C.glabrata - PathoYeastract

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Standard Name

TIR3

Promoter Sequence

Consensus
CCYYCCYYYW: -812 -811 -262

>TIR3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTACTGAGAATTGTCTTCCCAACAGAACCCCTCGTACTAATAAAAAGACAAGAAACGCA
CAAGACCCAAAGAGGAAAGATTCTCGAAGGTGTCTGTTGCCGTTCAGTCGCACGGCAATA
TCTAGGCGAGAGGGGAGCAAGGAGTCGTTTAAATTAAGTTCCTGTATTTTCCCGTAGGGG
GCTTCCCCCCCTCCCCTTAAGCGAGAGGGTCCCCCCCATTGTTCCATTGTCTCTCTCACA
CGCAGAGGCTCGTATTAGTTCCAGTTGCCTAGACAAAGTCGCACAGAATTGACACCTTCC
TCTGAAATTATTATGGAGAACGCTAGGTCCGTTTAAGGGCCCAGCATGAGACAGAGAGTG
CCGTAGCGGCCTTGGCTGCGAGATCCGCCAGATGTGCAGAGAATATTCGTTGCTTTTTTT
TTCGCACGTACTGTAGTCTCGAGCCACCGCTTGAGGAGAGGTCGAATGGAAATTAGTGAG
GAGTATACGAAATAGCCCATTGTTTGAGGAGCTTGAAGGGTTTCATTTTAATTCGTTTGG
TTGCAATTTAATTGCATATGGACGCTTGGGACTGAGGAGTTATTTCGTTTACTTCGAAGG
AATGACTTTTTTTGTTCTTTAAACGTAATTTAAACTAAAAAGGGATTCTGTTTTGGCAAT
AATAAAATTCTCCATTTGACCGTTTTAGGTGGGCGTGTCTCTGCGGGTTGTACTGTTGTT
CTTCAAATTTGGAATTAACCTCCCCTTTGCCATATGCAAATTGTATCTTAATAATGTGAA
TAATCAGAGGGATCGATAATAAATGAAAAAAATTATTAATTGAATGAAAAAAAAAATGAA
AAAAAAATCTCGATTCATTGACTTGGTAATAATTCGGATCTCCCTATATAAGATTGACAC
CTCATCTTTGTTTTAGTTTGGTTATAACTCTTTCCCCTTCAATTGTGCTTTTTCTTCGAA
TATTGAAACCAATCCTAACATCACACATATATTTTTAAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!

>TIR3	Upstream Sequence Complementary Strand
AAATGACTCTTAACAGAAGGGTTGTCTTGGGGAGCATGATTATTTTTCTGTTCTTTGCGT
GTTCTGGGTTTCTCCTTTCTAAGAGCTTCCACAGACAACGGCAAGTCAGCGTGCCGTTAT
AGATCCGCTCTCCCCTCGTTCCTCAGCAAATTTAATTCAAGGACATAAAAGGGCATCCCC
CGAAGGGGGGGAGGGGAATTCGCTCTCCCAGGGGGGGTAACAAGGTAACAGAGAGAGTGT
GCGTCTCCGAGCATAATCAAGGTCAACGGATCTGTTTCAGCGTGTCTTAACTGTGGAAGG
AGACTTTAATAATACCTCTTGCGATCCAGGCAAATTCCCGGGTCGTACTCTGTCTCTCAC
GGCATCGCCGGAACCGACGCTCTAGGCGGTCTACACGTCTCTTATAAGCAACGAAAAAAA
AAGCGTGCATGACATCAGAGCTCGGTGGCGAACTCCTCTCCAGCTTACCTTTAATCACTC
CTCATATGCTTTATCGGGTAACAAACTCCTCGAACTTCCCAAAGTAAAATTAAGCAAACC
AACGTTAAATTAACGTATACCTGCGAACCCTGACTCCTCAATAAAGCAAATGAAGCTTCC
TTACTGAAAAAAACAAGAAATTTGCATTAAATTTGATTTTTCCCTAAGACAAAACCGTTA
TTATTTTAAGAGGTAAACTGGCAAAATCCACCCGCACAGAGACGCCCAACATGACAACAA
GAAGTTTAAACCTTAATTGGAGGGGAAACGGTATACGTTTAACATAGAATTATTACACTT
ATTAGTCTCCCTAGCTATTATTTACTTTTTTTAATAATTAACTTACTTTTTTTTTTACTT
TTTTTTTAGAGCTAAGTAACTGAACCATTATTAAGCCTAGAGGGATATATTCTAACTGTG
GAGTAGAAACAAAATCAAACCAATATTGAGAAAGGGGAAGTTAACACGAAAAAGAAGCTT
ATAACTTTGGTTAGGATTGTAGTGTGTATATAAAAATTTT