C.glabrata - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

SSB1

Promoter Sequence

No match found!

>SSB1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GTATTCCAGCATGTCAGGGGAAGAATAGTGGCTCAGTCCAGGTAAGAGTGTAAAATGTAA
AATCAGACGCCAACAGAAGACGCCAACAGAAGACGCCAACAGAAGACGCCAACAGAAGAC
GCCAACAGAAGACGCCAACAGAGAGCAGATATAAGTAGTGTATGCCCATAATTAGTACTA
GTTGTACCGTGTAATACGGTTGCTAGCTGTGGCATTAAGTACCTGTGTCGTGGGGGGCGG
TACCTTGCATAGACCACTCGTGAACACCGCAATACAATACAATACAATAAATTACAATAT
AATATAACATAATATAATATAATATAATATAATATAACATAATATAATATAATATAATAT
AATATAATATAATATAACATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATAT
AATATAATATAATATAATATAATGCAATACAGTGCAATACAATACAAGAAACCTAGTAGA
AGCTATATCATGTGACTTTCCGTACAAGACACGTATAATGCGTACACTATGATAATTCCT
TGTTTTGTCGTACTCAACGATTTTGCGCAAAAAGTTGAAAAATTTTCTGCAAAAAAAAAA
AATTTTTTTTTTCAAATTTTTTTTCAAATTTTCAGTTTTCCTGTTTTTCAGGTGAATTTT
CCTTAGAAAGGGCCGTACGAACGGGGTGAAATTTTCCATCCTTTTTGCATTTCCAATGCG
ATGAGCTTTGGGAATCGATGAGCACCCAATAGTGAGAGTTGTCAGAAACAATAGTTTTAG
TTTGGGCTTGACATTGGTGCTGGTGTGTGAATTGGTTGATGGCAATTGTTATTCTTTGAG
TAAATGAGCAAATGCAGGAGAGGGAAGGAAAAAAAATTTTCCTGGGTTTCTTAGTTTTAA
AGCTGTTTGGTAATTGAATGTACTTGAATATAATTTTGGGTATAGTGTAAATTTTGTAGT
TATCCGAATTACAGGAACACAACGATAAATACATTTTACA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCYYCCYYYW: -132

>SSB1	Upstream Sequence Complementary Strand
CATAAGGTCGTACAGTCCCCTTCTTATCACCGAGTCAGGTCCATTCTCACATTTTACATT
TTAGTCTGCGGTTGTCTTCTGCGGTTGTCTTCTGCGGTTGTCTTCTGCGGTTGTCTTCTG
CGGTTGTCTTCTGCGGTTGTCTCTCGTCTATATTCATCACATACGGGTATTAATCATGAT
CAACATGGCACATTATGCCAACGATCGACACCGTAATTCATGGACACAGCACCCCCCGCC
ATGGAACGTATCTGGTGAGCACTTGTGGCGTTATGTTATGTTATGTTATTTAATGTTATA
TTATATTGTATTATATTATATTATATTATATTATATTGTATTATATTATATTATATTATA
TTATATTATATTATATTGTATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATA
TTATATTATATTATATTATATTACGTTATGTCACGTTATGTTATGTTCTTTGGATCATCT
TCGATATAGTACACTGAAAGGCATGTTCTGTGCATATTACGCATGTGATACTATTAAGGA
ACAAAACAGCATGAGTTGCTAAAACGCGTTTTTCAACTTTTTAAAAGACGTTTTTTTTTT
TTAAAAAAAAAAGTTTAAAAAAAAGTTTAAAAGTCAAAAGGACAAAAAGTCCACTTAAAA
GGAATCTTTCCCGGCATGCTTGCCCCACTTTAAAAGGTAGGAAAAACGTAAAGGTTACGC
TACTCGAAACCCTTAGCTACTCGTGGGTTATCACTCTCAACAGTCTTTGTTATCAAAATC
AAACCCGAACTGTAACCACGACCACACACTTAACCAACTACCGTTAACAATAAGAAACTC
ATTTACTCGTTTACGTCCTCTCCCTTCCTTTTTTTTAAAAGGACCCAAAGAATCAAAATT
TCGACAAACCATTAACTTACATGAACTTATATTAAAACCCATATCACATTTAAAACATCA
ATAGGCTTAATGTCCTTGTGTTGCTATTTATGTAAAATGT