PathoYeastract
C.tropicalis
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Download     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name Uncharacterized
Systematic Name CTRG_03541
Strain MYA-3404
Description Has domain(s) with predicted ATP binding, DNA helicase, DNA binding activity, role in DNA replication initiation and MCM complex localization
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CTRG_03541 CTRG_03541
ATGTCATCTCCACCTCAAAGTAGTAATAATAACCATACTAATGGTCAACAGGATTCACTT
GAAAGAGAATCTGAATCCATCTCACAGAGTCAACAACCTCCAATTGTTTCATCTCCATTA
TTTTTCAATTCATCTAATCCAGGTTCAGATATCGGATCCAATAACTTCAACTCACAAAGT
CAAAGAAGAAATGATATTTCTTCTCCATTACATTATACCTCATCTGCACAACCAACATCA
GATATTGGTTTTGATTCTCAAAGATCTGCTAGAGTTCAAGATGTGGGTAGAATCATGAGA
CGTGCCCAAAGAAGTGATATTCAAGATAGTACTTCATCTCCACTGCGTAACAGAAGATAT
TTTAATCCAGTGAGAGGTGGTCCACAAACTCCTTCAAACTTGGGATCTGCTACTTCACAA
CAATACAGCACGGATCCAGCCGAACCAAATGATGAGCCAGTAAGAGTCATTTGGGGTACA
AATGTTTCCATTCAAGAATGTTCTAATATTTTCAGAGAATTCTTATTGTCCTTCAAGTAT
AAATATAGAAGGGATATGGAAGGTGAACTTGTTGAGCCAGAGGACCATGAGTTGTACTAT
GTGAATCAATTGAATACTATTATGGAATTGGGATTGACAAATCTTAATTTAGATGCCAAA
AATTTGTTGTCTTATCCATCCACTAGAAAATTATACTATCAGTTAATTAACTATCCGCAA
GAAATTATTCCAATTATGGATCACACCATCAAGGATTGTTTAATTCAAATTATTAATGAT
TCAGGTACTACCAGTCCTGCAGAATCAAAACTTGATGAAATTGAAACTAATGTTTATACC
ATTCGTCCATATAATGTTAACATGGTTGAAAAGGGTATTCGTGAATTGAACCCTAATGAT
ATTGACAAATTGGTTAGTGTTAAAGGTTTGACTTTGCGTTCTACATCGATTATTCCGGAC
ATGAAAGTTGCCTTTTTCAGATGTAATGCATGTGGTCACACTGTTGGTGTTGAAATTGAT
AGAGGGGTTATTTCAGAACCAACTAAATGTCCTAGAGAAGTTTGTGGTCAACGAAACTCA
ATGGTACTTATCCATAACCGTTCTTCATTTTCTGACAAACAAGTCATCAAATTACAAGAA
ACACCAGATTTGGTTCCTGATGGTCAAACTCCACACTCTATTAACTTGTGTGTCTATGAC
GAATTGGTTGATTCTTGTCGTGCTGGTGATCGTGTTGAAGTTTGTGGTATTTTCAGATCC
ACCCCTGTCAGAGCCAATCCAAGACAAAGAGCGTTGAAAAGTTTATACAAAACTTATTTG
GATATTGTTCATATTAAGAAGATTGACAAGAGGCGATTGGGAGGTGATATTTCTACATTG
GAACATGAAGTTGCTGAAAAGGATCAAGAAGTTGAGCAAGTTAGAAAGATAACTGCTGAA
GAAATTGAAAAGATTAAAGAAATCTCTGAACGTGATGATTTATATGAAGTTTTAGCCAGA
TCATTGGCTCCTTCTATTTATGAGATGGATGATGTTAAGAAAGGGATCTTGTTGCAGTTG
TTTGGTGGTACCAATAAAACTTTCAAGAAAGGTGGTAGATATAGAGGTGACATCAATGTG
TTGTTGTGTGGTGATCCATCCACTTCGAAATCTCAAATCTTACAATATGTTCATAAAATC
GCCCCAAGAGGGGTTTACACATCTGGTAAAGGTTCTTCTGCCGTTGGTTTGACTGCTTAT
