PathoYeastract
C.tropicalis
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Download     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name Uncharacterized
Systematic Name CTRG_03848
Strain MYA-3404
Description Ortholog(s) have role in filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus, positive regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CTRG_03848 CTRG_03848
ATGTTTCAAACTGTAGAACTCAATCAACAACAGCAATCTCCACCAGCAACGTCACTACCA
ATACAATCTTCAAATGTTGAGATCATTCAGGATGGTAAAATCGTTAAGAAAGTTCAAAAA
GCAAGACAAAGAAAGATTTTATCCTGTGTCTATTGTCATTCCAAGAAGATCAAATGTAAC
AGACAAGAACCTTGCTCTCAATGTAATAAATTAAAAGTTGAATGTAAATATTTCATTAAT
GAAAGAATAAGTAGAGGAGGAAAGAAATCAAGTCGATTAACTGCTTATGAAAAGAAATTG
AGAGGTATCGATACAGCAACAAATAGCAGCAGCACAACAATGTCAATTACAGAAAACAAT
CTAGAGTTGAATAACAGAGCAAATACTTCACCAGATTCAAATTCATCTTCATCTTGTATT
TCATCAGGACAATCTTTGGCTATTACTTCAAGTGAAGCAACAACAATCGAGGAACACATA
AATAAACAAAATGAATCTAATAACCACAATCGAAACCCATCAGAAGCAACTCCATCTTCT
ACAACATCCACCAATGAATTTAAGCAACCTCCTTCTGTTGATATGTCTGTTCATTTCTTG
GGTTTCCTGAATAGAATCGAAAACAATCATCCATCAGCAACAGCAACTACATCCAACAAT
ACCAATATACCAAGAATATCCACGCCAAATAACATTGATTCTCCATTATCAAATGATCCG
TTTGCTTTGGGAAGTATGATTCAATCTCCGATTATTAACAATGCCACCAATAATATTACC
AATAGTTATTTCAATACAAATTTCACCACTCAAGTCAACAACAATCCAATTTTATCATCA
AACAACAATAACAATTCCAATAGTACAGCAAACTTAATAAGTTTTAATTCATCTTCATTT
CCTTTGGCAAATCAAGACATCCTAACTGCATTTCCTAGTGGATTGAATTCCCCGGTTGTC
GGTAATAGCAATCCTCCACCTCAATCATCAGTTTCAATCCAACAATCAGATTCTAAAAAA
GATTCAAGTCCCTCTCACCAGCAACAACAACAGCAACAGCAACAATCAGATTCATTAACT
AAAGCTCAACCAAATCCAAATTTGTACAATTCACTACTGGCTTATTCATCTAATCCAGCT
ACAACCACGGTAAACTACTTGTATGGTACAAATACTTACTATGAGAATTCAAATTTATTA
GATGATTTATTTCAATTTTTACCTCCAACTCGAGAAAGAAGTTTTGAATTAATGGATAGA
TATTTAAATTCTGTTCATTTATTATTACCAGTTGTTGTCAACATGACAGAATTTTTAAAG
CAGCACAAGAGATATTGGGATATTCGATCGAAATCGAAAAGAAGAACTTATTCATCTACT
TCTAGTACAACATCTCCTGAAAATAACAATCCTTTAGTTGAATCTCCATGTGAAAGTAAT
CCAAGTAGTAAGCATCATAATTTTGACGTTGATTTTAATTTTGTTCAATTCTATACTTTG
TATTTCCCAATCTTGTATGCTTCAACAATATCTGAATTTGAAGAATATGATAATTTATTG
TTAAATCAAGATATTGATAAATATTTAAAAGGTTTTAACAAAATTTGTCAATATTATAAC
TATCCTCATGGTATCAAAACTATTCCTTTATTATTGGGTAATGTTATTATTCAAAGTACT
TCACCGAATCCTTCAACTATGGAAATGGCACAAATTATCAGGTATGCTAAATTTTTACAT
TTCCATAAAGATCCATATATCAGTTTAAGAATTAAAGATCGTGAAGTTATTAAATTTAGA
AGATTGTTATGGTGGGTTATTTTTGGATTGGATGCTTTAAGTAGTCATAACTTCTGTTTA
