C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C1_13380W_A

Promoter Sequence

Consensus
TCGNYWAWWSTTGCC: -287 -285 -284 -283 -282 -281 -280 -279 -278 -277 -276 -275 -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267

>C1_13380W_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CAATTAGATGATAATAATAATCCGGAATCTTATTCATTATTATCATCAATTAGAATTTCT
CAACAAAGAACACAAGAAGCAATTGAAGCATTATTAAAATCTTGGGAATTATTTAAATTG
AAAAAATCTAAATTAGAAGAAATGGCTAACAATGCTAAAACTGATCAACAACAAGAAGCA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTGGTGGTAATTCTGGTGATTCATTTGAAATTGGT
ATGGAATATGTTGATTTGATTCAACCATTAATTACATTATCGAGATATGCTATTGAATTA
GAACAATATGATATAGCTATACAAATCAGTAATAATGTTCAAGATATTAATGAAAATATA
TTGGATAGTTATTATATTGAAAGTTTGGCCAATATTTTAAAATTGAAAAAAATTTTATAT
CCAAATGACCAAAATTATAAAGATATTGAATTATCAGAAATTTTGAACCAAGTCAATGGT
GATAATGATGAAATTAATTCAATTTTACAAGATGTTAAACTTAGTTTAACTATGGCTTAT
AAAATCATTAATAGTGATATTGGTGAAGAATTCGATCATGGATTAATTGAACAAATTAAT
CAATTATTACAAGAATTTGGTGGTCCTATAATGAGTGAATTAATGCCTCAAAGAAGACGT
GGTAATGATGATGATGATGATGATGAAATAGAAGGTTGGGAAGATGAAATTGTTCNNNNNr/>NNNNNNNNn>NNan>Nan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NNTTCTTGTTATTTATATATATATATATATATAT
TTCATTAATATCCTTATTATAGACATATGGAAATTTTTAATTTAAATCTAATTGATTTAG
CAACATCTCGTAGGAGTAGAATGCNNNNNNNNGCATTGAAAAAGTTGATCAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAGTATTTGGAATACTTTATTTAACAACAACTACAACAAT
TAATCAAACTCATACTTTCCACATTACACCATAACATACA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TCGNYWAWWSTTGCC: -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -263 -264 -265 -266 -267 -268 -269 -270

>C1_13380W_A	Upstream Sequence Complementary Strand
GTTAATCTACTATTATTATTAGGCCTTAGAATAAGTAATAATAGTAGTTAATCTTAAAGA
GTTGTTTCTTGTGTTCTTCGTTAACTTCGTAATAATTTTAGAACCCTTAATAAATTTAAC
TTTTTTAGATTTAATCTTCTTTACCGATTGTTACGATTTTGACTAGTTGTTGTTCTTCGT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACAACCACCATTAAGACCACTAAGTAAACTTTAACCA
TACCTTATACAACTAAACTAAGTTGGTAATTAATGTAATAGCTCTATACGATAACTTAAT
CTTGTTATACTATATCGATATGTTTAGTCATTATTACAAGTTCTATAATTACTTTTATAT
AACCTATCAATAATATAACTTTCAAACCGGTTATAAAATTTTAACTTTTTTTAAAATATA
GGTTTACTGGTTTTAATATTTCTATAACTTAATAGTCTTTAAAACTTGGTTCAGTTACCA
CTATTACTACTTTAATTAAGTTAAAATGTTCTACAATTTGAATCAAATTGATACCGAATA
TTTTAGTAATTATCACTATAACCACTTCTTAAGCTAGTACCTAATTAACTTGTTTAATTA
GTTAATAATGTTCTTAAACCACCAGGATATTACTCACTTAATTACGGAGTTTCTTCTGCA
CCATTACTACTACTACTACTACTACTTTATCTTCCAACCCTTCTACTTTAACAAGNNNNN/>NNNNNNNNNNan>Nan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NNAAGAACAATAAATATATATATATATATATATA
AAGTAATTATAGGAATAATATCTGTATACCTTTAAAAATTAAATTTAGATTAACTAAATC
GTTGTAGAGCATCCTCATCTTACGNNNNNNNNCGTAACTTTTTCAACTAGTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTAACCTTCATAAACCTTATGAAATAAATTGTTGTTGATGTTGTTA
ATTAGTTTGAGTATGAAAGGTGTAATGTGGTATTGTATGT