Locus Information
Locus Info
Protein Info
GO Info
Orthologs
Standard Name
SKN2
Systematic Name
C3_03500W_A
Alias
C3_03500W, C3_03500W_B, CA4641, CaO19.348, CaO19.7981, CAWG_02646, Contig4-3090_0037, IPF1505, IPF1505.2, IPF26976.1, orf19.348, orf19.7981, orf6.7232
Allele
C3_03500W_B
Strain
SC5314
Description
Uncharacterized ORF; (orf19.348) Protein with a potential role in beta-1,6 glucan biosynthesis; similarity to Kre6 and Skn1; possibly essential, disruptants not obtained by UAU1 method; Hap43-induced; flow model biofilm induced; rat catheter biofilm repressed
External sources
Open in CGD
Open in KEGG
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>SKN2 C3_03500W_A
ATGGCAAGACGTAATTTAACCAAGAATACCAATGGTAATGAATATCAAAATACAAACCCA
TTTGTTAATCAAGCTAATCAAAATTATAACAACAACTCCACAAGACAATCTTATCCCGGG
TTCACTGATCCTTTCGATTCTAGCAACAGACTTGATGATGGATCATTTGATTTTGAAAAT
CGTTCTTCTTATCCATCTTCTTCCACATCCACTTCGTCTATTGCCAATCAATATGGTCGT
CCTTTCACAGTAGGTAACGGATTATCATCAAGTAACGGAAGCAGCGGCTCTCATTTATTA
CAAGGTCAAAATGATTACAATCTACTGCTGCTGCCAAATCTACAACACCAACAACTCCAA
GCTGCTGAAAATGATAAATCGTCGTCCCTTCTAAATTCCAATATAAATAACATCAAAGTC
GACGTACCTTATGACTATGACAGATACCCCAAAATCATTGGCAGAGTATCATCGAGTAAC
TCGTTAAATAATACTAGCAACACTGCCCCCTATCAGTCTGAAACACCATCAATATCATCC
AACTCATTCAATAAAAATGTCAATAATACATTAAACGGTAGCTACAACAACATTATTGAT
TTTAGTCCATTTGGTGGCTATCCTGCCAGTTCATTCCCACTTAATATCGATGAAAAAGAA
CCTGATGATTATCTTCATAATCCTGACCCAGTTCACGACGTGATTTATGAGAAAAATAGA
TTTTGGAATGATTTGAAAACTGCTGATCGTAAATCATTTGGTGGGATTTTGGGCTTCTTA
TTTTTGATTGCAGCAGCAGTGGCGGTGTTTGTCGTGGTCCCAGCATTGACTTATTCGGGA
GTAACCACTCATAGTCCTCCACAGGAATACGAGATTTTAAGCCACTATTCATATCCATTA
CTTTCAGCAATTCGTACTTCATTGATCGACCCGGATACTCCACAGGACGCTTTGAAAATG
AAAGCTAAAGACGGTAGTAATTGGTCTTTGGTTTTCAGTGATGAATTTAATATTATGGGA
AGGACTTTCTATGAAGGCGACGATCAATTTTGGACAGCCCCTGACTTGCACTATGACGCC
ACTAAGGACTTGGAATGGTACGACCCCGATGCAGCAACTACGAGTAATGGTACTCTCAAT
TTACAAATGGATGCATTTAAAAATCATGATTTGTTTTATCGGTCAGGGATGGTACAAAGC
TGGAACCAGTTATGCTTTACTCAGGGTAAACTTGTTATCTCGGCACGTTTAGCTAACAAA
GGTACCGTTTCTGGATTATGGCCAGGGATATGGACAATGGGTAACTTAGGTCGCCCCGGA