CCTCCAAATTGTCGAATTGACGATTTTAATGTGTTGATGCCTGATGAAGAAGAACCTAAA
GATGATACTAATCCAGAAGATAAGAAATTAAACTTGGGACTTGTATCCATGAATATTAAA
TTTGGATATGATAGAATTTTAAGTGAATTGGTTTATCATTTACATAATGGTTTAAGTGAA
AACATCTCCCTGATTAAAATTAATGAAATTAAGAGAATGATTACTGATTATCATAAAAAT
GTTGAAAAATCAATTGATAAAATTAATAAATATTTCACATTTAAAACATCAGGAAATTAT
ACAATTCAAGAAATTAATTTAATCAATTTTGTTAAAAGTCATTCATGGAGTTATGTTGAT
CGTGCATTGATGTTACTTCACAAGAAGATTTTACTTGGATCACCAAATATTCCTGGTGAA
CATGAACAATTTGATATTCATATTAATAGTCAATTAATATTGGATAAACCTCAAGATGAT
TTGACATTATCTAAATATGAAGATACATTTGGACAAATGTTGGAATCTAATATTATTAAA
AATTTCAATAATTCATCAATTTCATTATTAAAATTTGGGAATTTTGATAAAGTTTCATAT
GAAGATTTAAATAATAATTTAATTCCTTCAATTTTACATAATTTTAATGATTTTTTACAA
TATAATGATTTTATTAAATTTGGAAGATTTAATTGGTATATTAAAAGAACAATTCCTATT
GATTCAGTTATTATAATGATGGTTATTATTTCTGTTAAATTTAAATATAAATTTATTGAT
AATGAAGAATTCTCAATTTATAAGAATCTTATCAATAATGTTTTATTTATAATTAATAGA
AAATGGTTTAAAAATGAAAAGTATAAACGCATGTTGAGTTTAACCAATATGATGTGGGAA
TATCTCATAAAGAAATACACCATTAAAGATGCTCCATCCAACACTACTAATAATAATAAT
ACAAATGACAACAACACAGGTACATCTTCTGACATTGATAAGAGTATTACAAATGTTCAT
ACTATTGATGAATTACAATTAAAAGAAAAAATTTTATATGATTTAAGACATAATTTCATT
GATATTAATGATTATTGTTCATTTTATTCATCTTTAGAAAATTTATTAAACCAATTATTA
AAATACATAGAATAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>CTRG_03848 CTRG_03848
ATTTGTGGTACTTGATGTATACCCAGTACGAGAAGTTTGAATTTCAAATGCAGTGATTTT
TTATTTGTTTAATATATGCGTTGGAAAGAGAGGAATCAAATGATGTAATGATAAAGCGCA
TTGAATAGAATGGTGGAGTAGTTGGTGATAGGGTTCCTAAGACGTTAAACAGAGAGATGT
GTCAATGGAGTTAAGTGATTGTTTCATCATGGAGATACGTGTTAAATAATTAATTAATTA
ATCTACCTAACGGCTACAACGAAATGAAACGACTGAATTTTTAATTTAGGGGAGAGGAGG
GGGCGGGGGTGGCCTGAGAAGGATGAGGCGCGTTGGGCGGGGCGGGGGAGGGCCATGGTA
ACAAAAAAAAAAAGGCAAAAGGCAAAAGTAAAAGTATTTCTGATGGGTATGCAATCTTTG
TGGGGGTTGGGTTTGATGTACAATAACAACAATAACGACAATAAAGAAAAGAAATGTACA
AGGCGGTAATAGCAAAAGAAAGGGAACAATAACTGAAAAAGACATTTTTCTCTTGTTATT
GTTGTTGTCGTTCTTGTCGTTATTAAGGCAAAGATGAAATTTTAGTACTTTTTGTAATCT
AGAGCAAGACAAATCCGTTATACGGGATGATTCTCTCTTTGGTTCAAATTACAATTCCAT
TAATTATGCATAATCTATAGTGCTTACCTAATAAGTTTGAACCCAAAGGACAACAAATTA
AATTTGATCATCATCATCATCATAAACATTAATGATCACTAACTAAACAAAAAAAAAAAA
TAGAAAATTAGTTCACAACTAAAAATTCCGAACTATCACTGAAATAACTTGAATTCAATT
TCCACTAAAAATCCCACATCCAATCTTTACACTTATTTTCATTTTATTTTATTTTAGAAA
AAGAACAACTTATTCATATTTATTTATTTATTTATTTATTTACTTCCTGTCATTATTTAT
TTGTTAACTATTATCTATTCATACTTACTCGAATCACAGC
Chr coordinates Supercontig_3.5_C_tropicalis_MYA-3404:265477-268491W