C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C3_01590W_B

Promoter Sequence

Consensus
TTWRSCGCCG: -159 -158 -157 -156

>C3_01590W_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAGCTCTAGAATCTATTAATAATCTAACTGAAGTTATTGAAATAAATGCTAATGGGAAA
AGAAAGAATTTATCCAGAACTGGTTCAAACAATTCTGCTGTTACCCAATGTTCGTCTAAT
GAACTAACTCACGATCGTACAGAAACAGAAAATTCTAACCAACCTTTATCTTCCAGAAAT
TCTGCATCACCACTAATATCAACCGGAAGCTCGATTAAGCAGTGCGATACATTAAAACAA
ATTGTTGGGGATAATGGCAATGGAGACGGCAATGGCACAACGGATAACAATAGCGTACAC
CAACAAAACTTAGAACAACTACAAGGAAAATTGTCTCTAAATGATACCAGCACTTCAAAA
ACTAAAGAAATTGCAACTTCTCCTATGGCAGTGCCTTCGGCCACAACTATTGAAGATTAT
ATTGTTACTCCTTTTCATCTTATGGAAAACATAAATTTAATTGGTGAAGAACCATCAATT
CTCGAACTAGTGAGACCTTTGACAGTTGATTCTGTTATATTGAATTATGTTCGATTAGTT
GAATTTTTAGTTTCCAATTATCCAGATTCAAGAGACGGAAATTATCAAAACAATCCACGT
TATCAAGAATTAAACCTCATTGATCATCATGATAATTCGTTATATCTATCTACATTATTA
ATAATTCTAACTTTAAATCAAATTATTGCTGAAGTTCTTATTAAATTGAAGAAACAAAAA
TTCAAGAAATTTGTTCGATATCCTAAAAAATATTTATTGTCACGACCATTTAAGAACTTT
AAAAATTTGTGTCATTTTAAAGTATTAGAAATATTCACATTGATTGAGAAAAACTTCATT
CNNNNNNNNNN>N>NNTAATTCCCCAAAACAGGGCCCATAGATCTAGTTTTACCAGTAGCAG
TACTGAAGTGCATACCTCATCCAGCATAGCCAGTACCAATAATCACCACCACAACAACAA
CAATAACAATAACAATAATAACGGTCAAATACAATCTTTT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TTWRSCGCCG: -143 -146 -147 -148 -149 -150

>C3_01590W_B	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTCGAGATCTTAGATAATTATTAGATTGACTTCAATAACTTTATTTACGATTACCCTTT
TCTTTCTTAAATAGGTCTTGACCAAGTTTGTTAAGACGACAATGGGTTACAAGCAGATTA
CTTGATTGAGTGCTAGCATGTCTTTGTCTTTTAAGATTGGTTGGAAATAGAAGGTCTTTA
AGACGTAGTGGTGATTATAGTTGGCCTTCGAGCTAATTCGTCACGCTATGTAATTTTGTT
TAACAACCCCTATTACCGTTACCTCTGCCGTTACCGTGTTGCCTATTGTTATCGCATGTG
GTTGTTTTGAATCTTGTTGATGTTCCTTTTAACAGAGATTTACTATGGTCGTGAAGTTTT
TGATTTCTTTAACGTTGAAGAGGATACCGTCACGGAAGCCGGTGTTGATAACTTCTAATA
TAACAATGAGGAAAAGTAGAATACCTTTTGTATTTAAATTAACCACTTCTTGGTAGTTAA
GAGCTTGATCACTCTGGAAACTGTCAACTAAGACAATATAACTTAATACAAGCTAATCAA
CTTAAAAATCAAAGGTTAATAGGTCTAAGTTCTCTGCCTTTAATAGTTTTGTTAGGTGCA
ATAGTTCTTAATTTGGAGTAACTAGTAGTACTATTAAGCAATATAGATAGATGTAATAAT
TATTAAGATTGAAATTTAGTTTAATAACGACTTCAAGAATAATTTAACTTCTTTGTTTTT
AAGTTCTTTAAACAAGCTATAGGATTTTTTATAAATAACAGTGCTGGTAAATTCTTGAAA
TTTTTAAACACAGTAAAATTTCATAATCTTTATAAGTGTAACTAACTCTTTTTGAAGTAA
GNNNNNNNNN>N>N>NNATTAAGGGGTTTTGTCCCGGGTATCTAGATCAAAATGGTCATCGTC
ATGACTTCACGTATGGAGTAGGTCGTATCGGTCATGGTTATTAGTGGTGGTGTTGTTGTT
GTTATTGTTATTGTTATTATTGCCAGTTTATGTTAGAAAA