TACTTGGCTTCTACCGAGGGGATATGGCCATATTCGTATGACTCTTGTGATTCTGGTATC
ACTCCTAACCAATCATCACCCGACGGTATTTCATATTTACCCGGGCAAAGATTAAACAAA
TGTACTTGTCCTGGTGAGTCGCATCCTAATCGTGGTGTTGGGCGTGGTGCTCCGGAAATT
GATGTCATTGAAGCAGAAATTAGTACTGATGCCACTGGCAATAGAGAAAATCTTGGTGTT
GCATCCCAATCATTACAATTAGCACCAATGGATATTTGGTACTACCCTGACCTTGACTAT
TTGGAGATTTACAACACTTCTATAACCACCATGAATACTTATACTGGTGGTCCGTTTCAA
CAAGCATTGTCAGGAACCACCACATTAAATAAAACTTGGTACGAACTAGGAGGTAATGGT
GTACACAATTTTCAAACGTATGGATATGAATATTTAAATGATAAAGACAATGGGTATTTA
AGATGGTTTGTTGGTGATAATCCTACATTGACAGTTTACCCACAAGCATTGCACCCTAAT
GGGAATGTTGGATGGAGACCATTGAGTAGAGAACCCATGTCAATTGTTATGAATTTGGGG
GTTTCAAATAATTGGGCTTATATTGATTGGCCTAGTTTGAGTTTCCCATCAACATTCCGT
ATTGATTATGTTCGTCTTTATCAACCACCAAATCAAATTAACGTTGGATGTGACCCAGCA
GGGTTCCCTACTTCTGATTATATCGAACAGCACATCAATGTGTATCAAAATGCTAATTTA
ACTTCATTTGAAGATGGTGGGTATAGTTTCCCAAAACATTCGTTAATTGGTTGCTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>SKN2 C3_03500W_A
CGTGTGTCTAAATCAATTTTATTATTAGGGATTAGATATGGTGATGGTTTTAGTAAGATT
AAGTTAGTTACTACAACTGTTCATTTAGTATTTGGTTCATTTTTTAGGCTCATTCGTTGA
ACTAATCAATCCTGTAATCATTAACGATAATTGTGAAAAGTGTAATCATGTAAGTAAATG
CTGGACAGAGGTTTTTTCTATTTAGTGCTGGCGAATTGTGTCTATGTAGTGTGATGTAGT
CGAAAAAAAAAACAACAAAAAGAATACAAAATACAAAAGTAGAAGTTAATGCGCCTAAAA
CAATCAATCAATCTATAACTAATAACAACAACAACAACGAACAGCAACAATAAACTGCTA
TATATCTTGTTTTGTGTTACTTTCTTTTTTTCTATTGTGTAAGAAATAGATTGTTATTTT
TTAAAGGCTAATTAACTATATTCCCATTTTTCAAATTGTTCTGCTATTTTTTTTTTTTGG
TTTTTGTTCTAATTCTACTTTAACTTAAAGTAAGTTTTATTTATTGTGGTGAATTAAAGT
GATAAGGCTAAACGTACGATTTGAAATTCAATTTCATTTCATTTCATATATATTTATAGT
TTTTTCTTCTTCCCTTTTGCTCTTCTTTTATTCATTTTTCTTCATAACAATTATCATCAA
TAACTCTTCAAGGTCCATTTCCAAACTTAATTTTTCTTTTTCTCAGTTTGACTACTATTA
GATCTTTTCACACAAAAGTATACTATCACAAAAGTCATTTGGACTGGTTGAGTTAATTTC
TAACAACAACGAGAATAGCAACAATACCAAACAACACAGACCTTTTATTTTTATTTGAAA
CACGAATATATATATATATATATATATCCCGCTCCATCCATTCGTTAAGCTTTCCCATTT
ATTCAGACCTAGTTCCCCTCATAATAGATTTTGTTTTTAAACGGATAACCCTTCCATTCC
ATTCTAGCAAACCAAAAGTAAATCAAAAGAACTAACTACC
Chr coordinates
Ca22chr3A_C_albicans_SC5314:745852-748008W