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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name HXT5
Promoter Sequence

Consensus
TTGCAAA: -498
>HXT5    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACAGCAACTCCTCCCCGTAACTATATTTTAAGGGGTCTCTCAACAGTGTACAAAGTTCAT
ACTTGCAGTTCTTGGAACTCCGAGAGTTTAGAGGAAGAGAAAGGTATATGTAACTATATT
CATTGTAGCAACCTAGCCTTGTCCAACACCAATTCCTTTTTGATATTAGAACAAACCTTA
GAATTATTGCCGTTAGTCCAGGTGTTAATTTAGATAGACGGTAATGTGCTGCGTGTTAAT
ATGGAAAGTTGCCCATCAGCACTGGTGTGGAGAAAATAGACTTTGTACTCTAGATGTATA
CAGACATTATTATAGTTATTTGAAGCAGGGGTTAGTGCATCCATACACACGGTAAAAATA
GTAAACGATAGCAACAAAACTAGTTCTGCACCTCTAATATAACAGCAGTTCGCTACAAGG
TTAAATTTAAACTGCTAGGGATGACTGTATCGCCAGAAATATCGTCCACATTCTTAGCCT
ATTTGCTCATCTTTACATCAACTTGCAAAATATAATAGGGATACCAATTATCAAAGTAGC
GGAAATTTGTGCCACTCTACTAGAGTATAATGGCAATAGTGTACTGAGGGGTTTAAAGGT
AATGTAAATAGGCCAGCATTTCCAAATAACTGCTTCATACTATACAAACCAGCAGGATTG
TTCTATGAGAACTTATTTCAACAGTAAAAATCCCTAAAAATTGGCATTACAAATGTAATC
TATTGTAAAAACAGCCGGATAATCGAACACCACCTGGCTCTAAAAATGTTCCTCCAAATT
AGTATAAAAGTAATTCAAACTATCACCCGAGTTATGTATATATCGAACTCCTCTTGAAGT
TGGCCTCCTTTTGCAATAAAAAATCCATATAACATTAAAATTGACCAAATACTACAAAAG
TGTTAACAGTTATATTTCATAGGTTTTTAATCCTTTAAATTTTGGAAAGTGTTATATTTT
TAGCGTTTGATAAAATTAATTCTATTATAATTTAGCCACA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TTGCAAA: -144
>HXT5	Upstream Sequence Complementary Strand
TGTCGTTGAGGAGGGGCATTGATATAAAATTCCCCAGAGAGTTGTCACATGTTTCAAGTA
TGAACGTCAAGAACCTTGAGGCTCTCAAATCTCCTTCTCTTTCCATATACATTGATATAA
GTAACATCGTTGGATCGGAACAGGTTGTGGTTAAGGAAAAACTATAATCTTGTTTGGAAT
CTTAATAACGGCAATCAGGTCCACAATTAAATCTATCTGCCATTACACGACGCACAATTA
TACCTTTCAACGGGTAGTCGTGACCACACCTCTTTTATCTGAAACATGAGATCTACATAT
GTCTGTAATAATATCAATAAACTTCGTCCCCAATCACGTAGGTATGTGTGCCATTTTTAT
CATTTGCTATCGTTGTTTTGATCAAGACGTGGAGATTATATTGTCGTCAAGCGATGTTCC
AATTTAAATTTGACGATCCCTACTGACATAGCGGTCTTTATAGCAGGTGTAAGAATCGGA
TAAACGAGTAGAAATGTAGTTGAACGTTTTATATTATCCCTATGGTTAATAGTTTCATCG
CCTTTAAACACGGTGAGATGATCTCATATTACCGTTATCACATGACTCCCCAAATTTCCA
TTACATTTATCCGGTCGTAAAGGTTTATTGACGAAGTATGATATGTTTGGTCGTCCTAAC
AAGATACTCTTGAATAAAGTTGTCATTTTTAGGGATTTTTAACCGTAATGTTTACATTAG
ATAACATTTTTGTCGGCCTATTAGCTTGTGGTGGACCGAGATTTTTACAAGGAGGTTTAA
TCATATTTTCATTAAGTTTGATAGTGGGCTCAATACATATATAGCTTGAGGAGAACTTCA
ACCGGAGGAAAACGTTATTTTTTAGGTATATTGTAATTTTAACTGGTTTATGATGTTTTC
ACAATTGTCAATATAAAGTATCCAAAAATTAGGAAATTTAAAACCTTTCACAATATAAAA
ATCGCAAACTATTTTAATTAAGATAATATTAAATCGGTGT
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