PathoYeastract
C.tropicalis
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Download     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name Uncharacterized
Systematic Name CTRG_01239
Strain MYA-3404
Description Ortholog(s) have role in single-species biofilm formation on inanimate substrate, hyphal growth, positive regulation of single-species biofilm formation on inanimate substrate
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CTRG_01239 CTRG_01239
ATGGCAGAGGCAAATGCTGCGAGTATTTCTACTCATTACTACAAACTAGCCCATTTGGGT
AGTATCAATTATACGATATATGAATCTGCCGCAAATAATGACCAGGCATTGTTGGAACTA
GAGTTGACAATTAGACATCAGTTCCCGGAAATTTTAATCACTTATTACAACAAAAATTTG
TACTATTTTACATTTGGTCATAATGTGGAATCTATAATTGATTTGGTTAAAGAGTTCCCC
CAACTTTCTATTAAACAATCAGACACTGCAACTTCGGAGCAGTTTGCTAATCCATTAAAA
GTACCTAATGAATATTTAACCTATGCAGGTTTGAGTTTCCTCAAGGCAATAAAGAAAATG
ATTTTGTATAATTTGTCATTGCAAGGGTTGGTGAAGTTATTTGGAAACTACTGTGTAATA
TCAAATAAGGACCAATCGTACTCAATTCTATGTCTTGATCCTGTATTGTTTCAAAACGGA
GACTTGTTACTTTCATGCCTAGAAAAACCATCCGTCAGGTTATTCGATTCGTCACTTGCA
TACCCACAGGACTGTTCCATTGAAACAAATTATGTGATTTATTTAGTGCCAAGTGGGATT
AGGTGTCATTTGTTTGATGCAACGAACTTAAGAAACAATCTTGTTGAGAAACCACAAGTC
GAGAATGAAAAATTACTAGAATTATTAAGACTAACAACGGGTATTGATTGTAGCAAAAGT
AGTCTCTGGGTCAAACTTATCCCAAATCTAAAGCATTTAAACCATCAAACGTCATTTATT
GGCAAATTCATTCATTCAGTGGACAATAAAAAGTTCATACTTTGGCCGTGGGAATTGTGT
TTATTACAATTTGGAAAATTTGAAAATCTAAAACAAGAGATCATATCAGACACACCGGAT
ATAAACAATCCATTAAATTTAATTGCAGATTTTCTTGATTTTCAAATAACACACAATACC
CATTTACAACAACAGAAGATGTTAGCACAGGCGCAACAAGAACAACAACAACAACAACAA
GAGCAACAGCAACAGCAAGTGCCCCAAAATAATCAACTGCAACTGATGACTCATCCGCCA
TTGAGTGTTGGAAGTGTTCATTCTAATTCTGGAATTGGGTCTGTGACAGAAATCCCCAAG
GATATTGATTCTATTGGATTGAGTGCAACTACCCCAATGGATGCAGAAATGTTCACATTG
CAGAATACTGAAGAGTTTTTCAAAACAGATCAGGCCAATTTGAATCCAGGAGACGATACA
AATATCACGGAACAGAAAATTGAGAAATCTGAAGATGACGACATGGAGATTGACGAATTG
TTTGGAGGTGATGATAGTGATGAAGAACGCAATGAAGAAAAAGAAGACTCTAAAGAAAAC
TCAGTAAAAGTGGATGCAGATGATTTAGATGATTTGTTTGCCGATGAAAAATCAGAATCC
AATGTGGCAGTAGAAGAACCACAAAGTGAAGAGGTTGTCAAGGACCAATTACCAAATATT
CCTTCCGAAGAAGTGGAGAATAACAAAGAGAATTTGAAGCCAAAGGAAGTCAAACCTTCA
TATATTGACATTTTGAGGGATCAAATGACTATAAAAAAAATGGATGGTAGTCCTGACTAC
AAAGATCCAGGTGCGCCTTTGCCAATTGTGCCAACTCCATTAGTTCTGTCAACAATTACT
CAGTCAGCAAGCGCTACCAACCCACCAACTGTTGGCCCTTTTGAAGGAGCATATGATAAT
