PathoYeastract
C.parapsilosis
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Download     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name CPAR2_401520
Systematic Name CPAR2_401520
Alias CPAG_03997
Strain CDC317
Description Uncharacterized ORF; Ortholog(s) have U3 snoRNA binding activity and role in maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA), positive regulation of transcription by RNA polymerase I
External sources Open in CGD external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CPAR2_401520 CPAR2_401520
ATGCCTTCCACTAGCATAGATGAATGGTCACTTTCCATGTTAACAGGTGGAGTACCGACA
TATTTCCCGTATTCACAAACTACAGCATCAGTATTCTCTCTCGATGGAAGATACTTGATC
ACTACCTTAACTCATCAGATTCGAGTATATTTTATATCCACTAGGCAATGCATTAAAACG
ATAGACCTTGATTTGAACGATTTGGCTGATATCAAGTTGGACGTAACGAATCCAAACCAT
GTAATTCTTTTCACAAGTTTTGGTGAAATCATTACTGTTAATTTCAAGGACAAATTGAGC
GAGCCAGTAGTGGCCAGGACTTCAATACAACAGCAATTGGGTAACTTGCTTTTGTTGTCG
GTGGTTTGCGTGAAACATAACAAGTTCGTTGTCATTACGGGGAAAAGGGACAAGAAGAAG
GGATTTAGTCCACATACGAGATTCATTAATTCAATCGATCGAACATCGGAGGTGGTATCA
GTCATTGGCGATGTTCCCAATGTGTTATTGTATGCCGTGTCCCTAGATTACAGAAAGTTG
GCATTTGTCATGCAAGACCACAAGGTATTGTTGTTGGATTTAGCCACCTACTACGCCAAT
AGTGAAGAAGATCCACAGGTGACGACGACATCAGTTCAAAATTTGGAGTCTTTGATTATG
AAAGAGGTGATACCTTTCCAGTATAGATCACCGATTACTTCTCTAGCAGTATCGAATGAC
TCATTAATTGCCTTGGGAACAAATGCGGGGGTGATTCAAATATTGTATGGTGGCTTAGTA
AACAATGACAAGTCGCAACAACGTGTGTTCAAATGGCACATTGATCAAGTGAATGCGTTG
CAGTTTTCGCATGATAACAATTACCTTCTTTCTGGTGGTGCTGAAAAAGTATTGGTATTT
TGGCAGTTGGAGACCGAAAAGAAACAATTTCTACCAAGATTGAATGGAGTTATTGACAAG
ATAAACATTGATAATAGCAAGAACGACTATATTGAATTGCTATTGAAAACGGGTGTCAAC
AATTACGAAATCTTGGTGTTGTCCTTGGTGGATCTTGTGTCAAGATTATCGGTAAATACA
ATAAGACCCAAGTTCACCAACAACCTAAAAACCACTTTATCTCGAACCAGGAAAAGGCTT
GTTAAAGAAGGTTTGGATCAGTTCAACAAACTCAAATTGAGATACGACTATAGTTGTCAA
TTTGAAATTCACCCAAAGACAAAAAACTTGTATTTCCCCAATGATTCATCAATTCAGTCA
TTTGATTTGGTCAAGAATGAACAAAGTTTTATTCAACATGCAGCACCAGTTTTACCCACG
GGTAAAGTACGTTCAGAAACTAAATTGCTCGATCCACAAATCTCACTACTTCAATTCACT
CAAGATGGTGAATGGATGTGTACTTACGATGAAGTTGCCAGTGCGGAAATCGATTGTCTT
TTGTCTACAGATGATAAGCAATATGCATTAAAGTTTTGGAAATTCGTTGAAAACAAAGAT
AAGGAGAAGGATAAAGATCGTGATAATCGAAATGGATATTGGGAATTAACGACAAAGGTT
