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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CSS2
Promoter Sequence

No match found!
>CSS2    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CATTAACACTAAGTTTACAGAACATACTAGAAGTTGTTTTCGGCAACATAGGAATCTACA
AAAGGGGATGGATAATTCTACATAATAATATTATTATTTCCCCTTTCATTGTTGACATAA
TGTTATAAATTCGTACTCTATGTTGCTGGTGTGCTTATGAACGCTACAATCAATTTTTTC
ATGCATACTTGAGGTAATAAGATGTCGATACTTTTATGGTGTTTATGAACATGGCAATAC
CCGTTACCACTCGTGTTGGGTGTAGGTACAGCAACACTAGATTCCGAATCACCCCCGTCA
TTGCCACCATACTACTGTAGCGATATGGCGAGTGTGTATCATTGTTGTTTTGTCGTTGGC
CATCTTCAATATAATCAATATGAAAGCCAATCATGCATTTTGAAAAGATAGTCTCGCGGT
CGGTGTTGAGGAACTTTTCATTGCCTACGTCGAAATCAAATTTTGAAAAGCTGTGGCTAG
AGTTAAACCTAAAACAGTCATTACTATTCGAAAAATTTGACGCTTACGTTCAGGTTCTGA
ATCAATCCCTTTCCTCTACACTTAAGTTTGGTTGTGGTTTATGTTACTACTACATCGCTC
GGTTGCAAACAGACGTGTATAGCTTTTAGGAATACTGTTGTTCAAGATAGAGCATTTGCA
TACCTTATCGAGGTTCACTATCGCTGCTACATTGGCATAAAATTGAATTGTTAAGGACGG
CCAATACTATACTTGCTGCCACATTGGTTTAATTCGTTCACTATGATTATGGTTGCAACA
GGGCAGTTTCTATCGTGATCATTCGCCACATACTTAAAAAGATAAAAAAAGTTAAACGAC
TAGACTAGGAGTTATGCAGTATGAGCTGCAGCTCCGCAACTACAACTAGATTAAATACTG
GGGGGGCAAAAAGATAAAGTGAGTATCTTGAGCAGGAGTTCCCTTGACATATTAATCTGT
AAATTTGTTTTTTTACTGAATTTACTACTTAATAGTAAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
GATAAG: -331
>CSS2	Upstream Sequence Complementary Strand
GTAATTGTGATTCAAATGTCTTGTATGATCTTCAACAAAAGCCGTTGTATCCTTAGATGT
TTTCCCCTACCTATTAAGATGTATTATTATAATAATAAAGGGGAAAGTAACAACTGTATT
ACAATATTTAAGCATGAGATACAACGACCACACGAATACTTGCGATGTTAGTTAAAAAAG
TACGTATGAACTCCATTATTCTACAGCTATGAAAATACCACAAATACTTGTACCGTTATG
GGCAATGGTGAGCACAACCCACATCCATGTCGTTGTGATCTAAGGCTTAGTGGGGGCAGT
AACGGTGGTATGATGACATCGCTATACCGCTCACACATAGTAACAACAAAACAGCAACCG
GTAGAAGTTATATTAGTTATACTTTCGGTTAGTACGTAAAACTTTTCTATCAGAGCGCCA
GCCACAACTCCTTGAAAAGTAACGGATGCAGCTTTAGTTTAAAACTTTTCGACACCGATC
TCAATTTGGATTTTGTCAGTAATGATAAGCTTTTTAAACTGCGAATGCAAGTCCAAGACT
TAGTTAGGGAAAGGAGATGTGAATTCAAACCAACACCAAATACAATGATGATGTAGCGAG
CCAACGTTTGTCTGCACATATCGAAAATCCTTATGACAACAAGTTCTATCTCGTAAACGT
ATGGAATAGCTCCAAGTGATAGCGACGATGTAACCGTATTTTAACTTAACAATTCCTGCC
GGTTATGATATGAACGACGGTGTAACCAAATTAAGCAAGTGATACTAATACCAACGTTGT
CCCGTCAAAGATAGCACTAGTAAGCGGTGTATGAATTTTTCTATTTTTTTCAATTTGCTG
ATCTGATCCTCAATACGTCATACTCGACGTCGAGGCGTTGATGTTGATCTAATTTATGAC
CCCCCCGTTTTTCTATTTCACTCATAGAACTCGTCCTCAAGGGAACTGTATAATTAGACA
TTTAAACAAAAAAATGACTTAAATGATGAATTATCATTTC