C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C1_13380W_B

Promoter Sequence

Consensus
TCGNYWAWWSTTGCC: -286 -284 -283 -282 -281 -280 -279 -278 -277 -276 -275 -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267 -266

>C1_13380W_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACAATTAGATGATAATAATAATCCGGAATCTTATTCATTATTATCATCAATTAGAATTTC
TCAACAAAGAACTCAAGAAGCAATTGAAGCATTATTAAAATCTTGGGAATTATTTAAATT
GAAAAAATCTAAATTAGAAGAAATGGCTAACAATGCTAAAACTGATCAACAACAAGAAGC
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTAGTGGTAATTCTGGTGATTCATTTGAAATTGG
TATGGAATATGTTGATTTGATTCAACCATTAATTACATTATCAAGATATGCTATTGAATT
AGAACAATATGATATAGCTATACAAATCAGTAATAATGTTCAAGATATTAATGAAAATAT
ATTGGATAGTTATTATATTGAAAGTTTGGCCAATATTTTAAAATTGAAAAAAATTTTATA
TCCAAATGACCAAAATTATAAAGATATTGAATTATCAGAAATTTTGAATCAAGTCAATGG
TGATAATGATGAAATTAATTCAATTTTACAAGATGTTAAACTTAGTTTAACTATGGCTTA
TAAAATCATTAATAGTGATATTGGTGAAGAATTCGATCATGGATTAATTGAACAAATTAA
TCAATTATTACAAGAATTTGGTGGTCCTATAATGAGTGAATTAATGCCTCAAAGAAGACG
TGGTAATGATGATGATGATGATGATGAAATAGAAGGTTGGGAAGATGAAATTGTTCNNNN/>NNNNNNNNNn>NNan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NNTTCTTGTTATTTATATATATATATATATATA
TTTCATTAATATCCTTATTATAGACATATGGAAAATTTTAATTTAAATCTAATTGATTTA
GCAACATCTCGTAGGAGTAGAATGCNNNNNNNNGCATTGAAAAAGTTGATCAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAGAAATTGGAAGTATTTGGAATACTTTATTTAACAACAACTACAACAAT
TAATCAAACTCATACTTTCCACATTACACCATAACATACA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TCGNYWAWWSTTGCC: -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -263 -264 -265 -266 -267 -268 -269

>C1_13380W_B	Upstream Sequence Complementary Strand
TGTTAATCTACTATTATTATTAGGCCTTAGAATAAGTAATAATAGTAGTTAATCTTAAAG
AGTTGTTTCTTGAGTTCTTCGTTAACTTCGTAATAATTTTAGAACCCTTAATAAATTTAA
CTTTTTTAGATTTAATCTTCTTTACCGATTGTTACGATTTTGACTAGTTGTTGTTCTTCG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACAATCACCATTAAGACCACTAAGTAAACTTTAACC
ATACCTTATACAACTAAACTAAGTTGGTAATTAATGTAATAGTTCTATACGATAACTTAA
TCTTGTTATACTATATCGATATGTTTAGTCATTATTACAAGTTCTATAATTACTTTTATA
TAACCTATCAATAATATAACTTTCAAACCGGTTATAAAATTTTAACTTTTTTTAAAATAT
AGGTTTACTGGTTTTAATATTTCTATAACTTAATAGTCTTTAAAACTTAGTTCAGTTACC
ACTATTACTACTTTAATTAAGTTAAAATGTTCTACAATTTGAATCAAATTGATACCGAAT
ATTTTAGTAATTATCACTATAACCACTTCTTAAGCTAGTACCTAATTAACTTGTTTAATT
AGTTAATAATGTTCTTAAACCACCAGGATATTACTCACTTAATTACGGAGTTTCTTCTGC
ACCATTACTACTACTACTACTACTACTTTATCTTCCAACCCTTCTACTTTAACAAGNNNN
>NNNNNNNNNNNan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NNAAGAACAATAAATATATATATATATATATAT
AAAGTAATTATAGGAATAATATCTGTATACCTTTTAAAATTAAATTTAGATTAACTAAAT
CGTTGTAGAGCATCCTCATCTTACGNNNNNNNNCGTAACTTTTTCAACTAGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTCTTTAACCTTCATAAACCTTATGAAATAAATTGTTGTTGATGTTGTTA
ATTAGTTTGAGTATGAAAGGTGTAATGTGGTATTGTATGT