PathoYeastract
C.tropicalis
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Download     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name Uncharacterized
Systematic Name CTRG_02141
Strain MYA-3404
Description Has domain(s) with predicted protein binding, structural molecule activity, role in intracellular protein transport, vesicle-mediated transport and COPI vesicle coat localization
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CTRG_02141 CTRG_02141
ATGAAGATGTTAACCAAGTTTGAGTCCAAGTCTTCTAGGGCTAAGGGAATTGCTTTCCAC
CCAAAGAGACCATGGGCATTAGTTTCTTTACATTCCTCAACCATTCAATTATGGGATTAT
AGAATGGGTACTTTAATTGATAGATTTGAAGATCATGTGGGTCCAGTTAGAAGTGTTAAT
TTCCATCCTACTCAACCATTGTTTGTTTCTGGTGGTGATGATTATAGTATCAAAGTTTGG
TCATTAAATACTAGAAAATGTATCTTCACTTTGAATGGACATTTGGATTATATTAGAGGT
GTTTCTTTCCATCATGATTTACCTTGGATTATCAGTTGTTCAGATGATCAAACCATTCGT
ATTTGGAATTGGCAAAACCGTCAAGAAATTGCTTGTTTGACTGGTCATAATCATTATGTT
ATGAGTGCTCAATTCCATCCAACTGAAGACTTAATTGTTAGTGCTTCATTGGATCAAACT
GTCAGAGTTTGGGATATTTCTGGATTGAGAAAAAAACATAGTGCTCCAACTTCATCCATG
AGATCCTTTGAAGACCAATTGCAAAGACAACAATTACCTCAACAAGATATTTTTGGTAAT
GTCAATGCTATTGTTAAATATGTTTTGGAAGGTCACGACAAAGGTGTTAATTATGCTTCT
TTCCATCCAACTTTACCACTTATTGTTTCTGCTGGTGATGATCGTGTCGTCAAATTATGG
AGAATGAGTGACACCAAAGCATGGGAAGTCGACACCTGTAGAGGTCATACTGGTAATGTT
TTGAGTGCCATTTTCCATCCTCATCAAGATTTGATTTTATCTGTTTCTGACGATAAAACC
ATTAGAGTTTGGGATTTGAACAAACGTGTTCCAGTTAAACAATTTAGAAGAGAGCACGAT
AGATTCTGGCTCATTGCTTCTCACCCAACCATTAACTTGTTTGCTGCTTGTCATGATTCC
GGTGTTATGGTGTTCAAATTAGAGAGAGAAAGACCAGCCCATGCTATTTTCCAAAACAAA
TTGTTTTATGTCAATGGTGAAAAACAAGTTCAAGCTTATGATTTCAACAGACAAGAAAAC
TCCTTGCCAATGTTGTCTTTAAAGAAGATTGGTAAAGCTTGGTCATTTATGAGAACTTTG
TCATACAATCAAAGTGACAACTCTATTTTGGTTGTTCATGGTGAAGGTGACAATGGTAAT
TATGCTTTGATCAACTTGCCAAAACATGTCACAGGTGCCATTGAACCAACTGATATTAGA
CAAGGTGAAGCTAATTTTGCTACTTTTATTTCTCGTAACAGATTTGTTACTTTTATCAAG
TCTAGTAAAACTTTACATGTTAAAGATATGAACAACAACATTACCAAGACCATTCAATTA
GATAGCTCTGTCAATGATGTTTTGGCTGGTGCTCCAGGTAGAATCTTGTTGGTTAAAGCT
CATTCTGTTATCAACTATGATGTTCAACAACGTAAAGAATTGTCTGAAATTAATGTCAAC
AATGTCAAATACGTTTCTTGGTCCAATGATGGTCAATACTTGGCCTTGTTATCCAAACAC
ACCATCACCATTGCTACTAAAGATTTGGAATTGGTTACATCTATGCATGAAACCATTAGA
ATCAAGAGTGCTGCTTGGGATGATACTGGTGTTTTGTTATACTCCACTTTGAACCATATC
AAATACACTTTGTTGAACGGAGACAATGGTATTATCAAGACTTTGGAAAACACTTTGTAT
GTCACTAGAGTCCAAGGTAATTTGGTTTACTGTTTGAACCGTGAAGGTCAAGTTGATGTT
GTTACTATCGACCCAACTGAATACAGATTCAAACGTGCCTTGGTCAACAAGAACTTCGGT
GAAGTTTTGAGACTTATTAAGAACTCCACATTGGTTGGTCAAAATATCATTGCTTACTTG
CAAAAGAAAGGTTTCCCAGAAGTTGCTTTGCATTTTGTTCAAGACCCAGAAACTAGATTT
GAATTGGCCTTGGAATGTAGTAACTTGCAAGTTGCTTTGGAACAAGCCAAGATTTTGAAC
AACAACCAAATTTGGGAAAAATTGGGAGAAGAAGCTTTACTGCAAGGTAACATTGAAATT
GTTGAATTTGTTTACCAACAATTGCATCTTTTTGATAAATTGTCTTACTTGTATTTGTAC
