C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C1_13380W_B

Promoter Sequence

Consensus
TGCTAATTTAACAAAAACTAATAATTA: -284 -283 -282 -281 -280 -279 -278

>C1_13380W_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACAATTAGATGATAATAATAATCCGGAATCTTATTCATTATTATCATCAATTAGAATTTC
TCAACAAAGAACTCAAGAAGCAATTGAAGCATTATTAAAATCTTGGGAATTATTTAAATT
GAAAAAATCTAAATTAGAAGAAATGGCTAACAATGCTAAAACTGATCAACAACAAGAAGC
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTAGTGGTAATTCTGGTGATTCATTTGAAATTGG
TATGGAATATGTTGATTTGATTCAACCATTAATTACATTATCAAGATATGCTATTGAATT
AGAACAATATGATATAGCTATACAAATCAGTAATAATGTTCAAGATATTAATGAAAATAT
ATTGGATAGTTATTATATTGAAAGTTTGGCCAATATTTTAAAATTGAAAAAAATTTTATA
TCCAAATGACCAAAATTATAAAGATATTGAATTATCAGAAATTTTGAATCAAGTCAATGG
TGATAATGATGAAATTAATTCAATTTTACAAGATGTTAAACTTAGTTTAACTATGGCTTA
TAAAATCATTAATAGTGATATTGGTGAAGAATTCGATCATGGATTAATTGAACAAATTAA
TCAATTATTACAAGAATTTGGTGGTCCTATAATGAGTGAATTAATGCCTCAAAGAAGACG
TGGTAATGATGATGATGATGATGATGAAATAGAAGGTTGGGAAGATGAAATTGTTCNNNN
>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNn>Nn>Nn>NNNNTTCTTGTTATTTATATATATATATATATATA
TTTCATTAATATCCTTATTATAGACATATGGAAAATTTTAATTTAAATCTAATTGATTTA
GCAACATCTCGTAGGAGTAGAATGCNNNNNNNNGCATTGAAAAAGTTGATCAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAGAAATTGGAAGTATTTGGAATACTTTATTTAACAACAACTACAACAAT
TAATCAAACTCATACTTTCCACATTACACCATAACATACA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TGCTAATTTAACAAAAACTAATAATTA: -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257

>C1_13380W_B	Upstream Sequence Complementary Strand
TGTTAATCTACTATTATTATTAGGCCTTAGAATAAGTAATAATAGTAGTTAATCTTAAAG
AGTTGTTTCTTGAGTTCTTCGTTAACTTCGTAATAATTTTAGAACCCTTAATAAATTTAA
CTTTTTTAGATTTAATCTTCTTTACCGATTGTTACGATTTTGACTAGTTGTTGTTCTTCG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACAATCACCATTAAGACCACTAAGTAAACTTTAACC
ATACCTTATACAACTAAACTAAGTTGGTAATTAATGTAATAGTTCTATACGATAACTTAA
TCTTGTTATACTATATCGATATGTTTAGTCATTATTACAAGTTCTATAATTACTTTTATA
TAACCTATCAATAATATAACTTTCAAACCGGTTATAAAATTTTAACTTTTTTTAAAATAT
AGGTTTACTGGTTTTAATATTTCTATAACTTAATAGTCTTTAAAACTTAGTTCAGTTACC
ACTATTACTACTTTAATTAAGTTAAAATGTTCTACAATTTGAATCAAATTGATACCGAAT
ATTTTAGTAATTATCACTATAACCACTTCTTAAGCTAGTACCTAATTAACTTGTTTAATT
AGTTAATAATGTTCTTAAACCACCAGGATATTACTCACTTAATTACGGAGTTTCTTCTGC
ACCATTACTACTACTACTACTACTACTTTATCTTCCAACCCTTCTACTTTAACAAGNNNN
>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNn>Nn>Nn>NNNNAAGAACAATAAATATATATATATATATATAT
AAAGTAATTATAGGAATAATATCTGTATACCTTTTAAAATTAAATTTAGATTAACTAAAT
CGTTGTAGAGCATCCTCATCTTACGNNNNNNNNCGTAACTTTTTCAACTAGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTCTTTAACCTTCATAAACCTTATGAAATAAATTGTTGTTGATGTTGTTA
ATTAGTTTGAGTATGAAAGGTGTAATGTGGTATTGTATGT