PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C3_01440C_A
Promoter Sequence

Consensus
TCGNYWAWWSTTGCC: -32 -31 -30 -29 -28 -27 -26 -25
>C3_01440C_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GAAATTTTAGATCAATTGAATCAAACATTTATTATCAATAATAATGATGATGATGATGAT
GATGAAGAAACAAATCATCAAGGACCATTCAAATATCCACTGAATTTATTAATTGAACCA
AATAATTATATCAATGTTTATAATAAGATTTTAAGTTCCATTGATAAAACTTGTGTTTTC
AAACAAGATGTTGATCAACAAGTGATTGAATCAATAATAAATTTGATTTATAAAATTGGT
AATGATGATGAATATTTACGATTACAATATTTACAAACATTATGTTTGTTGATTAATAAA
TTCACTAATAATGCCGACTTCATTGAATCTAAATTGAAATTTTTAGAAAAAGTTGAAGAA
CAAGACTTCCCAATAACTAAAAAAGATTTTATATCATTTGAAATTTTTATATGGATATTA
AAGGGATTAATTGTTAAACTTGATAAATTAGGGATCAATTATTTAAATCAATTACTTGAA
TTATTTGTAATCACTGAAAACTATAAATTGAAACAATTAATTGGTAAATCATTACAAATT
TTATTTATTGATTTGAAAATTTTCACTAATGAGAGAATTACTACTACTGACAACACCAAT
AGTACTAATGGTGGTATTAAATCTTCTAGTCAATTGATTTCAAAAGTTAAAAATTTACAA
GTCAAATCATTATATAAACAACATATATTTGTCATTATTCTACCATATTTAATTAATGAT
TCTAATGAAAATTTCACTAATGATGCTGATTTCAATTTAAAATTCAATTCATTATCATTG
ATTATTGAAAATTTATCAATTAATGGTAATAATAATATTTTAATTAATCAATTATCAGAA
ATTCTACCAATTACATTATATTCATTAATTAAAATTCCAATAGATGCTAATTCAAATTCA
AATTTATTGGCATCATTAATAATATTGAATATTATTTTAAAAGAAGAAGAAAAAGAAAAA
GAAAAAGANNNNNNNNNNNNNNN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NNGAAAAAGAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TCGNYWAWWSTTGCC: -8 -10 -11 -12 -13 -14 -15 -16 -17
>C3_01440C_A	Upstream Sequence Complementary Strand
CTTTAAAATCTAGTTAACTTAGTTTGTAAATAATAGTTATTATTACTACTACTACTACTA
CTACTTCTTTGTTTAGTAGTTCCTGGTAAGTTTATAGGTGACTTAAATAATTAACTTGGT
TTATTAATATAGTTACAAATATTATTCTAAAATTCAAGGTAACTATTTTGAACACAAAAG
TTTGTTCTACAACTAGTTGTTCACTAACTTAGTTATTATTTAAACTAAATATTTTAACCA
TTACTACTACTTATAAATGCTAATGTTATAAATGTTTGTAATACAAACAACTAATTATTT
AAGTGATTATTACGGCTGAAGTAACTTAGATTTAACTTTAAAAATCTTTTTCAACTTCTT
GTTCTGAAGGGTTATTGATTTTTTCTAAAATATAGTAAACTTTAAAAATATACCTATAAT
TTCCCTAATTAACAATTTGAACTATTTAATCCCTAGTTAATAAATTTAGTTAATGAACTT
AATAAACATTAGTGACTTTTGATATTTAACTTTGTTAATTAACCATTTAGTAATGTTTAA
AATAAATAACTAAACTTTTAAAAGTGATTACTCTCTTAATGATGATGACTGTTGTGGTTA
TCATGATTACCACCATAATTTAGAAGATCAGTTAACTAAAGTTTTCAATTTTTAAATGTT
CAGTTTAGTAATATATTTGTTGTATATAAACAGTAATAAGATGGTATAAATTAATTACTA
AGATTACTTTTAAAGTGATTACTACGACTAAAGTTAAATTTTAAGTTAAGTAATAGTAAC
TAATAACTTTTAAATAGTTAATTACCATTATTATTATAAAATTAATTAGTTAATAGTCTT
TAAGATGGTTAATGTAATATAAGTAATTAATTTTAAGGTTATCTACGATTAAGTTTAAGT
TTAAATAACCGTAGTAATTATTATAACTTATAATAAAATTTTCTTCTTCTTTTTCTTTTT
CTTTTTCTNNNNNNNNNNNNNNN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>Nspan>NCTTTTTCTTT
w3c xhtml validator w3c css validator