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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name SCM4
Promoter Sequence

Consensus
CACGTG: -522
>SCM4    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTCAAGATATGCAATTACTGTCTTATCTTACTTCAAACCACACATTTGTAATCTATCTG
ATATACATATCTCTATATTCGGTTAATCGGATTGATAACTTAATCAGATATAAAAAAAAA
GAACAAATAAATTTTCCTTTATGATCATCGCGATTGGCAGCTGCCAAAATTCATTCATTA
TACACATTGATCCTCCCGTCTCACATCCCAGGTTTCAGGATCCTAAGCCAGGCACAAGTG
GTAGCTGCATACGAGGTGCGATCACTAATTATTTTGCTCTCGTCAGGTAAAAAGCAAATT
TGTTAAATAAAATGTATATCGGATATCGCTACTAACGTACCTACACCTACACTCGTTTAA
GCAATTCTGGTTTACCAATTACAATTACGAGCCAAAAAAGGCAAACAGACAAACAAACTG
CGCACAGACTACAGATAGCTGCAGCTACTATTTTCTCATACACCTAGCTTATCTAAGTCA
CGTG
TAAAATGTTATGATCCCAAATTATCAATTCGCAAAAAGTTCACGAACTTACAGCAG
AAGATGCTCCTTTTATCTCCACTAACACCTAACAATACCTGGGAAACAACTGAAATTCTA
ACGGACGCAACGGATTTTAGAAATTCTGTCTCCCAGCTATCCCACATGAAATAGAACAAA
GGACCAACCTACTCTCTTTGGGTTCCTAATCTTTCTATCCGCAGCCGAGGTTGCTGCAGT
AGTGTCTGTGCATGTGTAGGCCATTTCGTTGTCGTTTTTGTGTGTCCCCTCTCATGATAA
AAATCCCATTGTTCCCCTAGATGCTTGTGTGACTAGTTTTGCTTTATTATTTTTCTCAAC
ATAATAATTTATATATAAATATAGACCAAAACACCCACAAATCAAGTGTGTAACACATAA
TTGCATCTTAGAACTTGACAAAATTCATTTACTAACAGAATTATACATACAAAAAAAAAA
ACCCCGACTATAAACCACTATTAGAATATATTAATAAAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CACGTG: -516
>SCM4	Upstream Sequence Complementary Strand
AAAGTTCTATACGTTAATGACAGAATAGAATGAAGTTTGGTGTGTAAACATTAGATAGAC
TATATGTATAGAGATATAAGCCAATTAGCCTAACTATTGAATTAGTCTATATTTTTTTTT
CTTGTTTATTTAAAAGGAAATACTAGTAGCGCTAACCGTCGACGGTTTTAAGTAAGTAAT
ATGTGTAACTAGGAGGGCAGAGTGTAGGGTCCAAAGTCCTAGGATTCGGTCCGTGTTCAC
CATCGACGTATGCTCCACGCTAGTGATTAATAAAACGAGAGCAGTCCATTTTTCGTTTAA
ACAATTTATTTTACATATAGCCTATAGCGATGATTGCATGGATGTGGATGTGAGCAAATT
CGTTAAGACCAAATGGTTAATGTTAATGCTCGGTTTTTTCCGTTTGTCTGTTTGTTTGAC
GCGTGTCTGATGTCTATCGACGTCGATGATAAAAGAGTATGTGGATCGAATAGATTCAGT
GCAC
ATTTTACAATACTAGGGTTTAATAGTTAAGCGTTTTTCAAGTGCTTGAATGTCGTC
TTCTACGAGGAAAATAGAGGTGATTGTGGATTGTTATGGACCCTTTGTTGACTTTAAGAT
TGCCTGCGTTGCCTAAAATCTTTAAGACAGAGGGTCGATAGGGTGTACTTTATCTTGTTT
CCTGGTTGGATGAGAGAAACCCAAGGATTAGAAAGATAGGCGTCGGCTCCAACGACGTCA
TCACAGACACGTACACATCCGGTAAAGCAACAGCAAAAACACACAGGGGAGAGTACTATT
TTTAGGGTAACAAGGGGATCTACGAACACACTGATCAAAACGAAATAATAAAAAGAGTTG
TATTATTAAATATATATTTATATCTGGTTTTGTGGGTGTTTAGTTCACACATTGTGTATT
AACGTAGAATCTTGAACTGTTTTAAGTAAATGATTGTCTTAATATGTATGTTTTTTTTTT
TGGGGCTGATATTTGGTGATAATCTTATATAATTATTTTT
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