AAAGGTGATAGTGAAAGATTAAACAAGATGACTACTATTGCTGAACATCGTGGTGATGCT
TCTGCTTTAGTCCAAAACACTTTGTACAGTAATGATGTTAAAAAGAGATGTCAAGTTTAT
ATCCAAAGTGGTATGTTGCCATTAGCTTATACTTTAGCTAAATCCAATGGTTTGACCGAA
TTAGCTGAACAAATCTTGCAAGAAGCAGGTATCAGTGAAAAAGATGTTGAATTGCCTGAA
TTGGGTGATGACGTTCCATTACCTCAACCAATTGCTGAACCAATTGGTAACTGGCCATTG
AAGGATTCTGAATTGTCATACTTTGAAACCGCATTGATTACTGGTAATGTTGAAAACTTG
AGTCTTGAAGATGATAATGAAACTGACAAATTTACTGATGCTACTAGTACTCCAGCTGCC
TACTTTGATGATGATGTCGAAGGTGAAGCTGAAGAAGAAGATGCTGGTGCTTGGGATTTG
GATGATGATTTTGAAAATGATGATGATGAAGAGCAAGCCAATGCTGGTCAAGAAGAAGAA
GGAGCAGGTCCAGTCTTTGCTTCTAGTGCTGTTGACAACGAAGTTGGTGATTGGGTCCGT
AATGCCAAGACACCAGCTTCTTATGTTGCTGCTGGTGCTTTTGAGCAAGCTGCTTCTATG
TTGAATAAGCAAATTGGTGTTTCTAATTTCGAACCATTGAGAGACAGATTCAACCAAGTT
TATCAAGCTTCTAAGTTGTATTTACCAGGTATGGATGAATTACCAGCTATGAAGACATAC
ATTAGACAAGATAATGATGAAGATAATCCACGTAAGTTCAAACCGGTTATTCCTGGATAC
GACCAATTAAAGGATCAATTAGCATTGGGTTTCAAGCAATTCAATGGTAGACATTTAGAA
GAAGCTATTGAAACTTTTAGAAGAATTATCTACACCATTGCTGTTATTAATGTTTCTGAT
GAAGCCGAAGAAACTGAATGTCATGAAATCTTGGGATTGTGTCGTGAATATATTCTTGGT
ATTTCCATTGAATTGGAACGTCGTAACTTGCCACCACTGGATGTTAAACGTAATTTGGAA
TTGGCATCTTATTTCACCAGAGTTCAATTACAATCTGCTCATAAAGTTCTTGCCTTGTAT
GTTGCTATGAATTTATCCAACAAGAATAAGAATTATGTCATGGCTACCAAGTTTGCTGAA
GAATTGTTGGAAATCACTACTAGTGGACCAAGAGCTGATCTGGCCAAAAAGATTTTGGAA
AGAGCTGGTAGTTTTGGTACTGATGCTATTTCTATTGATTTCAATCCAGATGCTGAATTT
GATATTTGTTGTGGAAGTTTCACTCCAATTTATAGTGGAGAACCAAGTGTTACTGAAGCT
GTAGTTGGAGCTAAATATAATCCTGAATTTAAAGGACAATTATGTAAGATCACTAACATT
ACAGCTATTGGTGTTCCAACTTCTGGTTTACGTATTAGAGATTAG
Promoter Sequence
Download FASTA
>CTRG_02141 CTRG_02141
ATCAAATGGTGTTGGTACTATTGAATGGGCTGGTGGTTTAGTCGATTGGGATTCTGAAGA
TATCCAAGAATACGGTTACTTTTACGCCCAAGTTAAAGATGTTTATGTCGAAACTTATGA
TCTTCCTGACCATATTTTGTTAAGTGGTAACTCCACTAATAGTGACGATTATCATGCTTT
CCTTTATAATGATACTAAAGGTGATGATACGGATATTTATTTAACAAATAAGAAAACTTG
GTTGGGTAGTGATGATGCTACTGGTTTTGATCCACAAAATGATGATAATGATCAGGATGA
TTCCAACGAGACCACCATTGTTAAGACCAGTGGTTCAACAACCATTACTAGTGTGTCAAC
TGCTTCAACCACTAGAAAAACTGCTAATGTCCCAGCACAAAACACTGCTGCTGCAAACCA
AGGTACCACAGACAGTGGAAGCAAAAAGACAACAACAAACACATATAACCCAAGTGCTGG
TGTTGGTGGATTTGTTCAAGATTCTAGATCAACTGCAACTTCAGGTAATTCGTCAGGATC
GTCATCTTCTGGAAGTGCTGCTACATTGAATGACAATATCATTAGTGTAGTTGGTGCCAT
TGCTTTGGGAATGATCTCCTTCTTAGTTTAAACTTAATTAATTAGACTAGACTTTGAGTA
ATGTGAATGTGTATATTTTATTATTGTTATTTGTGTAATAAGAAGATGATTTTATATATA
TATATATATATAAACGGTTTAAGTAGATAATGATCATAGTATAAATTTCATTGGTGTTTT
TAATTTATTTTTTGAGATTCGTATATTTCCAAGTCACGTGTTTGGAAATGCACGACCTTT
TTTTTTTTCCTGTTTAACGTGTTCAAAAATTTTTCAGTGAGCGATCTCAGTCTCACACAC
AACAGCGGACAACAAACAACTCAAACAAAAAAAAAAAAAGAATCAATTTCAATCAGAATA
GGTTTTCCCTATAAAATATCCAACAACATCGACTGCAATC
Chr coordinates Supercontig_3.3_C_tropicalis_MYA-3404:40275-43919W