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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CAGL0C01617g
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -931
>CAGL0C01617g    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAGTGAAACTAAAAACAAAACAATAAAAACAAAATTCCCTAATGAGAAGGGACAAGATGT
ATGCTGGTACCAATGCACAATTAAAGGTGGTAGAGAGAGTAGAGATATTGGTGTTTGGGA
ACTAGCTAGAGCGTGTGAAGCATTGGGTGCTGGTGAAATTCTTCTAAATTGTATTGATAA
AGATGGTTCTAACTCAGGCTATGATCTTGAACTCATCAACCATGCTAAGGAAGCTGTGAA
AATTCCCGTTATTGCGTCTTCGGGTGCGGGAAACCCTGCACATTTTGAAGAAGGTTTCAA
GCAATCTGCTGCAGATGCTTGTCTGGGTGCAGGTATGTTCCACAGAGAAGAATACACTGT
AAATGATGTAAAGGAATACTTATTGAAAAAAGGGTTGAAAGTTAGAGTAGATAAAAACTA
AAACTAGGTTAAATAGATATAGAAGAAAGCCATTTACATTTTAACAGGTTTCAATCTTTT
GCATGATATCATATAAAATTAACAGTGATTGTCTATATTTTATAGTGAAGTGGCCAACTC
CGTATGATGTTTAATGTTCATTTATTATCACAGTAATATAGTGTTGCTATTTTTGAGTTT
CCTTCGTTGAAGTACTGGTTTTCTTTATTTTCCCTAAAACTCCGAGGTTTTCGAAAAGCT
TTGATATCAGCGGTTTAGCAAGTGAAATAATAAGCAAAAGACATATATTATTAGATAAAC
AAATAAGGGAGTGTCATAACTCTACAGCTACAAAATTTAAGTGAATACATTGAATTCTGA
TTGCTATTAAAATTGGAAACACTAATAAATAAAATGTTGGGTTGTGGATGAGGATTTAAA
AAAAAAAAAGGTATATAAGGCCAACAAAATATGAAATATGTAACAAAACTTTTCACTTTC
TTCCCATTCTCTCCATTATTAAACTATTTGTATTATTTGAGTATTTAATCATAGACACCA
AAAAACTAACATCTGTTCACTGCTGCTTTATAACTATAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -204 -854 -889
>CAGL0C01617g	Upstream Sequence Complementary Strand
TTCACTTTGATTTTTGTTTTGTTATTTTTGTTTTAAGGGATTACTCTTCCCTGTTCTACA
TACGACCATGGTTACGTGTTAATTTCCACCATCTCTCTCATCTCTATAACCACAAACCCT
TGATCGATCTCGCACACTTCGTAACCCACGACCACTTTAAGAAGATTTAACATAACTATT
TCTACCAAGATTGAGTCCGATACTAGAACTTGAGTAGTTGGTACGATTCCTTCGACACTT
TTAAGGGCAATAACGCAGAAGCCCACGCCCTTTGGGACGTGTAAAACTTCTTCCAAAGTT
CGTTAGACGACGTCTACGAACAGACCCACGTCCATACAAGGTGTCTCTTCTTATGTGACA
TTTACTACATTTCCTTATGAATAACTTTTTTCCCAACTTTCAATCTCATCTATTTTTGAT
TTTGATCCAATTTATCTATATCTTCTTTCGGTAAATGTAAAATTGTCCAAAGTTAGAAAA
CGTACTATAGTATATTTTAATTGTCACTAACAGATATAAAATATCACTTCACCGGTTGAG
GCATACTACAAATTACAAGTAAATAATAGTGTCATTATATCACAACGATAAAAACTCAAA
GGAAGCAACTTCATGACCAAAAGAAATAAAAGGGATTTTGAGGCTCCAAAAGCTTTTCGA
AACTATAGTCGCCAAATCGTTCACTTTATTATTCGTTTTCTGTATATAATAATCTATTTG
TTTATTCCCTCACAGTATTGAGATGTCGATGTTTTAAATTCACTTATGTAACTTAAGACT
AACGATAATTTTAACCTTTGTGATTATTTATTTTACAACCCAACACCTACTCCTAAATTT
TTTTTTTTTCCATATATTCCGGTTGTTTTATACTTTATACATTGTTTTGAAAAGTGAAAG
AAGGGTAAGAGAGGTAATAATTTGATAAACATAATAAACTCATAAATTAGTATCTGTGGT
TTTTTGATTGTAGACAAGTGACGACGAAATATTGATATTT
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