ATTGATCCTCATGGGAAATCAACACCAGTAATGTCAATGATTCCAGCACCTGGCTCCTAC
TTCAATGGGGTAGCATTTTTAACTGTTGATAACAAAGGTGGACTTCGTGTATGGAGACCA
TCGTACCCTAAGGAAGCCTACAAGGTGGCCAATCCAGGTAATAAATCACAACAGATTACT
TGGACTTTGAGGAAGCAGAGGCCATCTTCAAATACAACATCCGACGCAGTAGCTTTAGCA
TGGTCAGATGATAGTTCCATCATATTTCTATCCCATGAATGTTCAATTACTTGTTTTGAT
AGTAGGACATTTGACCCATTGGAGTTTCAGCTACCTGTATTAACTGAGTCAAAGATCAGG
ACCATTAAATATTTGAACAATTACCTTGTTGTTTTATCAAAGACGAGATTTTTTGTTTAC
GATTTAATCAAGGGTCAATTGACAAATCTAGTCACCAGAGTGTCTACAACCAGTGGAGGT
AAAAACATGATGACCATCGACCCATCAAGGAACCTAATTTGTTTAGCAATCAATTCGTAC
ACCAATTACGAATCTGATTTGGAGAATTTACAAATCGGGTCTAAATTGTACATTTTCAAA
CCAGATCAATTGAAACCAGTATCGGTGCAAAATCACTCCCTGGGTATTGCTGCAGTGAGA
AATGACAGTAATGGATTCTTGTTTATTGATTTAGAAACACGTGTTGGATCAATGAACTCT
GCGTTGTTGGAGATGGAGTCAATTGAAGTGACTGGGTTGGCCAATGAGATTAATCAAATG
TTGATCACGGCTCAAGCAAATGTTGATTTATTAGATGATGGTACCACAGCACCAGTGAAA
TTCCAATCCAATGGACAAACTGAAAATATTGATGAGGATGATGGATCTAAAGTCATTGAC
TTGCATACATTCCAACCTATTTTCCAAAACCTTGATGGAATTCAAATAGAAACCATATTT
GATCGTATATCGAACATTCTCAAGTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>CPAR2_401520 CPAR2_401520
ATGACGCCAAACACTGATACGAGATACTATTGGAATTTGACAAAACACATTTTCAGATAT
TCGCCATTTTATACTGCCAACCTTTTGGAAAATGGAATACATTCAGTGGACGAGAAATTA
CAGTTTGATGCGCATTTGCAATTACATGCTTGGTTCTATGAATACTTGCAAGCTATCGAT
ACTGCCAAAGCGGGCAACTAGGGGAATAGAGAGCACATAGAATACAGGTAGAGCTTTACA
ATCACGAATCTTCGTAATGTAATAATATTTTATCTATAAGAATACATGGAGTTATAGTAG
CCTACAACGTTCTCTCTGGCCACAACCCAGATTCTGCGTGGTAAGCCAAATATGTTTCAC
TCCCTCGTTCCCTAATTAATTTCCTTCTTTTCCAAAGGATTGTATCTCAAAAACTTTTCA
ATCAAATCGACATGTGTTAGAACCATTCTTCTGCAACAATACCTCTTTAAGCCCAATTTA
GTTAGAGCTTCACCTTCAGGCATGGATTCATCTTGTAGCAACTCTAAATAAGTTTCCCAC
TTGTCGCCTACTACTTTACCGCAGGAGAAACAACGTATTGGAATAATCATGATGAAAATG
TGAAGGCTGTCGGGGGTTGTTTTTGTTTGTTCTTATAAATGGGACAAAAGATTCAAAGGA
GGTTGATTGAAGACTTTTTGGAGGCTGTGTATCGTGTGACGGAAAATTCTCTTCAGACAA
AGAAGTAGCAAGTCTTCGCTATGAAATGTAGAAATCAAGTATACAAAAGTGGAGAATGAT
AGTGTAATGATAACGTGATAATAGTTTAGTGATGATGGTGAATTTTCTCTTTTTTTTTTG
TCGATGTCTGGTGAGAACTTCTTTCATTCTTTTTGTGTTTCACTTTGAAGTCTCATTTCC
TCATCTCATTCAGCTAAAAAAATTTCAAAATCTCAGTGCAAAAGAGTTCTGCAAACACAT
ACACATACACACGCTCTCTTACTCGTTCACCATCCACAGG
Chr coordinates Contig006372_C_parapsilosis_CDC317:338457-335911C