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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name UTR2
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -461 -221
>UTR2    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAAAAAGTCTCGTTGTTGCATAACATTTTTTCAATTTATTTTACCATTTTCTTATAAGA
ATAATTTGGGACAGGGGCTCATTACTTCATAACTATTTTTATTATTTTTTATTTTCTTTT
GGTTAATACCAAAAGGTAAATACTTGTTTTTATAAAAAATACTTCTAATAAGATATTCAA
CTATCAAAAAAAATAAAATAAAATACATTCTTCAACATACATAAATGTAATTTTACCAGA
AAGGGATAAATGCTATGTCGGACCTCTATTCGAAATTCAGAGCGGCACTAACTGATAAAC
ATCCAAACAACGTTTTTTACCACATTGGGAATTCTAAATGGCAATTACATATCCCCATTC
GCGTATACCCGCTCGCAACAACAAACGATTTTACATAATATGCACTATAGAAGTCACCAA
CCCATGTTTAGATATGGTTACTGGTAACCATACGACTACTGCTTTCGCCTCACAATCACG
AATTGATCAAGCAACCCCATTGCTATGCTCGTTAATTAAATTGAAGTTTAATTAATGTCC
CAAT
TAGGAATTCTACATCTATTACCTTATACACCATTTTAGTAAATCAAAGGGTCTCGA
GCAATTTCGCATCTGTACGTCACTTTCTCTCGATATACCGCCTAACCCGAAAATTTAATG
AAATTTCGCTCCTATACCCGATTAGGAAAATTAATGAAGCTGGGTTTAAATTGCAGAAAA
AAATGAAATTTTGGCGATTGGCGTGGATGGCTGGTTCTATGGTAATACTTAGGGAGTCAC
CAAT
AAACTGTCAACAGTAATACGCAACAATACGCATACTATTTTTGGTGTTTATAGGAA
ATGGTATAGCCATGGCAAAGCTGAAATAATCTTAATCGATGAGTACTTGAAAATATATAT
AAATAGACCCTGTTTCTGGATAAATGTATCTATTTTTATTCTGCCATTGTAATTGTAAAA
TACAAAATATAAACAACCCATCAAACATATAAAAACAGCA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -259 -672
>UTR2	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTTTTTCAGAGCAACAACGTATTGTAAAAAAGTTAAATAAAATGGTAAAAGAATATTCT
TATTAAACCCTGTCCCCGAGTAATGAAGTATTGATAAAAATAATAAAAAATAAAAGAAAA
CCAATTATGGTTTTCCATTTATGAACAAAAATATTTTTTATGAAGATTATTCTATAAGTT
GATAGTTTTTTTTATTTTATTTTATGTAAGAAGTTGTATGTATTTACATTAAAATGGTCT
TTCCCTATTTACGATACAGCCTGGAGATAAGCTTTAAGTCTCGCCGTGATTGACTATTTG
TAGGTTTGTTGCAAAAAATGGTGTAACCCTTAAGATTTACCGTTAATGTATAGGGGTAAG
CGCATATGGGCGAGCGTTGTTGTTTGCTAAAATGTATTATACGTGATATCTTCAGTGGTT
GGGTACAAATCTATACCAATGACCATTGGTATGCTGATGACGAAAGCGGAGTGTTAGTGC
TTAACTAGTTCGTTGGGGTAACGATACGAGCAATTAATTTAACTTCAAATTAATTACAGG
GTTAATCCTTAAGATGTAGATAATGGAATATGTGGTAAAATCATTTAGTTTCCCAGAGCT
CGTTAAAGCGTAGACATGCAGTGAAAGAGAGCTATATGGCGGATTGGGCTTTTAAATTAC
TTTAAAGCGAGGATATGGGCTAATCCTTTTAATTACTTCGACCCAAATTTAACGTCTTTT
TTTACTTTAAAACCGCTAACCGCACCTACCGACCAAGATACCATTATGAATCCCTCAGTG
GTTATTTGACAGTTGTCATTATGCGTTGTTATGCGTATGATAAAAACCACAAATATCCTT
TACCATATCGGTACCGTTTCGACTTTATTAGAATTAGCTACTCATGAACTTTTATATATA
TTTATCTGGGACAAAGACCTATTTACATAGATAAAAATAAGACGGTAACATTAACATTTT
ATGTTTTATATTTGTTGGGTAGTTTGTATATTTTTGTCGT
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