PathoYeastract
C.tropicalis
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name Uncharacterized
Systematic Name CTRG_02152
Strain MYA-3404
Description Has domain(s) with predicted sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription factor, zinc ion binding activity, role in regulation of transcription, DNA-dependent and nucleus localization
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CTRG_02152 CTRG_02152
ATGAATACAAACCCCGACAATAATTATGTTCCGCTATTGAAAGATGAATCAGTATCTACT
ATTAATACAACGACTAGCACTGCTACAGGCACATCTGTAACAACTCCTGGACCACCATTA
TCTAATAATAATGATGCTATACCTCCATCAAGTCTACCGGCAGTTGACTCAGTGTTGACA
AATTTTTTCAGCGGTGCCAATACGAAACAATCATCAATCACAAAATTAACCAATCGTCAC
ACCACATCAAAGAAACCTAGGAAAAAAAGAGAGACCAATATCAGAGCATGCGATGCATGT
GCCATTAAGAAAGTCAAATGTGACGTAACTAGACCTTGCAATCATTGTCGTACAAATAAT
ATCCCTTGTACTCAAAATAGAGAACGTAAAAAATCAGGTCCGAAAACATTGACTAAAAGA
ACTTTGGAATCAATTAATAATTTAAGTGATGTTATTGAAAAAAATACCAATGGTGGAATA
CGTCCCGGTGTAGGAAAACGTCCCCTGTCAAGAAGTTTTTCAAGAAGTCCTTCAAATGAA
TTAATGGATGAAGATATTAAGCACATCACCACTGAACAACATCAACATGGAGACGAATTG
AAATCAAATACTCATTCCATATCTCCCGTCATGTCAAATGGATCTTCAGCAACACCAAAT
CCTATGCCAAAACAAGAATCTCAATTTGAATCCATGCAACAACATCCTCAACTGGCAATA
GCAGAATTGAAGTCACAGTATCCATCTAATAGTGCTGTTGGAAGTACCCTTGGTTCTACG
GTTAATTTAGCAGCTACCACTATAGAGGATTATATTGTTACACCTTTCCATCTTATTGAG
AATTTAAACTTAATTGGAGAAGAACCGTCTATTTATGAATTGATCAAACCGTTGAGTTCT
CCTACTGTTATTGAACATTATGGTGTATTGGTTGATTTTTTAAAGTCAAATTATCCTGAT
AGACAAGATCTCGAAACAGGTTATAATCCAAGACATGATGAATTAAATTTTGTTGAGCAT
CACGATGATTCATTGTTTTTGTCCAAATTATTGGTGATTTTAACTTTAAATCAAATTGTG
GCTGAATTACTAATTAAATTAAAGAAACAAAAATTCAAAGCCTTTAAAAAATATCCTAAA
AAATATCTTATGTTTAGACCTTTCAAACATTTTAAGAATTTGTGTCATTTCAAGGTATTG
GAAATATTCACTTTGGTTGAAAAGAATTTCATTGTTCCCCCAACCATTCCACAAAATAGA
ATTAATAATAGTAACAATGGTCAAGGTTTGAATGTGAGTGGTAGTGGTGGTATTCCCAAC
AACAACAACAACAACAATAATAATAATAATAATAATAACAACAATATGAATTCGCCAGGA
AACCTTCAATTGTTCCTGCATTTGAATCAATATGAAATTTATTACAATTTATCATTAACT
TGTATTCAATTGTGCAATTATTATCATATTCTAAATCTTACCAATACATTAAATTCAACT
AATCTGAGTTCAAACAATTATGGAAATGAAGCACAGGAACATCAAAAGATTTTATTTCTT
CATCGGGCAATAACATATTTTCAATTGATTAATCTTCGAAATAATGATCAAGTTGCACCA
GTTGAAGAACTTTATGCATTGTTGTATTCCTTTGAACGATATTATATTGTTTTATCGAGT
