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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C3_05640W_A
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -964 -683 -601 -276
>C3_05640W_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TAAGATACTATGATTGCCAAAATATTTTATACCCTGCCAATCTTGATCAACAATTGGAAG
TTGATTATTATTTACATTATTCTGAAGGGTCATTACAACATATACAAATGGCATTATTAA
TTAATTCTTCAGCTAAACATATTGCCCCGTTTGCCACGAAATCAGTAGTGAAATTAGTGA
CTAAAGCAATAAATAATGGTTATTATAAACATGAATGGTTTTTGAATATGAAATATTTAG
AAGATCGATTAGAACAAAATGGAACTGGGTTTTTCGTTGGTGACAAATTAAGTGGAGCTG
ATGTTATTTTAAGTTTCCCAATCTATGAAAATGTTTTCGATAATCTTGAAGGAACTAAAG
AAATATTGGGTGATAAAGTCAATATTAAAAAAATGTTCCCCAATTTATTTAATTGGAGTC
GAATGATTAAAAATAATTTAAGTTATAAAAAAATTACTGAATTAATGAATGAAGAAGTTG
AAGATTTGATTGCATTGAATCCTCGATTTGATTATGGCAGAGAAAAATAAAGTCAAACCT
CTGCTTATGTTATACCCCCCCCTCTCATGATTGTCTTTTATATTTGTATTAGTAATGTTT
TTAATAAATGAAATTTATTACAACCACTTTATCTATGTAGATGTCTTATTTCCTCTTGTT
GGTGTCCACAACTGTGTGAATTCTGCATTTATACACCTTACGAACGGAAAGAAAAAAGGA
TCCTCCAATTCAAAGATTGATTTCTCAATTGTGGCTGCAACTTAATTCATCACTTAACTG
TTATCAAACTTCACCTATTGTGGCACACTCTTAATTAATCTTGCATAATTATTTCCTTCT
CCTCCTCCCCCCCCTTATTTTTATTTGATTTGATTAATAAGCAAGAAAGAAAAGTCAGAA
TCGGTTTTATAAATATAGCTATCGTTCATCTTTGAAAAATTCTGACAACTATTTTATTTT
TTTTAATTCTCTTTTAACAACTTCAAATTAATCAAAAAAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -584 -631 -943
>C3_05640W_A	Upstream Sequence Complementary Strand
ATTCTATGATACTAACGGTTTTATAAAATATGGGACGGTTAGAACTAGTTGTTAACCTTC
AACTAATAATAAATGTAATAAGACTTCCCAGTAATGTTGTATATGTTTACCGTAATAATT
AATTAAGAAGTCGATTTGTATAACGGGGCAAACGGTGCTTTAGTCATCACTTTAATCACT
GATTTCGTTATTTATTACCAATAATATTTGTACTTACCAAAAACTTATACTTTATAAATC
TTCTAGCTAATCTTGTTTTACCTTGACCCAAAAAGCAACCACTGTTTAATTCACCTCGAC
TACAATAAAATTCAAAGGGTTAGATACTTTTACAAAAGCTATTAGAACTTCCTTGATTTC
TTTATAACCCACTATTTCAGTTATAATTTTTTTACAAGGGGTTAAATAAATTAACCTCAG
CTTACTAATTTTTATTAAATTCAATATTTTTTTAATGACTTAATTACTTACTTCTTCAAC
TTCTAAACTAACGTAACTTAGGAGCTAAACTAATACCGTCTCTTTTTATTTCAGTTTGGA
GACGAATACAATATGGGGGGGGAGAGTACTAACAGAAAATATAAACATAATCATTACAAA
AATTATTTACTTTAAATAATGTTGGTGAAATAGATACATCTACAGAATAAAGGAGAACAA
CCACAGGTGTTGACACACTTAAGACGTAAATATGTGGAATGCTTGCCTTTCTTTTTTCCT
AGGAGGTTAAGTTTCTAACTAAAGAGTTAACACCGACGTTGAATTAAGTAGTGAATTGAC
AATAGTTTGAAGTGGATAACACCGTGTGAGAATTAATTAGAACGTATTAATAAAGGAAGA
GGAGGAGGGGGGGGAATAAAAATAAACTAAACTAATTATTCGTTCTTTCTTTTCAGTCTT
AGCCAAAATATTTATATCGATAGCAAGTAGAAACTTTTTAAGACTGTTGATAAAATAAAA
AAAATTAAGAGAAAATTGTTGAAGTTTAATTAGTTTTTTA
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