ATCACCAGAGATATTGATACCAAGCAATTAGTTTTGGAAAGTGGTGCTCTTGTGTTATCT
GATGGTGGTGTTTGTTGCATTGATGAATTTGACAAAATGAGTGATGCTACAAGATCGGTG
CTACATGAAGTTATGGAACAACAAACTATTTCTATTGCTAAAGCTGGTATTATCACTACC
TTAAATGCTAGAACTTCTATTTTGGCATCGGCAAATCCTATCAATTCGCGTTATGATCCA
AACTTACCGGTTACTGCAAATATTGATTTACCACCACCTTTATTGTCGCGTTTTGATTTG
GTTTATTTGATTTTGGATAAAGTTGACGAAACAATTGATAGACAATTGGCTAGACATTTG
ACTGATATGTATTTGGAAGATACTCCTGAAACTGTCAACACTAGTTATGTTTTGCCGGTC
GATTTATTGACCCTTTACATCCAATACGCTAAAGAAAACTATAATCCAGTTATGACTGAA
GAAGGTAAACATGAATTAGTGAGAGCATATGTTGAAATGAGAAAATTGGGTGAAGACGCT
AGATCTTCTGAAAAGAGAATCACTGCCACTACTAGACAATTGGAATCCATGATTAGATTA
TCTGAAGCCCATGCTAAAATGAGATTATCTGAAAGAGTTGAATTAATTGATGTTAAAGAA
GCTGTTAGATTGATTAAATCTGCAATTAAAGATTATGCTACTGATCCAGTCACTGGTAGA
ATTGATATGGATATGATTCAAACGGGTACTACTAATCAACAAAGAAGAGTTCAAGAAGAT
TTAGCTAATGAAATTTTAAAGATCATTGATGAAAATAACAACTTAATTAGATTCAATGAT
TTGAGTATGAAATTGAATGAAAGATCTTCTATTAGAGTCGAAAATCTGACTATTAATGAA
ACTTTAAAAAGATTACATCAAGAAGGTAAGATTCTTGAAACTGGTGATAGTCATAGAAGA
ACAATTAGAAAAATTGCAATTGTTTAG
Promoter Sequence
Download FASTA
>CTRG_03541 CTRG_03541
TTGGTGGAGGAATTCAATCAATGAGTATTACTGAAGTATTTGGAGAATTTAGATGTGGAA
AAACCCAGTTGTGCCACACCCTATGCGTTGCTGCACAACTTCCAAGAGATATGGGAGGAG
CAGAGGGTCGAGTAGCATATATTGATACAGAAGGTACATTCCGTCCTGATCGTATTAGAT
CAATTGCAGAAAGATATGGAGTTGATCCTGATACTTGTTTAGAAAACATTTCCTATGCTA
GAGCACTTAATAGTGAACACCAAATTGAACTAGTTGAACAATTAGGTCACGAATTTGCAG
AAGGTACATTCAGGCTTTTGATTGTTGATTCGATTATGGCTTGTTTTAGAGTTGATTTTT
CTGGGAGAGGGGAATTAAATGAACGTCAACAGAAATTAAACCAGCACTTGTCAAACTTAA
CAAGAGTTGCTGAAGATTATAATATAGCTGTTTTCTTAACCAATCAAGTTCAATCAGACC
CTGGTGCAAGTTCTTTGTTCGCTGCTGCTGACGGAAGAAAGCCAGTTGGCGGTCACGTAT
TAGCTCATGCATCAGCTACAAGAATTTTGTTAAGAAAAGGAAGAGGAGAAGAAAGAGTAG
CCAAATTGCAAGACAGCCCAAATATGCCTGAGAAAGAATGTGTTTATGTTATTGGTAATG
GAGGTATTAGAGATAGTACCGATTAAATGTGTGTCTAGACAAAGTCGTGTCTCTTGGTTG
CAATATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAATAAAACAATTAAACCCAATTGGGAAATCA
TATTAGGGCTGGCATGACGCGTGGTGAAAAATCAAGTAAAGAAAAAAAAAATGAACTTTA
TCCATAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAAAAAACTCTGTGTTGAATTACCAAACAAAAAAAAA
AAAATTCTTTCGTTAGTTTGTTTAAATCAAAAACTTGTTTTTTTTTAAAAATTGTTTATT
TATTTATTGTTATTAGCTATTAGAAATAAGAATACAAGTC
Chr coordinates Supercontig_3.4_C_tropicalis_MYA-3404:1196538-1193812C