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Orthologs
Standard Name
CAGL0L11946g Systematic Name
CAGL0L11946g Alias
CAG62261.1, CAGL-CDS0024.1, CAGL-IPF8339 Strain
CBS138 Description
Uncharacterized ORF; Ortholog(s) have RNA helicase activity, role in spliceosome conformational change to release U4 (or U4atac) and U1 (or U11) and U4/U6 x U5 tri-snRNP complex, U5 snRNP localization External sources
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>CAGL0L11946g CAGL0L11946g
ATGACTGATGAGAAGTCCAAGAATAATATCAGAGAGATATATCGTCATGATCAAATGTCT
AACCAAGTGCTGAATCGAGATAGGCGGTTCGAGGACAGGAAAACCGATATCAAGACTGAT
GCTGAGATGTCTAATCCCAAAACACTCCGAGGTCATGTTTCACTGAAGGATATGGGCAGT
GGACTTAATATATCCAAGTCGACTGATGAAGATAAGGCTAGGATTTTGGAGGAGTTACAA
GATGAAAGCATATTAGATGGGGATCAGGAAGTCCCGGAGAGGTCTCCAGCTCTACCACTA
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AGTGATGTTCCAGAGGATATTATATTGGGGACCACGGATCTTATTATCTCTCTTATTAAA
GAAAAAATAACAGATACTAATGCTAAGGATTTGAAGCTAGTTGTAGAAAAAGAATTATTT
ACACGATTAAGAGATTCAGACTTCAACAAACTTTTGAAGCTAGTTGATTCAATATCGGAT
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GATGGTGGTGATATTATAGACACTAATGATTCCTTAAAAAACCCACTACTTATCGATGAC
TCTGTTCCTAAAGATAATAATGACTATAACGAGAAGATTAAAAACCTTGAAAACGATAAA
GACAGCATACTAATCAAGGGCAACAAATCATATTTACCAACTGATATCCCAGCTACTCAA
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ATTGAGTCGGTAGGCGATGATGTGAGTTCTACACTGATACAATTTATCAAACACAATGGT
ATAAAAATCAAATGGGCACATGAATTTTATAATTCTCAAGGAAATGAAACTAGTGTAATT
GAGAGAATAAAAAATAGTGGCCAAGCTGATATAGCAGAAGAGTTCAAATTACTTATAAAT
GGGTCATCACGCAAGCGTAAATCATCAGAAGACAAATCTGAGTATGATTATCCCGACAGT
ATTCCTCAAAAAAAACAGGATACAATGATTAAATTCAGTACTAATGACTTAAAAAATTTA
GCCTCAGCTAAAATATCTGGCAACCTTTCACAGAATATAACAGTAACATTACCTGAGGGG
TCATTTAAAAGGGTAAGAGAAAATTTAGAAGAAATCCATATCCCTGCACCACAGAAGCCT
GTATATGAGTCTGAGTTAATTAACATATCTGATCTTCCTAAATGGGCTCAAAAGGCTTTT
CCATCGAAAGAAGTTACGACTCTTAACTATATACAATCCAAAGTGTACCATAAAGCCTTT
CACGACGATAAAAATCTTTTAATGTGTGCACCTACTGGTGCAGGTAAAACAAATGTTGCA
GTATTGACAATATTGCAAGTCTTATCGCAATATATTAATGAAGATACGGACTCATTAAAA
