PathoYeastract
C.glabrata
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name VAR1
Promoter Sequence

Consensus
VDTASTAA: -580 -517
>VAR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAATATTTTAAACTTGTATAGTTTAAATGGTTAAAACATTTGTCTCATAAACAAATAAT
GTAAGGTTCAAATCCTTCTACAAGTATTAACTACAATTTAATAATATTATAATATATAAT
ATAATATATTATAATAATCTAATTAATTAATAATTAGATAAAATAAAAATAAAATAAAAT
ATGAAATTAATAAAATTATTAAAATTAAATATTAATAATAATAATAATAATAAATTATTA
TTAAAGAATTTATTATTATTAATAAATAAGAATAGATTAATAAATAAATTAAGTAATAAT
AATAAATATTTAAGTGAATTAAATAATAAAGGTAATAGTTTACAACATTTAAATAATATA
AATAATTGAAAATTACAGAATTATAATTATAATAAAAATAATCTTATTAATAATTATATT
AATAGTAAATTAATTAATAAATTATTATATAAATTAATATCATTAAAAAATAATAAAATT
ATTATTAGTAAACCATTATATAAAATTAATATAAATGTAATTAATATTAGATTTTATTAT
TATAATATAAATAATTATAATTATAATAATAATATTTATTATATTAATATAATTAATAAA
TTAATAAATAGATTAAATATTAATATAAATAATTTAAGTAATATTTTAAGTTATTATTAT
AATAAAAAAGTTATTATTGAACCTATTAAATTAAAATATTTATATAATAATAATGAAATT
ATAACTAAATATATTAGTTTATTAGATAATAATAAATATAATAATGGTTTATTAATAGAA
TATCAAAGACTATTAAATAATATTATGCCTAAATTAAATGATCATAATATCTCTATAAAT
TATATTAATAATATTAATAATATTAATAAATTAAAATATAATAATATTTTATTAAATAAT
AATAATAATATTAATAATATTTATAATAATATTAATATTAATAATAATATAAATTTATTA
ATGTTTAAATATTTAATTGGTTGATCTATTATGTTAAAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!
>VAR1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTTATAAAATTTGAACATATCAAATTTACCAATTTTGTAAACAGAGTATTTGTTTATTA
CATTCCAAGTTTAGGAAGATGTTCATAATTGATGTTAAATTATTATAATATTATATATTA
TATTATATAATATTATTAGATTAATTAATTATTAATCTATTTTATTTTTATTTTATTTTA
TACTTTAATTATTTTAATAATTTTAATTTATAATTATTATTATTATTATTATTTAATAAT
AATTTCTTAAATAATAATAATTATTTATTCTTATCTAATTATTTATTTAATTCATTATTA
TTATTTATAAATTCACTTAATTTATTATTTCCATTATCAAATGTTGTAAATTTATTATAT
TTATTAACTTTTAATGTCTTAATATTAATATTATTTTTATTAGAATAATTATTAATATAA
TTATCATTTAATTAATTATTTAATAATATATTTAATTATAGTAATTTTTTATTATTTTAA
TAATAATCATTTGGTAATATATTTTAATTATATTTACATTAATTATAATCTAAAATAATA
ATATTATATTTATTAATATTAATATTATTATTATAAATAATATAATTATATTAATTATTT
AATTATTTATCTAATTTATAATTATATTTATTAAATTCATTATAAAATTCAATAATAATA
TTATTTTTTCAATAATAACTTGGATAATTTAATTTTATAAATATATTATTATTACTTTAA
TATTGATTTATATAATCAAATAATCTATTATTATTTATATTATTACCAAATAATTATCTT
ATAGTTTCTGATAATTTATTATAATACGGATTTAATTTACTAGTATTATAGAGATATTTA
ATATAATTATTATAATTATTATAATTATTTAATTTTATATTATTATAAAATAATTTATTA
TTATTATTATAATTATTATAAATATTATTATAATTATAATTATTATTATATTTAAATAAT
TACAAATTTATAAATTAACCAACTAGATAATACAATTTTC
w3c xhtml validator w3c css validator