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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name TRK1
Promoter Sequence

No match found!
>TRK1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GAAATTATTTAATTTATGTATGCCTTGTTCAATTTTTTTTTATAATTTTTTATACTTATA
CATGCAATCTATTCATATTTCCAACTGTTTTTTTAATTCGGTTGTACTAGAAGGGCAATC
TTACCTCATAGTAAGAATTTAGCTATCCTTAAATTATAGGTCTTGTGTAAGCATTTTACA
GCAATTTTTGGGCAGTCTGATAATTGATATTCAGCAATAATTGATTTCCACTGATGGAAG
TTGATCAGCAATAAGGAGTTAGAGAAATGCATTGACGATGGCACACAAGGCATGAATAGC
AACAGGTATACAGACGTCATAACGAGGCTTGGTCCACTGATAGTATCGCATCACTTCCAT
ACGAGTTGTTGTTATTTTAATGTTTTGGTGTGGAACACGATGCGCATCAGTTAGCAACTA
GTGCTGTGATAAACAACATTTTTCGGTCCATTGATACAAACAATTTATCGCACTGCAAAA
AAACTGACGAAGTGAAAACCAGTGATGGCATACCGGGGTAATTTACTATTTATCAAATTT
AATGAACATGACATTTTAATATATTAATGCCATACCATTTTCTTGATCGGAAGTCTTAGT
ATAACAATTAAATAGGTTATTCTTTTGAGTTAAAGAGTCGTTGAGGGAGTGAATATCTAG
CAGAGGACACCCACTGCTCTCCATCCTCTTGTCTACATTTGCAGTTGATCTCTGTGGAAA
CGGATTCCATACACAAGAGTCAAAAAGTCGTGGATACCTTTTTGTTTTCAAACTCACTTC
TTTATTGTTCAGATACAAGAACGATTAGTTGAGATCTCAGCCAATTTCCTCCGGGTACAA
AACAATTAGGATTTACTAAGCGATAGATATTATCCCTAAGGTTTTGCTCTTTGACTAATC
TCAACTAAGACTTTCCATATCAAAAACAGATAGAATCTGGGAAGAAACTTTTTCTAATTA
TTATATTTGCAATATCTAAGGCAGGCATAAAAAGAATCAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TTGCAAA: -28
>TRK1	Upstream Sequence Complementary Strand
CTTTAATAAATTAAATACATACGGAACAAGTTAAAAAAAAATATTAAAAAATATGAATAT
GTACGTTAGATAAGTATAAAGGTTGACAAAAAAATTAAGCCAACATGATCTTCCCGTTAG
AATGGAGTATCATTCTTAAATCGATAGGAATTTAATATCCAGAACACATTCGTAAAATGT
CGTTAAAAACCCGTCAGACTATTAACTATAAGTCGTTATTAACTAAAGGTGACTACCTTC
AACTAGTCGTTATTCCTCAATCTCTTTACGTAACTGCTACCGTGTGTTCCGTACTTATCG
TTGTCCATATGTCTGCAGTATTGCTCCGAACCAGGTGACTATCATAGCGTAGTGAAGGTA
TGCTCAACAACAATAAAATTACAAAACCACACCTTGTGCTACGCGTAGTCAATCGTTGAT
CACGACACTATTTGTTGTAAAAAGCCAGGTAACTATGTTTGTTAAATAGCGTGACGTTTT
TTTGACTGCTTCACTTTTGGTCACTACCGTATGGCCCCATTAAATGATAAATAGTTTAAA
TTACTTGTACTGTAAAATTATATAATTACGGTATGGTAAAAGAACTAGCCTTCAGAATCA
TATTGTTAATTTATCCAATAAGAAAACTCAATTTCTCAGCAACTCCCTCACTTATAGATC
GTCTCCTGTGGGTGACGAGAGGTAGGAGAACAGATGTAAACGTCAACTAGAGACACCTTT
GCCTAAGGTATGTGTTCTCAGTTTTTCAGCACCTATGGAAAAACAAAAGTTTGAGTGAAG
AAATAACAAGTCTATGTTCTTGCTAATCAACTCTAGAGTCGGTTAAAGGAGGCCCATGTT
TTGTTAATCCTAAATGATTCGCTATCTATAATAGGGATTCCAAAACGAGAAACTGATTAG
AGTTGATTCTGAAAGGTATAGTTTTTGTCTATCTTAGACCCTTCTTTGAAAAAGATTAAT
AATATAAACGTTATAGATTCCGTCCGTATTTTTCTTAGTA
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