GTTAGTAATTCTTCTGCTGGTGTGTACGGACAGTCTGCTCCGGCACTGCAAATGCCACAA
CAGAAATCGGTTTTTTCACCAATTTTGTTTAATCCAATCATCAAAAGTGATATTGACACA
AAGTATGGTAAGGGTGGTAAGTTTTATGTCGACAAGGATTCCTCCAAGGATATCGATTTT
GAGACCAAGAAGAGAACATTGCGAGCAACAAGTGTCAGCGGTATGGAGCCATCGTTTAAC
ACAGAGGATAAAAAGAAACTTCAACAACAGATGGAAGTTATAGAATCGTCAACTACAAGT
AGTGGACTGGAAAATGGCCAAGATAATGAACATGAGGATGAAGGAGATGATGAAGATGAA
GATGATGATGATGATGATGAAGATGAAGAGGAAAGTGATGTTGATGAAGAACCTGATATT
GGGGATTTGACTCCATTGAAATTGAATACTTATAATGAATCAATGGTATATCAGCAGAAC
AATAATGTAGCTTCAACTAATAACATTGCTACAGGTGGACAGGAATTTCAGAATAATGGC
ACGGAAAAACAACCTTTTGCAAACTCATCATTAAACGCTGAAGGATTTGGTTCACCATTT
GCAAGTCAAATTAACAAATTTGCATTGAAACCAGATTCTCCATTTTCCACCAATGAGATA
CAAAGTTCTATGTCACCAATGTATTTTGATCCTCCGCAAAGTCAACAGTCGCCGCAGCTA
CAACCTACGGTTGGTAACCCCGATACTACAAGCAAATCAGCAGTATTAGATTCTCCATCA
AAAATTAGCGAGTCTTCGAATTACCTTCCATTGCTTTTAAGAAACATTAATGTTGCAACA
ATTCCATCATTGTTCTTGATGAACAATTTAACAAGCAACAAACTCTTGCCATCATTCACT
ATTAATGACGAAGATCTGGAAAATGATTTGGATATAACTAAAAGCAATGAAATGATTGTC
AAATTGGAGCATTTGAAAGATTTCCTTAGTTTTATAACTCCTAATATTGTATATGATCTT
GGATCCACCAGTTTTGATAATTTTCTGTACTACGTCAACAATGTTAAGGATTTATCAGAT
AGTGTTAGAGAATTAAGGTTACCACCAGAATCATTTTTTAATGGGTTAGCAAAGATTTTC
CCATTCACGTACCCCGTAAAGTTGATTGAGTTACTTCATGATGTGAAATCCTTGGAGATG
GAAGATCCGTTAGACAACCAGTTAAATTTCTTGAATGAAGTTGATAATGAAGATGAAAGC
TATGCAGATCCGAAAACACTTTACAAGAAGTTGAAAAGCATTGAATGGGATTCTTTTGAT
GTGAATAATGAAAATAAATTGAAATTTGAAAAGTATAAGGAAATAATCGGCAAATTAAAT
TTAGGAAATTCTATTAATGATGATGACTATTTTAAGTTACCTGTTGTTAAAACCCGTGTT
TTGAAAAATGGAAACATCTTGAATTTGAATAATGTTGGATTAGAATTCTGGAAGTATTTG
AATTTTGCTCCAGTAAAGAAGCAGAAGAATTTCCAAATATTGTTAATTGCCGAGGCAAAT
GGAAGCTCATCATCTTATGCGAGTGAGTTCTTGGCACAGTTGGTGCAAAATTATAAGGAA
AGTAACTTTGGTACTATTTCGAAGGTCAATCTATCTACGGTTGAGACAAGAGCTGATTTA
GACCCAATTTCGGATGGTTTAGTGTTGATAAGCAAAGACCCTAACCAGCTGTACAATGAC
TTTTACATTCAAACAAACAAAAAGTTGATCTCTTTGGTTGAATTAATCAAATTGGATTTA
ATCAACAAGACCAATAATTTTGAATTCGATAGACCGTTGTTATTGTTCTTTGTGAATTTC
AATGAAAGTTTAAACTCTGACTTGCAAATTTGCAAAATCTTTAGAAATTTCAAAGTTGCC
TTAATGAGTCATCAATTACCGTTGGTTGAAATATTCACCAAGATTGTTCCTTCGTCATTA
ATAGTCAAGAAGGTTAATCATGAGTCTACATTGAAGGTGTTTAACAACTTTAAGTTGACA
AAAATTTCCATGAATCTATACAATGAGTGCCCAAATGATTTAGCCAATAAAAATATAGCC
AAGAACATATTCACCACTGTTGTGAAGGAACCACCATCTAAGATCCAGTTCAAATTTATC
AACAACTCCTACAGAGATAATGGTTTTAATGATGATATCTTTTTGCATCTTGCCTATGAA