CTTAACGACTTTAGAATTGTCTATGTTGCACCTTTGAAGGCGCTAGTCCAAGAACAAGTT
AGAGAATTCGAAAGGAGACTATCAAATTTTGGTATAAAGGTATCCGAACTAACTGGTGAT
ACAACACTAACTAGATCTGAAATAGAGAAATTTCAAGTCTTAGTTACCACACCTGAAAAA
TGGGATGTTCTGACTAGAAAGAATGACGAAAATGATATTATGCTAAAACTAAAGCTTCTC
ATCATTGATGAAATTCATCTTTTAAACGACCAACGTGGACCTGTATTAGAGAGTTTAATA
ATGCGTGCCAAAGAGAACTGTCGACTAAGATCAAATCCTAGGATTATTGCACTTTCTGCT
ACTTTACCAAACTATGAGCAAGTTGCTAAATTTTTACAAGTTCCCGAAGAATCCATATAT
TATTTTGATAACTCATATAGACCATGTCCATTATCACAGGTGTTCTGTGGTGTCAAGTCT
ACTAATTCTGTAAAGAAATTATCTTTTGTGAATGAAGTTTGTTTTGAGAAAGTCTGCGAT
GCAGTTAAAGATGGCCATCAAGTCATTATTTTTGTACATTCCAGAAAAGAAACTACTCGT
ACAGCTAAATTTATTGCCGATAAATTTAGCTCTCTTGAAAAGAATATACTCTTTTTCGAA
GAAAACTCGAGATCAATTTTAAAATCAGAAGGCGAGAACTCCAAAGATATTGATCTCAAA
ACTTTATTACCTCAAGGTATTGGAATTCATCATGCCGGTCTAGCCAGAGACGATAGATCT
TTATCTGAAGACTTATTTGCAGATGGTGTCTTAAGAGTATTGGTGTCAACCGCTACTTTA
GCTTGGGGTGTTAACTTACCAGCCCATACTGTTATAATCAAAGGTACTGATATATACTCA
CCTGAGGTGGGCAATTGGATAAGACTATCTCCTCAAGATTTACTGCAAATGCTTGGTAGA
GCAGGTCGTCCTAGATATGATACTTCTGGAGAAGGAATAATTATCACAAATCAAACAGAT
ATTCAATACTATCTGGGAATTTTAAACCAACAACTTCCAATAGAGTCGCAATTTTTATCA
AAATTTGTGGATAACTTGAATGCTGAAATTTCTCTCGGGATGGTGAAAACTAAATTGGAT
GCAAAAAGATGGATAAAGGATTCGTACTACTACGTTAGACTTTGCTATGATCCTAGTACT
TATCTTCCGGAAAACTTCAAGGAGATAGATAACGATAAGCGTATTTCTTGTTTCATATCA
GGCTTGATTGATGCTGCTATTGAATTGCTATTATCTATGTCATTAATAATGATCGATAAA
AGAAATGGTACATATATTCCAACAAAGCTGGGCAGAATAGCTTCTCATTACTATATTAGC
TGCAATTCAGTTGCAAAATATTTTCAGAGGCTCAAAAAGACTTGTTCAAAGTCTGAGCTG
TTCCAAATATTCTCAGAATCAGAGGAATTTAAGTATGTTAGTGTGAAACAGGAAGAACTT
ATTGAACTCAAGACCTTATATGACAAATCACCAATCCCCGTTTCTGTGCCCTTAGAAGAA
CCTTCTTCTAAGATCAACCTTTTACTACAGGCGTATATTTCAAAAATAAAGCTCGATGGA
TTTGCTTTAAATGCAGATATGATTTTCGTTACTCAAAATGCTGGACGACTTTTGTCAGCA
ATGAAAGAAATCTGCCTTGTTTTTGGCTGGTCAACCACAACAAAGTACCTTCTGGAGTTA
ACTAAGTCAGTACACTATCAAATGTGGCCCGTCTGTACACCATTAAGACATTTCAAAACT
TGTCCAAAAGATGTAATTAGGAGAGCAGAATCTTCTAGCTTTCCTTGGCAGAACTATCTC
AAACTCACAAAGGCATCTGATGTTGGAAAGGTTATAAGAAATGAGAAATATGGGAAGTTG
GTATTAGATTTATTACAACGGTACCCCAAATTAGAAGTGAGCTATATCTGTCAACCTATA
