C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

CR_09500C_A

Promoter Sequence

Consensus
TGCTAATTTAACAAAAACTAATAATTA: -76 -75 -74 -73 -72 -71 -70 -69

>CR_09500C_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CTTCGAGAAAATAATAAAGATTTAGTAGAAAACATTCATGCGGTATCAATTGGTCCATTA
AAATCACAAGACATTTTACGTACTGCATTAGCTAAAGGAGCTGATAATTCAACATTAATT
GAAACATCAAATGATTCAGTTAATAATGATGTTGAACCATTACAAGTTGCTAAATTGATT
AAAAAAATTGTTGAAAAAGATAATTCTAATTTAGTCATATTAGGGAAACAATCAATTGAT
GATGATTTTAATCAAACTGGACAAATATTAGCAGGATTATTAAATTGGCCTCAAGCTACC
AATGCATCGAAAATTGAAATTGAAATTGATAATGATAATGAAAATAATCAAGTTTTAGTT
ACGAGAGAAATTGATGGTGGTGAAGATATTTTGAAAAGTAAATTACCAATGATTATAACT
ACTGATTTAAGATTAAATGAACCAAGATATGCATCATTACAAAATATTATGAAAGCTAAA
AAGAAACCATTAACAAAATTGAAACCTCAAGATTTAGGTATTGATAAAATTGAAAATAAA
TTGGAAATTTTGAAAATTGAAGAACCACCAATTAGACAAGCAGGTGTTAAAGTTGATAAT
GTTGATCAATTGATTGAAAAATTAAAAGAATTAAAAGCCATTTAAAGGGAAAAGTATTAC
TTTGTTAGAGAGTTATTGCTTATGTTTTTTTGGTTATATAAGTTGTTTACTTATAAGTAT
ATATATATATATAACATGTAATATATGTTAATTGTTAATTGATTGATTGATTGATTTATA
TTTACTTTGTAAAAACCGGGTAAAAAAAGAAATTAGAATTTTTTCTTCTTCTTCCCCAAA
CCTTGTAAATATTTTTTTTGACCTGACCTCTTTCAGACAACCTCAACCACAACCACCGCC
CCACACACACAAAAATATCGATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNn>Nn>Nn>Nn>NNNNGC
AATTCTCTCCCCCACCCCCCCCCCAACCCCTCCACCCCAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TGCTAATTTAACAAAAACTAATAATTA: -39 -42 -43 -44 -45 -46 -47 -48 -49

>CR_09500C_A	Upstream Sequence Complementary Strand
GAAGCTCTTTTATTATTTCTAAATCATCTTTTGTAAGTACGCCATAGTTAACCAGGTAAT
TTTAGTGTTCTGTAAAATGCATGACGTAATCGATTTCCTCGACTATTAAGTTGTAATTAA
CTTTGTAGTTTACTAAGTCAATTATTACTACAACTTGGTAATGTTCAACGATTTAACTAA
TTTTTTTAACAACTTTTTCTATTAAGATTAAATCAGTATAATCCCTTTGTTAGTTAACTA
CTACTAAAATTAGTTTGACCTGTTTATAATCGTCCTAATAATTTAACCGGAGTTCGATGG
TTACGTAGCTTTTAACTTTAACTTTAACTATTACTATTACTTTTATTAGTTCAAAATCAA
TGCTCTCTTTAACTACCACCACTTCTATAAAACTTTTCATTTAATGGTTACTAATATTGA
TGACTAAATTCTAATTTACTTGGTTCTATACGTAGTAATGTTTTATAATACTTTCGATTT
TTCTTTGGTAATTGTTTTAACTTTGGAGTTCTAAATCCATAACTATTTTAACTTTTATTT
AACCTTTAAAACTTTTAACTTCTTGGTGGTTAATCTGTTCGTCCACAATTTCAACTATTA
CAACTAGTTAACTAACTTTTTAATTTTCTTAATTTTCGGTAAATTTCCCTTTTCATAATG
AAACAATCTCTCAATAACGAATACAAAAAAACCAATATATTCAACAAATGAATATTCATA
TATATATATATATTGTACATTATATACAATTAACAATTAACTAACTAACTAACTAAATAT
AAATGAAACATTTTTGGCCCATTTTTTTCTTTAATCTTAAAAAAGAAGAAGAAGGGGTTT
GGAACATTTATAAAAAAAACTGGACTGGAGAAAGTCTGTTGGAGTTGGTGTTGGTGGCGG
GGTGTGTGTGTTTTTATAGCTAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNn>Nn>Nn>Nn>NNNNCG
TTAAGAGAGGGGGTGGGGGGGGGGTTGGGGAGGTGGGGTT