AGATCCATAGATAAAAATTGGTTTGTTGCATCCTGGTCTGATCCATTGGGACAAGCTGTT
TATACAAAGTCATGGTATTGCTCAGTTCCATCAGGGTCCGTTAATGATCAGCTGAGATCG
CACCACAGAAATGATACCATGGACGTTATGGCAATCACAGATGATATGTGGAATTGTTCT
ACTGAATTGTTCAAATTTTTAAATGATGAAATTAATTCCTTTGGCGGTAATACATTTGGT
GGTAAGAAATTCTTAGTCTTGACAAGAGTGAATAGCATAATTCCTGACGATGAGTTAATC
CATTGGAAGAGATTGAGTCTGAAGCATAAAGAGATTTCGCTTATAGTTTTGTCTGTGTGT
CAAACACCAAAAATTGTCAGTTCAAGTGAGTTGAAAGAAGTGGCAAACAAATCTAGCACC
AGCACATCACCGATGTCAATGACACAAGATAAGGATTCGTTTTTCAATTTCAAAACAGGT
TTTTCCATGTCGAATAATTCTTCACCAGCTTCAGGTGGAGCTTTGGTTATGTCTCCAAAT
GGATTGAGTTTCCATTCTCCACAACAGTTCCTTAACGCGCCAGCCAATTTCTTGTCTCCA
CAAGATTTCACACCTGGTGGCACATCTAGTGGAGGTATGGAAATTGATCCTGATATGATA
TTGGACCGTGCTGATAGCGATATCTATGGCGTTGTTCCAAGATTACCCCTTCCATCATTC
AACTCGCCTACAAGGTTTTGTATGAAAACAGGTTATTTGATGATGAACATCAATGATACA
GCAGATGAGTCTGATGAGGATGATACCAGAAAGAAATCATATATACTTTTTGAGATTAAT
ATTCTTAGTTGCTCAAACTATTGGAATTTAGATGTATTAATGAGATTGTTGATGTTACAA
TATAAGAAAATGATTGCTTTGAATAATATATTGTGCATGGAGTCTATCGATAACCCAGTT
GAAGGTTCAAATTACAGCGACAAAACCAGTCAATTAGTTCCCTGGCATATAAATGCTGTT
GGTAAATTATTAAATTATTTAGTACATATTTATGTTGATGAAGAGTAG
Promoter Sequence
Download FASTA
>CTRG_01239 CTRG_01239
TTCTTTACAAGTTTTAATCATATGATAAACGTACTTGAGTTGTTGATCCCTTACATACTT
GTAGTGTAAGATTTTAGCAATCACCTCGTGCGGCAAGATTAAAATAGAGGCAGAACTGGA
TGAGTCCCAATAGGAACTCAGTGGTCTGAGTGACTCAATTAGCTTCAATTTCATACCTCT
TGAATAGGACACTGATGAATAGAAGTGTAAACATAGACACATTTGACCCGTTGATACGTG
TTGCAAAAAGAAAAGAGATTTAAACTAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAAAAAAAAAACATC
TAGGGAACAACCACGCATCCAGATAATATTAACAAGTGTATAAAATAATAATCACGCTTG
GTGTTTTCTTTCATAATTGATTTCTTTTTTTTATATATATAAACATAATGTGTTTATTAA
TGGTCATGAGATATTTGACTTATTACATTCAAGTTTTTATCAATTTATTGTTGGTGAGAC
AACAAATGGATACCATTCGTTTACAACTGCCATGTACATGAAAAAAATGACTAGCAAATG
ACAACAAAAAGGAAACACAGACAGAACGAGAACAATGTCATAAATACAAACTTGTATAAT
CGCAGATGTTACCTAAACAGATCAAATCCCTAACATTGGTAAAGGTCGTTTTTTTTTTTG
AATCACAGGTATCTTACTGAACTAAAAGTGACCGACCAACCGACCAACCGACTGACGGAA
TGATTGAAAGGAGCTTTGATGAATGCGCGCAATCGGATTGATATTGTATTTATAAAGTAT
AATTTACCTAATTTTTTCTTGCCTCTCTTTCTCTCTGTATTCTGTTTGACTTCAGATTAG
TTTTTTTTTTCTTCCTTTTTTTTTATATATTTTTTTCCACTTCCTCTACCGCACCGATCT
ACTGTCCAACAAAGCTATATTCACTAGTTTAATTTTCAACTCACGTAAAGACAGTGTTAC
TACATTTATTTTTGAATCACATATTTCATCAATAATCAAA
Chr coordinates Supercontig_3.2_C_tropicalis_MYA-3404:342447-347474W