ACGCCAAGCTTAATTCTGATACAACTGGAAATTCTTCCAGACTTCGTTTGGGACCCTAAA
ATTCACGGATTTGGCGAAATATTCTTTGTATTGGTAGAAGATGTTTCGGGCTCGTCAATT
TTATTCTCTCAAAAAATTGTTATAAAAGAATCTGATGTGGGAAAAGAATATGTATTGAGT
ATTCCTATTCAATTATCTGTATCACAACAAAAAAGACTCCCCCCAAACATCTTCATCACA
GTTACTTCAGAAAAATGGAATCAATTCTCTAAGGTCCTACCAATACAACTGAATAATTTG
AAACTACCTAAAAAACTTCCATCAAAAGAAATTGTCAACAGTATTGAATCTCTGAATTTA
TCTAAAGAATTACCTAGTGATTTTGTGAAGGCACTTGGCTTCAATTCTCTGAACAAAATT
CAGAGTGACGTATTTAACGAAGTATATCATGGAACCGAGAGCTTATTAGTTTGCTCTCCA
CCCTGTACAGGAAAAACAACACTAGCATTACTTGCCACTCTTTCACATATAATTAATACC
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TGGATGATCTTTTTTAAGTCAATAAATGATAGCATCAAGGTCGGGAAACTAGGAGGCAAT
CTCCAAGATAACTTAATTACTTTTTCTCATTCTCACATAACTCTGACTTCGCCGCAGCAG
GTAGAAGTGTTAACTCATAGGTGGAGGAAACTGAAATTACTACTTGACGTCGACCTCCTA
GTTTTTGATGATATTCATGAAATAGGCCAGGGACTGACAGGAGCCAACTACGAGATTGCT
GTTTCTAGATTCAACTTCATCAAAACCCAAGCAGACTTCAACCCAAGAATAATAGCATTT
AGTAATTGCCTCTTGAATCCATCAGATATTGCTGGTTGGATTGGAGTTAAAAAAGAAAAT
ACACATAACTTCGCGACCGACGAAGATCAGAGTTATAGGGTTATAAATATAAAAGCGTTT
GAAAATATATTTGCGAACGATTATACAAGATCAATGCTATTATATGCAACTAGTTTTGTA
TTATCATCGCAATCAACTCTGGTGAAAAATGTCCTATTAGTAACGACCGGAAAAGTTGGT
GCTTTACGTGCTGCAAATGAAATACTAGCCTTATTGAAATCAAATTCTAAGCTTCACAAA
ATAAGTGAAATAACCGACTTTGGCATTGATCAACAAGACATGGAAAAGTCTGCTCAGAAG
TATCTATCTTACGGTATCGGGCTATGTCACGAAGGCATGAAACATGCTACAATCTCTAAT
ATAGTTAATTTGTTCAACGCTGGTGTAATTTCTGTTCTAATATCATCTAGATTCACAATG
ATTCAGAATATCAAACCAAGTCAAATTGTTGTTTTAGGCACAAGCTGGCATAACTGTGGA
GAAAGCTCCCCAGTACACTACTCAATAAACGAAATTATGAATCTAGCTAATTTAAGCTAT
CATCATTCATCAGATGTTACTATTTTGACCGATTCCAACAGACTACCACTTTATAACAGA
TTTTTGAATGATGGCATACCGGTTGAAAGTTTTCTTTATGAAAAGTTGATTGATTTGTTA
CTTACTGAGGTAGTCATTGGAACAGTAAAATCCAGGCAAGATTGCCTTGACATACTAACT
TTCACTTATTTCTACCGTAGAATTCATAATAATCCATCTTATTATGGTTTGAAAGATGCC
AGCTCCTTATCTATATCAGGTTTTCTCACTGAAATAGTTGAAACTGCTATTAATGACTTG
AGCACTTCTCAATTGATTAAGCTTGTCAAGGGTTTAAGCTCCGACGATATTCATAATGAG
ATTATTGAAGAAACCACATGGTCCAGAATTTCCACTATTCATGGCATCTCTGCTGCTACA
CTAATTGGTTATATCCAATCCTTAGATGGCAAAACAACATTAACTGATATGTTGCATCTT
