGTTCGTTATTGCAGATTTTCTAATAGTGAAATATGCTAAAAAGAAACTAAC
TTTGAAAAATTAAATAATATGTAAACTAGAAACTTATGCTTATATTAAATCACACCTATG
TCTATGTGGGTTAAAGAAAAGAAAAAAAAAATGAAACCGGCATGGTAGTAGCGCCACCAT
TATCATTATCATCGTCATCGTCACCGTGGTCGTGGTCGCATGTTTTTTTCACAAATAGAT
TAAAAAAAAAGGCAATAGTTAATTTGGGTCGTTAGGAGTTTTTCCCGTCCGCTCGCTCGC
TTGCTTATTAAAGAAAAAACAGAAAAACGAAGTAAATTAATGAGCGGAGTTAACCTTAAT
TACTTGCTTGCTTGCTTGTTTGTTTGTTTGCTTGGATGGTGAAACCTTTCTTTTGCTTTT
TTTTTTTTAACTTATTAGTTGTAAAGTTTTTTAAAAAGTTCAGGAAAGTTCGAGGTGTGT
GTGGAAATTAGTGGGTTGTGTGTTAATTAATTAATTATAT
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