CACAATTATAATTTAAATGTGACACGTAATAATGCTATTATTTTACAATTATTGTCATCA
AATTTTCAAGGTAAAGGGTACATTTATGAGTTGATGCAAGTATTAACTAATCAAGGGTTA
ATCAATGATTTATGTTATCGATCAAATTTTAATATCACTTTGGAGTATTCCAAACCTGTT
CCAGGTTTTTATGAGAGTAAACAATTGATTAAAAATTTAACTCCAAATGAACCTATTTAT
CAAATTATTGAAAATATCATACTATTTAAGATTTTACTTGTTAAACCATTATCATTTAAT
GAATGTAAACAAGAAATTGTTTCAATAATCAACAATTTGAATTGTTTATTGGAGAGCAAT
AATAATGATATATTTAAAGTCAAATTATCAAATTATCAAATTTTGCAACCAATGTTGCAT
TGTTTAAAAATATTTTTGGAAATTAAAACCATTGAAGTTAAATCAGGATACAACAATTCA
AATAATACAGGATTAAGTGATCAAATGATTTTAGTTAAATTTAGTGATAATTTGATTTTA
CATTTCCCATTTTTTAATAATATTAATAAATTAATTAGAGCTCATAAAATATTGAATAAT
TGGTTTTTAAATTTGAGTGAAATTAGAAAAGATGATGAGCAACAACAACAGCAACATCAT
AATTCACAAATGGAGAATAAACCTAAACCAGAACAGCCACAACCAAAAACTCCAGCTCAA
TTACCTACATTACCTGAAGTATCTCAATTACAAACAGTGTCTCAATTTTCGGTTCCATCA
ATACTGTCCCACGTTCCATTACCAATTTCTCAACAGCAACCACCACCAGCAGCACCACCA
CCGCAACAACAATTATCACATCTTCATCATCATTCACTACAACAACAACAACACATAATT
CACAATTTTCTTCACCTCAAGTTACACATCAAACACCACAACAGCATATGGATGGAACAC
AATTGCTTTCATATGATATTCTACCATTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>CTRG_02152 CTRG_02152
GGGAACGCACCCCCTCCTTCCTTCCTTTCCCTCTCGATCCCTCGCAAAGGGGGTTTGATG
AGCGATAAATAATAAATTATAAATGAGTAAAAGTGGTGGAGGTTAAAAACAGATGTGAAG
GATGGAGTATTATAACTGGGCGGGAATTTAGTGAATAGGTATAATTGATGGATATATCCA
CGTTGGGTGAGATGATAGATTAAAAAGCATAGTAATGTATAAAACCCAATAGAGACAATA
ATACTAGTATAAAGTAAAATAGGCTTAAATTGAAGTGCCTTAAAGGAATAGATATAGAAT
GAAAGATACCCGTGCCACAAACTGGGGGAGGGGGAAGAGACAGAGAGAGAATACTTGGAA
CTAGACGGAACAAACAAACAAAGAAAAAAAAAAGTAGTCACACAGAAAAAAGAAAAGACA
GTGTGAGGGAAATTTACAGTGAGGGAAATTTGTCCTCTCTTATTGAGTGTACATTAAAAA
AAAAAAAAACAGAACAAACTAAAATTAGATAAATACTCAACTAAAAGGTCTGTTGTATTT
CCATTAACAAAAAAAATTAAAAAGAGAAATCAAAAATTTTCTATTTACTTACTAATAGAA
TTAAAACTTCAACAGTTGTATATTTATTCTTTTTCAAAGCTTTAATTCATACTACCATTT
AGTGAAACTCATTATTCCAATAGATTATTCTATTTTCACTTGGTATTACATGAATAGTTT
TGTGGGGTAGGATAGAAGCAAACAAGAGGTAGTAGAAGGAGTTCAAGCTTAAATTTGCAC
ATCATTACATATTCATAATTTGGGAATCATCCTAATTTTAATTACCTTCTTTTGCAGTAC
ATTAACTATCAAAGAATTTAATAGTCATCCGAATTGGTAGATAAAGATTCCTTGTGTTTT
TTTTTTCAATTTTCAATTTTTTAATTTTTAATTTTTTCTTTATTGATCTTCTTGTTTGGC
TATCGTTTCCATATATGAATTATCACTTTCTTTAACAACG
Chr coordinates Supercontig_3.3_C_tropicalis_MYA-3404:66302-63633C
w3c xhtml validator w3c css validator