TTAGTCAAGACTTCTGAATTATCAGCAATTGAATTTCATGAGGATACGCTATCAATAGTT
CATAAGTTAGCGGCTTTAGTACCATTGAAATTCCAAGGCATATCTAAAATGGAGTATTCT
TCATACGCCTCTTTTGTTTTATTACAATGCCATTTTTCTCGCATTTCTATTCCTTATGAA
CTAGCAGACCATATCAATAAAATATTACTTGTGATACCGCAATTGCTCAGCTCAATGATA
GATATACTTGCCAGCCAAGGCTTAATGAGTGCCCTGACTGTGATGGATATGTACCAAATG
GTAATGCAAGCATTATGGGACATTGATAGTCCTTTGAAACAAATACCATACTTTACAAAT
GATATCATAAAGATTTGCAAAGAAAAGAACATTGATTCGGTATATGACATTATGGAGTTA
GATGATGACGTAAGAGACGAAATATTATCCTTTAATGATTCCGAATTACTAAATATTGCA
AGCTTTGTTAACACTTATCCAAATATTGAAATAGCTCATGAACTGGACCACAAGGTAGTT
CCAATGGGAAGCTCACAAAATATTACCATAAACATATTTCGAGACGATGTACCTGATTCG
CTTGAAACTATAACACCATATTATCCTGCAAAACACCTTGAACATTGGTGGATTGTATTA
GGTGATGTTTCAAAGCAAAATGTCTATGCTATTAAGTATGTTAAACTCCCTTCGGAGAGC
AATCACTTTAAACTATCATTCTCGTTACCGGAACGAGGAACACATAAATTAACTATTTGG
GCTATCTGTGATTCCTACTTTGAAGCCGATAAAGAGTCATCATTTGAAATAGAATGTGTA
TGA Promoter Sequence
Download FASTA
>CAGL0L11946g CAGL0L11946g
GTAAGTCTTCAACTAACATTAATGACAAATTGCGTCCCGTCAAATACTTTGCATGTCTCA
AATATTCTGCAAAGCTATCCATATGGGATTGCCCAATTAAATTACTATTATTATTATATT
CGTTTATCACCTTCCTATTATCTGTCGTGGAGTAGTTATACGGTCCAGCCGTTAGATACT
CCTTCCTGATATTTGGTATATACTGCTCTGCCAGTAATTTAATAACTGTACTTTTAGAGC
ATCCACTTGGTCCAGTTAATAATAATATCCGTGGTCTTTGCATACTCGAGTTACTTTGGA
GCATTGACAGGAAAGCCTCCTTCACATCAGCGAGCTTCCTTTTATGCAAAGCTACCTCGT
CAATGTTTCGAGGGGAACAAGTTATATACCAGGCGCCATCTGTATTCTCTTGTGTTACAT
GGTTATAGTTAGATGTGCTTTCTAACTGTTCCAAGGTCTTCCGTAGGCTTCGCGGTCTAA
ACAACTGACTGATCTTCACCGGCGAGCTGGCCCTAGACGGTGTTCTAACAGGTGTACTCT
TCCCTGAAATATCCATTTCATTATAAATTTTATTGACTCTTTTTTGGTCCACTAGCCAAC
TCAAGATAAATGTAATAATAAACACTAGCGCTAATGAATGGAACCAATTGCCAATTCGCT
AAAATGTAGGATGCTAGGCTACTGACATACTCTAACATTTCGATTGTCTTTAAGAGCTCA
TCGCATCGCATCGTCAATCACGAATATAAACAATTTGAACAAATTTCACATACTGAAGGC
ATAAGGTTAATAGAAGTTAAAGATTGGGCCTATTCCACCCTTCAGTCTCTTACCAAGATA
ACGGACCAATACTACAGCTCTATATTATTAGAAAGTTAGCATAACAATATCTTTTTACTC
TACTTTTTTGGGCGTTGTATTTGGCCGACTCTACTTCAAGATCTTAATAAATTAACAAAT
AGAATTGAAAACAAGAAATAAGTTATAATAACAAAGCAAT
Chr coordinates
ChrL_C_glabrata_CBS138:1288688-1282266C
